More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0851 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0810  response regulator receiver protein  100 
 
 		 132 aa  264  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.316292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0851  response regulator receiver  100 
 
 		 132 aa  264  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234035 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0775  response regulator receiver protein  95.45 
 
 		 132 aa  255  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0313977 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0864  response regulator receiver protein  82.03 
 
 		 129 aa  209  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3607  response regulator receiver protein  64 
 
 		 135 aa  170  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621989  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3963  response regulator receiver protein  64 
 
 		 133 aa  169  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.150847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 128 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 128 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  42.15 
 
 		 128 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3969  response regulator  34.19 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2499  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 136 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.353166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  37.39 
 
 		 126 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 135 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 130 aa  87  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 122 aa  84.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  34.71 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  39.05 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  36.79 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5396  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  34.48 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  32.14 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2989  response regulator receiver protein  31.43 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  34.95 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  30.17 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5605  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 198 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  35.29 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2732  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  32.74 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  33.96 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2488  response regulator receiver protein  39.2 
 
 		 173 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365206  normal  0.13004 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5790  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889979  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2716  response regulator  32.23 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59583  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2650  response regulator receiver domain-containing protein  38.27 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  34.13 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2780  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2557  response regulator receiver  37.84 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0144  hypothetical protein  34.83 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2449  response regulator receiver  39.51 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000856797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3551  response regulator receiver protein  33.01 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0862504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4367  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.711428 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6214  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 772 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.459564 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  29.51 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  31.25 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 589 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3087  ATP-binding region, ATPase-like  34.19 
 
 		 847 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373882  normal  0.0754896 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  34.55 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5535  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591914  decreased coverage  0.00892468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6764  putative two-component response regulator  37.5 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252754  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3757  response regulator receiver protein  38.27 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4539  response regulator receiver protein  32.29 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.866024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4170  response regulator receiver  32.29 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0771  response regulator receiver protein  28.45 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2006  response regulator receiver protein  38.27 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5228  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0214459  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4524  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 589 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2510  response regulator receiver  29.57 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2110  response regulator receiver protein  35.35 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 		 858 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2146  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.41399  hitchhiker  0.000968824 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4630  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 		 845 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01573  response regulator  32.65 
 
 		 109 aa  60.1  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.877013  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 573 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  28.18 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 943 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4683  response regulator receiver protein  30.48 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2320  response regulator receiver protein  31.37 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.632565 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2794  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3529  response regulator receiver domain-containing protein  31.07 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1882  response regulator receiver  38.82 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0123  PAS sensor protein  29.91 
 
 		 692 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 		 589 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5111  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 		 589 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 		 588 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0474386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7425  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  33.01 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0404716 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3532  PAS  29.27 
 
 		 691 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.804686  normal  0.0772354 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 921 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0906  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.101181 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4814  response regulator receiver protein  28.1 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24379  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3015  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 762 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 632 aa  58.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177294  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0752  ATPase domain-containing protein  29.91 
 
 		 537 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 		 1381 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0290  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 		 758 aa  58.2  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.312795 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>