More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0143 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0143  response regulator receiver protein  100 
 
 
130 aa  252  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.363881  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2682  response regulator receiver protein  74.59 
 
 
125 aa  138  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238698  normal  0.609877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4170  response regulator receiver  53.1 
 
 
120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4539  response regulator receiver protein  53.1 
 
 
120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.866024  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4683  response regulator receiver protein  51.33 
 
 
120 aa  110  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409248  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.14 
 
 
1076 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7844  sensor histidine kinase  42.59 
 
 
529 aa  88.2  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.12 
 
 
1105 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0545  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.34 
 
 
1053 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0920041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0878  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.22 
 
 
754 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307069  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.71 
 
 
686 aa  84.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.71 
 
 
999 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0366  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 
618 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425505  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.81 
 
 
743 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.86 
 
 
1381 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.8 
 
 
1089 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.44 
 
 
789 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3208  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.35 
 
 
622 aa  82  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0750823 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3791  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.52 
 
 
492 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.107728 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5380  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.48 
 
 
890 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.622794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1730  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.81 
 
 
1103 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.747769  normal  0.0625523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1455  PAS sensor protein  43.81 
 
 
1092 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534076  normal  0.193101 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.93 
 
 
977 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.416631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.28 
 
 
695 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02065  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  44.76 
 
 
1086 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4108  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
1095 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6183  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.81 
 
 
916 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.24256 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.76 
 
 
1092 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4235  sensor histidine kinase  35.94 
 
 
754 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507157  normal  0.848747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.93 
 
 
936 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6265  sensor histidine kinase  42.86 
 
 
490 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0824359  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.9 
 
 
858 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.81 
 
 
1086 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4234  sensor histidine kinase  38.89 
 
 
761 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0035  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.55 
 
 
921 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233169  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6445  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.81 
 
 
830 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0224728  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1778  PAS  38.6 
 
 
956 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.584017  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3087  ATP-binding region, ATPase-like  44.76 
 
 
847 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373882  normal  0.0754896 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6214  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.98 
 
 
772 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.459564 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0098  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
1050 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3696  sensory box histidine kinase/response regulator  40 
 
 
827 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.652711  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.98 
 
 
957 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 
926 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1300  PAS  40.35 
 
 
695 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.233563 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4331  response regulator receiver protein  40.54 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.095217 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5535  response regulator receiver protein  44 
 
 
130 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591914  decreased coverage  0.00892468 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1490  sensory box histidine kinase/response regulator  38.84 
 
 
695 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135352  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0123  PAS sensor protein  40.17 
 
 
692 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 
573 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0542  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.45 
 
 
1050 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.757487  normal  0.763027 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.76 
 
 
941 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5391  response regulator receiver protein  42.45 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3584  sensory box histidine kinase/response regulator  40.18 
 
 
646 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  41.07 
 
 
646 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2650  response regulator receiver domain-containing protein  49.38 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2810  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 
998 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  35.34 
 
 
949 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  38.14 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  40.91 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  37.5 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4845  response regulator receiver  39.25 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 
949 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7425  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  39.34 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0404716 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0752  ATPase domain-containing protein  38.46 
 
 
537 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0114  Signal transduction histidine kinase  43.69 
 
 
939 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.153209 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.74 
 
 
1067 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4630  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.52 
 
 
845 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0093  response regulator receiver protein  43.24 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  40.71 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  38.05 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5313  response regulator receiver protein  40.35 
 
 
132 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4732  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.24 
 
 
728 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 
943 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2716  response regulator  50 
 
 
125 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59583  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1830  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.52 
 
 
1165 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1835  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.05 
 
 
782 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.61 
 
 
1215 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3532  PAS  40.95 
 
 
691 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.804686  normal  0.0772354 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.1 
 
 
589 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153925  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  41.9 
 
 
1065 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1870  sensory box histidine kinase/response regulator  40 
 
 
691 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3015  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.52 
 
 
762 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.45 
 
 
807 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1684  histidine kinase  37.9 
 
 
701 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  38.98 
 
 
539 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 
812 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0719  response regulator receiver protein  39.29 
 
 
120 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.321681  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2449  response regulator receiver  48.81 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000856797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0861  response regulator receiver protein  44.25 
 
 
135 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0503153  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  41.28 
 
 
127 aa  72  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 
789 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 
789 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 
1651 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 
589 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4524  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.1 
 
 
589 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5111  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 
589 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 
588 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0474386 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 
1646 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3745  response regulator receiver domain-containing protein  40.8 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368149  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 
966 aa  71.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.691252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>