More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3607 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3607  response regulator receiver protein  100 
 
 		 135 aa  263  5.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621989  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3963  response regulator receiver protein  89.15 
 
 		 133 aa  229  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.150847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0810  response regulator receiver protein  64 
 
 		 132 aa  170  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.316292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0851  response regulator receiver  64 
 
 		 132 aa  170  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234035 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0864  response regulator receiver protein  62.99 
 
 		 129 aa  169  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632773 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0775  response regulator receiver protein  63.2 
 
 		 132 aa  166  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0313977 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 128 aa  100  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  41.8 
 
 		 128 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 128 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 128 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 140 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  48.04 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  42.73 
 
 		 126 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  35.66 
 
 		 135 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  44.34 
 
 		 126 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  42.24 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  40 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2499  response regulator receiver protein  40 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.353166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  40 
 
 		 126 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  39.25 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3969  response regulator  36.11 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  34.55 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2650  response regulator receiver domain-containing protein  45.24 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2732  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2716  response regulator  43.9 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59583  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4170  response regulator receiver  37.84 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4539  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.866024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  31.58 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5396  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5790  response regulator receiver protein  32.71 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889979  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2449  response regulator receiver  41.46 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000856797 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  36.67 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2989  response regulator receiver protein  34.29 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  32.76 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  36.89 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  34.55 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0144  hypothetical protein  39.29 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4683  response regulator receiver protein  36.61 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409248  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3757  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2006  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3551  response regulator receiver protein  34.95 
 
 		 143 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0862504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  36.21 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2110  response regulator receiver protein  43.21 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0143  response regulator receiver protein  39.6 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.363881  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  33.98 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2146  response regulator receiver protein  43.21 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.41399  hitchhiker  0.000968824 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0771  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  34.55 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1882  response regulator receiver  38.3 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  36.27 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2320  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.632565 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1870  sensory box histidine kinase/response regulator  38.55 
 
 		 691 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3529  response regulator receiver domain-containing protein  29.84 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5605  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2488  response regulator receiver protein  39.45 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365206  normal  0.13004 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3532  PAS  38.55 
 
 		 691 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.804686  normal  0.0772354 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.54 
 
 		 689 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.800994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2780  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 		 943 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 732 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 		 1164 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1329  PAS sensor protein  32.14 
 
 		 1164 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.488954 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0024  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 734 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2510  response regulator receiver  30.36 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.23 
 
 		 926 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.75 
 
 		 696 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6212  response regulator receiver protein  38.53 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392664  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2557  response regulator receiver  37.72 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4830  response regulator receiver protein  34.88 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.071515 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  37.27 
 
 		 1036 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4814  response regulator receiver protein  28.33 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24379  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 673 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.48 
 
 		 497 aa  58.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  34 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4524  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 		 589 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2217  histidine kinase  35.29 
 
 		 396 aa  58.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0256212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.96 
 
 		 686 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 		 789 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 		 789 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4367  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.711428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0861  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0503153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2794  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1041  sensory box histidine kinase/response regulator  31.4 
 
 		 611 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0675  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.410105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  34.85 
 
 		 1427 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>