More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2732 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2732  response regulator receiver protein  100 
 
 		 151 aa  294  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  82.68 
 
 		 143 aa  206  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  81.1 
 
 		 141 aa  203  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  76.38 
 
 		 134 aa  197  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  76.38 
 
 		 134 aa  197  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  75.59 
 
 		 134 aa  193  8.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0073  response regulator receiver protein  51.24 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2557  response regulator receiver  46.22 
 
 		 194 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2780  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 173 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2488  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 173 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365206  normal  0.13004 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7092  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 196 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.08524  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5605  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 198 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6212  response regulator receiver protein  45.76 
 
 		 177 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392664  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0091  response regulator receiver protein  45.61 
 
 		 124 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.589534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  40.32 
 
 		 126 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  46.09 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 126 aa  92  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1503  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156189  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  39.47 
 
 		 126 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 130 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  41.98 
 
 		 128 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 124 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 127 aa  86.7  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5535  response regulator receiver protein  45.69 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591914  decreased coverage  0.00892468 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  41.28 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  43.81 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 123 aa  84  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  38.1 
 
 		 128 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 128 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 140 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  37.07 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  34.78 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  42.2 
 
 		 128 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  42.2 
 
 		 128 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  42.2 
 
 		 128 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0675  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.410105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3778  response regulator receiver  35.83 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0998176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3607  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621989  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4072  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 		 727 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.125923 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 		 727 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2427  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 707 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215124  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.3 
 
 		 727 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903593 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5228  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0214459  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  34.48 
 
 		 695 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2252  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 		 732 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0771  response regulator receiver protein  36.15 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  40.38 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3963  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.150847 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2794  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0775  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0313977 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0864  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632773 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 		 695 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6442  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 		 688 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5650  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.64647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3529  response regulator receiver domain-containing protein  34.21 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  37.27 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0810  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.316292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0144  hypothetical protein  41.57 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4814  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24379  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0851  response regulator receiver  35.96 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234035 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4034  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2499  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.353166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6764  putative two-component response regulator  35.45 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3269  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 		 704 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2510  response regulator receiver  38.53 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7425  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  38.6 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0404716 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2320  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.632565 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2569  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.929319 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2024  fused PAS sensor histidine kinase protein and response regulator  37.29 
 
 		 1005 aa  66.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00627468  normal  0.216163 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3969  response regulator  40 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1735  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3551  response regulator receiver protein  36.54 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0862504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5790  response regulator receiver protein  33.96 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889979  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2196  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 		 705 aa  65.1  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.908394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6937  response regulator receiver protein  37.89 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0671376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 		 946 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  34.58 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.58 
 
 		 807 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0143  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.363881  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5929  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1882  response regulator receiver  40.24 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.23 
 
 		 740 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4170  response regulator receiver  35.04 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 		 696 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4539  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.866024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2375  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.2 
 
 		 766 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.352057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 743 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01426  histidine kinase  32 
 
 		 507 aa  62  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>