92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3896 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3896  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  280  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4264  response regulator receiver protein  96.99 
 
 		 133 aa  243  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  0.471811 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4367  response regulator receiver protein  76.61 
 
 		 130 aa  166  9e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.711428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  39.81 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  36.97 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 128 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  35.25 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  36.13 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2499  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.353166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0775  response regulator receiver protein  34.86 
 
 		 132 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0313977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  34.78 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  32.23 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0810  response regulator receiver protein  33.03 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.316292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0851  response regulator receiver  33.03 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234035 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5790  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889979  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3963  response regulator receiver protein  35.58 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.150847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  38 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  34.95 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0864  response regulator receiver protein  32.08 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632773 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  36.45 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6182  hypothetical protein  37.5 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2510  response regulator receiver  32.77 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3607  response regulator receiver protein  33.65 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621989  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  35.58 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  35.78 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0771  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1882  response regulator receiver  34.48 
 
 		 108 aa  52  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  32.04 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0036  histidine kinase  33.61 
 
 		 556 aa  51.2  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.526737  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2989  response regulator receiver protein  32.04 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  33.56 
 
 		 1036 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4296  response regulator receiver  32.35 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  32.35 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  30.71 
 
 		 573 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 182 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  33.66 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  34 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4092  response regulator receiver protein  32.71 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3969  response regulator  31.36 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2121  response regulator receiver protein  26.17 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317416  normal  0.525904 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 		 1067 aa  47.8  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  32.38 
 
 		 123 aa  47.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 		 548 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4814  response regulator receiver protein  32.73 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24379  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.51 
 
 		 889 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  31.53 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.51 
 
 		 943 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  36.45 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  30.39 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  36.19 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  36.19 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 		 1631 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5396  response regulator receiver protein  34.29 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  30.39 
 
 		 122 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1684  histidine kinase  32.71 
 
 		 701 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5228  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0214459  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0945  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 926 aa  43.5  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 1036 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 810 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  34.55 
 
 		 571 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2794  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 		 766 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6937  response regulator receiver protein  31.87 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0671376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3551  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0862504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 1125 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 		 903 aa  41.6  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198382 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1627  response regulator receiver protein  32.1 
 
 		 119 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0091  response regulator receiver protein  31.43 
 
 		 124 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.589534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 1137 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2602  PAS sensor protein  33.85 
 
 		 903 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2295  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.73 
 
 		 237 aa  41.2  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2204  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 588 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0313534  normal  0.331001 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5728  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 		 727 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1651 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3542  response regulator receiver  30.4 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20091 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7425  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  33.65 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0404716 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2632  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.36 
 
 		 906 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0013  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.07 
 
 		 241 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.349161 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5596  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.82 
 
 		 235 aa  40  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3403  helix-turn-helix, Fis-type  32.89 
 
 		 494 aa  40  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>