More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1735 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1735  response regulator receiver protein  100 
 
 		 119 aa  240  5e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0880  histidine kinase  35.65 
 
 		 534 aa  77.8  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 		 743 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2956  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.11 
 
 		 650 aa  77  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  33.63 
 
 		 539 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6212  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392664  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  37.86 
 
 		 544 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  36.52 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  35.09 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 		 727 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 		 727 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.125923 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2148  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 655 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.440522  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  37.5 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  32.46 
 
 		 541 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  32.46 
 
 		 541 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2991  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2252  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.82 
 
 		 732 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3795  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 		 807 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  33.33 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 		 581 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  38.6 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5223  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.05 
 
 		 722 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 		 821 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.05 
 
 		 727 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1581  histidine kinase  32.46 
 
 		 541 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 926 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  33.91 
 
 		 533 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3336  histidine kinase  32.76 
 
 		 531 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3992  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.383415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  34.78 
 
 		 533 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 		 1011 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5650  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.64647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  37.61 
 
 		 812 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2108  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 		 1014 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.659699  normal  0.848073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3743  response regulator receiver protein  40 
 
 		 811 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  36.04 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 		 809 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 		 696 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3549  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 702 aa  67.4  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3110  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.568252  normal  0.771305 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2700  histidine kinase  35.63 
 
 		 534 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0483155  normal  0.0451896 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6442  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 		 688 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4235  sensor histidine kinase  31.3 
 
 		 754 aa  67  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507157  normal  0.848747 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4749  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 		 781 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.872225  normal  0.641352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 695 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  34.21 
 
 		 573 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  37 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  34.23 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2229  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 		 925 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.843602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  36.36 
 
 		 695 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 		 857 aa  66.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2896  sensory box histidine kinase/response regulator  34.48 
 
 		 534 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.287234  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2732  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  31.53 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7844  sensor histidine kinase  31.3 
 
 		 529 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0651  response regulator receiver protein  45.24 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0855  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 		 776 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0630  response regulator receiver protein  41.35 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7425  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  35.45 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0404716 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  32.76 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 		 1415 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 		 899 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1835  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 		 782 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.83 
 
 		 1076 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5284  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 		 717 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2507  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7092  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 196 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.08524  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0232  sensor histidine kinase  35.71 
 
 		 716 aa  63.9  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  35.96 
 
 		 571 aa  63.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1330  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 		 717 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298171 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  34.51 
 
 		 1427 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1335  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.51819  normal  0.0884587 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2106  Signal transduction histidine kinase nitrogen specific-like protein  32.79 
 
 		 635 aa  63.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5841  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.23 
 
 		 887 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.111175 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 548 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 556 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.12815  normal  0.758765 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4260  sensor histidine kinase/response regulator  32.73 
 
 		 669 aa  62  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.52 
 
 		 903 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198382 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5217  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0686971  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 		 1067 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3269  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 704 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 		 662 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5952  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0493294  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5234  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 		 946 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4603  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 		 783 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  33.33 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2602  PAS sensor protein  40.52 
 
 		 903 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1226  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915128  normal  0.471544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 		 1076 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.715458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>