More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0093 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0093  response regulator receiver protein  100 
 
 		 143 aa  280  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2613  response regulator receiver protein  70 
 
 		 139 aa  160  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2334  response regulator receiver  70 
 
 		 139 aa  160  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0685092  normal  0.85818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2289  response regulator receiver protein  69.29 
 
 		 139 aa  156  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0861  response regulator receiver protein  70.18 
 
 		 135 aa  155  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0503153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1391  response regulator receiver protein  64.62 
 
 		 135 aa  140  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405222  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0906  response regulator receiver protein  44.86 
 
 		 125 aa  86.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.101181 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3549  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.98 
 
 		 702 aa  78.2  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2217  histidine kinase  43.9 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0256212 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1075  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 		 829 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.46099e-33 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3745  response regulator receiver domain-containing protein  35.9 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0143  response regulator receiver protein  43.24 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.363881  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4683  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3795  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 		 807 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  43.2 
 
 		 539 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  43.44 
 
 		 533 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1490  sensory box histidine kinase/response regulator  39.34 
 
 		 695 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135352  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  41.73 
 
 		 533 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.9 
 
 		 1328 aa  72.8  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282055  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  38.64 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0945  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.26 
 
 		 926 aa  72.4  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4524  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 589 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.2 
 
 		 589 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3336  histidine kinase  44.25 
 
 		 531 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1300  PAS  38.1 
 
 		 695 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.233563 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  37.27 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  46.3 
 
 		 544 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4539  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.866024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4170  response regulator receiver  42.11 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1727  response regulator receiver  35.9 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0248964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1127  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40 
 
 		 989 aa  70.5  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476664 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  38.32 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5650  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.64647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0513  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 		 803 aa  70.5  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.883754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.8 
 
 		 741 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 864 aa  68.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1889  ATPase domain-containing protein  37.86 
 
 		 280 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.35 
 
 		 743 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0880  histidine kinase  37.78 
 
 		 534 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1490  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 476 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0114  Signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 939 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.153209 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.67 
 
 		 589 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5111  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.67 
 
 		 589 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.67 
 
 		 588 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0474386 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.09 
 
 		 926 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0517  histidine kinase  38.4 
 
 		 726 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.978002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2840  nitrogen assimilation transcriptional regulator, NtrX  34.4 
 
 		 476 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1454  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 476 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.396257  normal  0.115169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7127  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.55 
 
 		 782 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.612446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 		 740 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 941 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  43.52 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2357  histidine kinase  40.71 
 
 		 533 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0826278 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4234  sensor histidine kinase  35.59 
 
 		 761 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  39.34 
 
 		 541 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  39.34 
 
 		 541 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3331  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3087  ATP-binding region, ATPase-like  38.46 
 
 		 847 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373882  normal  0.0754896 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4397  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 455 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.090562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.45 
 
 		 711 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  35.4 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 727 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903593 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.84 
 
 		 966 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01426  histidine kinase  38.05 
 
 		 507 aa  64.7  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643455  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  41.44 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4830  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.071515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7844  sensor histidine kinase  37.9 
 
 		 529 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6213  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.15 
 
 		 559 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2408  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 		 647 aa  64.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385618  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2240  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 465 aa  64.7  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.261318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  36.97 
 
 		 1065 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2444  histidine kinase  35.16 
 
 		 559 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.53 
 
 		 508 aa  64.3  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 1034 aa  63.9  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0936  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 803 aa  63.9  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 686 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2110  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0018  ATPase domain-containing protein  37.27 
 
 		 681 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.434302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0019  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 		 681 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.746553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  32.2 
 
 		 240 aa  63.5  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  32.14 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4108  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 1095 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3584  sensory box histidine kinase/response regulator  37.5 
 
 		 646 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1581  histidine kinase  38.71 
 
 		 541 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2810  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 		 998 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7425  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  37.8 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0404716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.54 
 
 		 858 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4732  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.53 
 
 		 728 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0638  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4846  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.27 
 
 		 701 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.110474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>