More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0864 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0864  response regulator receiver protein  100 
 
 		 129 aa  258  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632773 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0775  response regulator receiver protein  82.81 
 
 		 132 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0313977 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0810  response regulator receiver protein  82.03 
 
 		 132 aa  209  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.316292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0851  response regulator receiver  82.03 
 
 		 132 aa  209  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234035 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3607  response regulator receiver protein  62.99 
 
 		 135 aa  169  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621989  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3963  response regulator receiver protein  62.2 
 
 		 133 aa  167  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.150847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  43.64 
 
 		 128 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  42.73 
 
 		 128 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  42.73 
 
 		 128 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3969  response regulator  37.93 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 140 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  38.39 
 
 		 126 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  42.45 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  39.25 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  40.38 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 135 aa  84  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2499  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.353166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  34.45 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  36.54 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  33.88 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2989  response regulator receiver protein  32.38 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5396  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 132 aa  73.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  36.75 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  31.86 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2732  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  31.25 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  29.31 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  31.9 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2716  response regulator  33.33 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59583  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  32.17 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5605  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 943 aa  67.8  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0144  hypothetical protein  36.05 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 127 aa  67  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5790  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889979  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2488  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365206  normal  0.13004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3778  response regulator receiver  37.4 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0998176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4072  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2780  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2449  response regulator receiver  30.77 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000856797 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2557  response regulator receiver  36.21 
 
 		 194 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1503  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156189  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2794  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  30.84 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5535  response regulator receiver protein  39.64 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591914  decreased coverage  0.00892468 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4683  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 120 aa  62  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0771  response regulator receiver protein  28.45 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2650  response regulator receiver domain-containing protein  30.25 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2510  response regulator receiver  28.7 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4170  response regulator receiver  30.17 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4539  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.866024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0675  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.410105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3529  response regulator receiver domain-containing protein  32.11 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  31.48 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4367  response regulator receiver protein  32.38 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.711428 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  28.33 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  29.09 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  34.68 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  34.68 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3757  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2071  response regulator receiver protein  32.32 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 		 927 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2006  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5228  response regulator receiver protein  28.44 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0214459  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3087  ATP-binding region, ATPase-like  41.46 
 
 		 847 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373882  normal  0.0754896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3551  response regulator receiver protein  29.52 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0862504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1882  response regulator receiver  37.65 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0314  response regulator receiver protein  27.42 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1517  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394491  normal  0.160821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6764  putative two-component response regulator  32.43 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4034  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4830  response regulator receiver protein  28.21 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.071515 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2645  response regulator receiver domain-containing protein  34.48 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5929  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 		 1164 aa  57  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2146  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.41399  hitchhiker  0.000968824 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 		 921 aa  57  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1329  PAS sensor protein  34.71 
 
 		 1164 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.488954 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1300  PAS  39.33 
 
 		 695 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.233563 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6214  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 772 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.459564 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 		 807 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2320  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.632565 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1490  sensory box histidine kinase/response regulator  38.2 
 
 		 695 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135352  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1028  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 		 870 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.636365 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2110  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0290  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 		 758 aa  55.5  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.312795 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>