51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6182 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6182  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  243  6e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  33.96 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  33.02 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3896  hypothetical protein  37.5 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  35.05 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  36.36 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  36 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  39.09 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  39.09 
 
 		 135 aa  52  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  32.38 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4264  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 133 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  0.471811 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  35.48 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5396  response regulator receiver protein  37.36 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2989  response regulator receiver protein  35.53 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  31.68 
 
 		 147 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 124 aa  47  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4296  response regulator receiver  33.33 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2499  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.353166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  34.95 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  37.96 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  29.7 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  30.69 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5228  response regulator receiver protein  36.25 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0214459  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  30.11 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  33.03 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3969  response regulator  30 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4814  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24379  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  26.73 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  28.71 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  31.46 
 
 		 182 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  33.66 
 
 		 127 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  34.23 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0504  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 443 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3615  two component transcriptional regulator  38.64 
 
 		 236 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5790  response regulator receiver protein  38.64 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889979  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2510  response regulator receiver  27.88 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0225  PAS  31.58 
 
 		 673 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4072  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3778  response regulator receiver  36.11 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0998176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  30.48 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5535  response regulator receiver protein  37.66 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591914  decreased coverage  0.00892468 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0144  hypothetical protein  36.78 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0537  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.74 
 
 		 446 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0533  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.74 
 
 		 443 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>