183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4367 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4367  response regulator receiver protein  100 
 
 		 130 aa  249  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.711428 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4264  response regulator receiver protein  76.61 
 
 		 133 aa  167  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  0.471811 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3896  hypothetical protein  76.61 
 
 		 146 aa  166  9e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  39.22 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  39.22 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  39.22 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0775  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0313977 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  36.28 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0810  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.316292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0851  response regulator receiver  34.17 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234035 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5790  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889979  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  35.92 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2499  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.353166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5396  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  35.9 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  32.73 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0864  response regulator receiver protein  32.38 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632773 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3963  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.150847 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  34.29 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  32.77 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3607  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621989  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  33.98 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  34.95 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 135 aa  57  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  32.43 
 
 		 126 aa  57  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3551  response regulator receiver protein  33.03 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0862504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  32.74 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2510  response regulator receiver  33.91 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2989  response regulator receiver protein  31.68 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 548 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0771  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  31.9 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  30 
 
 		 573 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3969  response regulator  32.38 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3281  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 680 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  36.11 
 
 		 571 aa  50.8  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  32.65 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0036  histidine kinase  33.01 
 
 		 556 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.526737  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 676 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1882  response regulator receiver  32.94 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.38 
 
 		 732 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  35.85 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  31.63 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  29.31 
 
 		 182 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 		 1106 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  32.32 
 
 		 126 aa  48.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 1067 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2320  response regulator receiver protein  29.51 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.632565 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 		 1164 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1329  PAS sensor protein  35.24 
 
 		 1164 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.488954 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2110  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6937  response regulator receiver protein  30.85 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0671376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2146  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.41399  hitchhiker  0.000968824 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3757  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2006  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  32.69 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0541  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 		 575 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 		 588 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0474386 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0429  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 		 955 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.82 
 
 		 1180 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4092  response regulator receiver protein  33.65 
 
 		 161 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 		 589 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4076  histidine kinase  30.89 
 
 		 416 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5111  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 		 589 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 		 889 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2295  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.95 
 
 		 237 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1804  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 469 aa  45.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358984  normal  0.379225 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1570  transcriptional regulator, XRE family  31.09 
 
 		 233 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0675  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.410105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0872  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 471 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650247 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0460  response regulator receiver protein  35.44 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.903697  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2650  response regulator receiver domain-containing protein  28.43 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0965  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.71 
 
 		 462 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5650  response regulator receiver protein  32.65 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.64647 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  33.02 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 		 588 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131409  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0271  winged helix family two component transcriptional regulator  39.24 
 
 		 239 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195642 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.31 
 
 		 926 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6787  CheA signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 790 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148112  normal  0.39723 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3459  two component LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 223 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.306063  normal  0.532773 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0522  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 223 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3170  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  33.33 
 
 		 227 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0287  two component transcriptional regulator  39.24 
 
 		 239 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0931  response regulator receiver protein  33 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2716  response regulator  31.91 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59583  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0906  response regulator receiver protein  31.37 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.101181 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.32 
 
 		 695 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002813  flagellar regulatory protein FleQ  34.31 
 
 		 469 aa  43.9  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1719  flagellar regulatory protein C  34.31 
 
 		 479 aa  43.5  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0473988  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  33.02 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>