More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0719 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0719  response regulator receiver protein  100 
 
 		 120 aa  239  9e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.321681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3312  response regulator receiver protein  70 
 
 		 120 aa  173  6e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0106199 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0143  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.363881  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 946 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 		 743 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5407  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.18 
 
 		 815 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  38.53 
 
 		 812 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3015  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.18 
 
 		 762 aa  62.8  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7844  sensor histidine kinase  37.27 
 
 		 529 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1300  PAS  36.44 
 
 		 695 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.233563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 1076 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1490  sensory box histidine kinase/response regulator  37.29 
 
 		 695 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135352  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  36.61 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  34.15 
 
 		 949 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 949 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1835  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 782 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2970  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 584 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 1215 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  35.29 
 
 		 1065 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1889  ATPase domain-containing protein  36.67 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0093  response regulator receiver protein  40 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2711  response regulator  38.14 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0615637  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0517  histidine kinase  36.67 
 
 		 726 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.978002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4846  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 		 701 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.110474 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3795  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.09 
 
 		 807 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 1086 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  34.23 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 		 727 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.125923 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1830  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 		 1165 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  33.94 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 858 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 		 807 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0880  histidine kinase  33.33 
 
 		 534 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 		 727 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1581  histidine kinase  33.61 
 
 		 541 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 1065 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1778  PAS  33.05 
 
 		 956 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.584017  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  31.93 
 
 		 1086 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3208  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 		 622 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0750823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2148  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 655 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.440522  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 		 686 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 1651 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 741 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4749  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 781 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.872225  normal  0.641352 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 943 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  34.82 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 		 943 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 		 1092 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 740 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2333  histidine kinase  33.33 
 
 		 538 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1036 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3584  sensory box histidine kinase/response regulator  30.58 
 
 		 646 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4630  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 		 845 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2444  response regulator receiver  36.13 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.986911  decreased coverage  0.00021442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1684  histidine kinase  32.46 
 
 		 701 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 		 789 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0366  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 		 618 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 		 789 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 		 789 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3791  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 		 492 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.107728 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  32.23 
 
 		 539 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  29.41 
 
 		 646 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3549  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 		 702 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3087  ATP-binding region, ATPase-like  33.05 
 
 		 847 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373882  normal  0.0754896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0092  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 742 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 		 727 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 		 814 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486726  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1089 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 1646 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2320  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.632565 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 		 814 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 		 785 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.955834 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6183  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 		 916 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.24256 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  31.93 
 
 		 573 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 		 1022 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 966 aa  54.3  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6778  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 905 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3757  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3696  sensory box histidine kinase/response regulator  31.09 
 
 		 827 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.652711  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2110  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2377  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 688 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2506  histidine kinase  34.19 
 
 		 538 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.971833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2006  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2146  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.41399  hitchhiker  0.000968824 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1131  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 		 826 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4076  histidine kinase  34.75 
 
 		 416 aa  53.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0097  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 		 720 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2105  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 116 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 		 809 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2108  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 		 1014 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.659699  normal  0.848073 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 766 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 		 957 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4170  response regulator receiver  39.42 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>