More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0861 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0861  response regulator receiver protein  100 
 
 		 135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0503153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1391  response regulator receiver protein  91.11 
 
 		 135 aa  220  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405222  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0093  response regulator receiver protein  70.18 
 
 		 143 aa  155  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2334  response regulator receiver  65.12 
 
 		 139 aa  148  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0685092  normal  0.85818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2613  response regulator receiver protein  65.12 
 
 		 139 aa  148  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2289  response regulator receiver protein  63.57 
 
 		 139 aa  143  9e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4683  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4539  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.866024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4170  response regulator receiver  42.11 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  35 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  44.55 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  43.12 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2320  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.632565 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0513  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 803 aa  72.8  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.883754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0906  response regulator receiver protein  41.82 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.101181 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0143  response regulator receiver protein  44.25 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.363881  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  42.34 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  45.87 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 140 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  38.94 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  38.26 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  35.34 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4814  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 127 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24379  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  38.89 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6265  sensor histidine kinase  37.27 
 
 		 490 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0824359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3549  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 		 702 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  39.22 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  28.69 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2217  histidine kinase  40.95 
 
 		 396 aa  66.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0256212 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0983  DNA-binding transcriptional regulator TorR  38.46 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.291581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4845  response regulator receiver  39.82 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3795  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 		 807 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3745  response regulator receiver domain-containing protein  34.78 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  35.96 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1990  DNA-binding transcriptional regulator TorR  33.61 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.697946  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4524  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.12 
 
 		 589 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1606  response regulator receiver protein  29.51 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2650  response regulator receiver domain-containing protein  41.57 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5391  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2428  response regulator receiver domain-containing protein  29.27 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1378  response regulator receiver domain-containing protein  34.43 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207936  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4331  response regulator receiver protein  39.45 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.095217 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  28.69 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  39.05 
 
 		 544 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  28.69 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3331  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  28.69 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0614  putative GAF sensor protein  40.17 
 
 		 622 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00376401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.9 
 
 		 589 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7844  sensor histidine kinase  37.27 
 
 		 529 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5313  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 		 810 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 741 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2569  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.929319 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  36.11 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  36.04 
 
 		 533 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  35.14 
 
 		 533 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  43.9 
 
 		 1036 aa  62.8  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  35.59 
 
 		 539 aa  62  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  31.37 
 
 		 1328 aa  62  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282055  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2716  response regulator  41.46 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59583  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2449  response regulator receiver  41.46 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000856797 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.25 
 
 		 650 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  28.81 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1727  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 		 793 aa  62  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.9 
 
 		 589 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5111  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.9 
 
 		 589 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 		 695 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  29.91 
 
 		 695 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.9 
 
 		 588 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0474386 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2479  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.591075  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0880  histidine kinase  33.9 
 
 		 534 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  41.58 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 		 653 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0873112  normal  0.0648404 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  39.6 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  38.05 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2252  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 		 732 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 		 1036 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2575  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0149684  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.61 
 
 		 508 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2108  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 1014 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.659699  normal  0.848073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0366  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 		 618 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1889  ATPase domain-containing protein  46.34 
 
 		 280 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 		 673 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 766 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 727 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>