More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5645 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  100 
 
 		 182 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  48.62 
 
 		 124 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  54.55 
 
 		 122 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  49.07 
 
 		 124 aa  104  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  46.43 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  50.51 
 
 		 122 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  47.75 
 
 		 124 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  47.79 
 
 		 124 aa  101  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  44.74 
 
 		 126 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  47 
 
 		 127 aa  94.7  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  45.79 
 
 		 126 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  42.61 
 
 		 130 aa  93.2  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0771  response regulator receiver protein  43.24 
 
 		 130 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  45.9 
 
 		 128 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  45.9 
 
 		 128 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  40 
 
 		 130 aa  92  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  42.06 
 
 		 147 aa  91.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  45.1 
 
 		 127 aa  90.1  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  44.86 
 
 		 126 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 129 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 123 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  47.47 
 
 		 125 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  41.28 
 
 		 123 aa  89.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  42.73 
 
 		 124 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  42.99 
 
 		 125 aa  88.2  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 131 aa  86.7  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2510  response regulator receiver  40 
 
 		 124 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 134 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  32.46 
 
 		 134 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 696 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  32.8 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  33.04 
 
 		 695 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 695 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6937  response regulator receiver protein  47.19 
 
 		 133 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0671376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 		 936 aa  77  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5396  response regulator receiver protein  41.44 
 
 		 132 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5228  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 135 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0214459  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2664  hypothetical protein  56.92 
 
 		 79 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  35.88 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2499  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.353166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4788  histidine kinase  36.84 
 
 		 685 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3366  histidine kinase  36.84 
 
 		 580 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03164  hypothetical protein  37.07 
 
 		 469 aa  75.5  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6442  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 		 688 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 686 aa  74.7  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21073  normal  0.829403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.51 
 
 		 673 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5790  response regulator receiver protein  41.28 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889979  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 1036 aa  74.3  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  40.19 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5728  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 		 727 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2925  hypothetical protein  64.15 
 
 		 79 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3795  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 		 807 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002813  flagellar regulatory protein FleQ  35.34 
 
 		 469 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 		 807 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.74 
 
 		 508 aa  73.2  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3551  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0862504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6999  hypothetical protein  64.15 
 
 		 79 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  39.62 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  39.25 
 
 		 128 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  39.25 
 
 		 128 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2732  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1882  response regulator receiver  46.84 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 727 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903593 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1719  flagellar regulatory protein C  33.62 
 
 		 479 aa  70.9  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0473988  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 727 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.125923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2252  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 		 732 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.74 
 
 		 789 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5871  hypothetical protein  54.24 
 
 		 84 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 727 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6212  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392664  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  40 
 
 		 573 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01426  histidine kinase  39.09 
 
 		 507 aa  70.1  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643455  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5929  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  35.58 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5650  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.64647 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4524  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 		 589 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7844  sensor histidine kinase  36.28 
 
 		 529 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.65 
 
 		 926 aa  68.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 		 589 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 		 581 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2989  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.05 
 
 		 548 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  41.98 
 
 		 1328 aa  68.6  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282055  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0851  response regulator receiver  33.96 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234035 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1426 aa  68.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  37.17 
 
 		 1036 aa  68.6  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0810  response regulator receiver protein  33.96 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.316292 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2310  sigma-54 dependent response regulator  33.04 
 
 		 478 aa  68.6  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5841  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 887 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.111175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0775  response regulator receiver protein  33.02 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0313977 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 		 1631 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.48 
 
 		 689 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.800994 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4749  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 		 781 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.872225  normal  0.641352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 		 660 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7425  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  39.09 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0404716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>