More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4683 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4683  response regulator receiver protein  100 
 
 		 120 aa  241  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4170  response regulator receiver  93.28 
 
 		 120 aa  222  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4539  response regulator receiver protein  93.28 
 
 		 120 aa  222  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.866024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0143  response regulator receiver protein  51.33 
 
 		 130 aa  110  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.363881  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 		 743 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3745  response regulator receiver domain-containing protein  40.83 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2682  response regulator receiver protein  52.63 
 
 		 125 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238698  normal  0.609877 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1727  response regulator receiver  36.67 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0248964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0861  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0503153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 943 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  34.48 
 
 		 949 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0366  GAF sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 618 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 949 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4845  response regulator receiver  36.22 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0093  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  41.75 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2444  histidine kinase  42.86 
 
 		 559 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5391  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5313  response regulator receiver protein  35.43 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7425  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  38.68 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0404716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4331  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.095217 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4830  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.071515 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4235  sensor histidine kinase  35.24 
 
 		 754 aa  70.1  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507157  normal  0.848747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1391  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405222  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  36.52 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2569  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.929319 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  37.61 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3607  response regulator receiver protein  36.61 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621989  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2506  histidine kinase  35.59 
 
 		 538 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.971833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6265  sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 490 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0824359  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2716  response regulator  35.29 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59583  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2449  response regulator receiver  35.29 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000856797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3429  histidine kinase  43.53 
 
 		 538 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  34.26 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7844  sensor histidine kinase  35.24 
 
 		 529 aa  67  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3375  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 714 aa  67  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1444  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 459 aa  66.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2333  histidine kinase  42.35 
 
 		 538 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3795  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.81 
 
 		 807 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3963  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.150847 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 		 662 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 1036 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 		 936 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4524  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 		 589 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2650  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3015  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.35 
 
 		 762 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3969  response regulator  32.17 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3269  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 704 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  34.58 
 
 		 695 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 689 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.800994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 		 695 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2717  sensory box histidine kinase/response regulator  33.62 
 
 		 676 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.230475  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 		 589 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  38.82 
 
 		 646 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 		 926 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2006  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3757  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 966 aa  63.9  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3584  sensory box histidine kinase/response regulator  37.65 
 
 		 646 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0024  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 		 734 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.53 
 
 		 962 aa  63.5  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.7 
 
 		 1124 aa  63.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 		 1651 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1727  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 		 793 aa  63.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 789 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.94 
 
 		 732 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4234  sensor histidine kinase  29.91 
 
 		 761 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1031  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 		 689 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 588 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0474386 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0864  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632773 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  42.17 
 
 		 1065 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6445  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.96 
 
 		 830 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0224728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0279  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118022 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.08 
 
 		 497 aa  62.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 		 1076 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 589 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5111  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 589 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1910  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 994 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2110  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  30.36 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.68 
 
 		 741 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0123  PAS sensor protein  39.76 
 
 		 692 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4732  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.7 
 
 		 728 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.55 
 
 		 573 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 927 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5380  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.55 
 
 		 890 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.622794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0542  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 1050 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.757487  normal  0.763027 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0458  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  37.93 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0880  histidine kinase  34.78 
 
 		 534 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2146  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.41399  hitchhiker  0.000968824 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.96 
 
 		 957 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>