More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0279 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0279  response regulator receiver protein  100 
 
 		 131 aa  261  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4845  response regulator receiver  56.64 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5313  response regulator receiver protein  55.75 
 
 		 132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4331  response regulator receiver protein  52.42 
 
 		 134 aa  123  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.095217 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5391  response regulator receiver protein  52.63 
 
 		 137 aa  122  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0143  response regulator receiver protein  45.19 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.363881  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4170  response regulator receiver  35.4 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4539  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.866024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4683  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.64 
 
 		 660 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3335  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 		 942 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4732  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 		 728 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0861  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0503153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  36.07 
 
 		 733 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3596  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 		 926 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 		 508 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 		 600 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5586  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3362  PAS sensor protein  37.84 
 
 		 678 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 936 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 785 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.955834 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3529  response regulator receiver domain-containing protein  36.25 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 		 711 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7425  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  35.09 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0404716 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1872  sensor histidine kinase  33.86 
 
 		 936 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291512  normal  0.670925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5234  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 		 946 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  38.1 
 
 		 949 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 1415 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 949 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1176 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  41.98 
 
 		 527 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1889  ATPase domain-containing protein  41.98 
 
 		 280 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0693  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.46 
 
 		 229 aa  54.3  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 1180 aa  54.3  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.98 
 
 		 741 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.83 
 
 		 1102 aa  53.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7092  response regulator receiver protein  47.3 
 
 		 196 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.08524  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 837 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.51 
 
 		 740 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 		 773 aa  53.5  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4637  DNA-binding response regulator  31.25 
 
 		 222 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6212  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392664  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 588 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0474386 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 		 589 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5111  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 		 589 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.17 
 
 		 236 aa  52.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2427  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 		 707 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215124  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 		 809 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 		 1106 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5841  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 		 887 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.111175 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2378  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 		 551 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81922 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0137  sensory box histidine kinase/response regulator  34.45 
 
 		 611 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1300  PAS  33.33 
 
 		 695 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.233563 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1041  sensory box histidine kinase/response regulator  34.45 
 
 		 611 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5255  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.61 
 
 		 242 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2824  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.86 
 
 		 1018 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0209449 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0820  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.58 
 
 		 593 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4051  PAS sensor protein  33.33 
 
 		 783 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.688401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3343  histidine kinase  32.76 
 
 		 632 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4421  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 783 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 943 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0335  two component transcriptional regulator  32.43 
 
 		 222 aa  52  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000018466  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 		 588 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131409  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1307  sensory box histidine kinase/response regulator  34.45 
 
 		 611 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5356  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 377 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.940445 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 732 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2778  Signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 611 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2635  sensory box histidine kinase/response regulator  34.45 
 
 		 611 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0508  histidine kinase  32.76 
 
 		 632 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6214  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 772 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.459564 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0849  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.58 
 
 		 593 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.386146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 		 944 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  33.9 
 
 		 229 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1830  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 		 1165 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0024  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 734 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2235  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0036  histidine kinase  35.45 
 
 		 556 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.526737  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 		 743 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05570  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  36.29 
 
 		 233 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 		 766 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1530  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.754323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 		 703 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5535  response regulator receiver protein  37.86 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591914  decreased coverage  0.00892468 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  33.63 
 
 		 1427 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4524  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 589 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2444  histidine kinase  33.03 
 
 		 559 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.53 
 
 		 1954 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3365  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.648544 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  33.33 
 
 		 252 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 589 aa  50.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 1076 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3011  two component transcriptional regulator  30.91 
 
 		 222 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239282  normal  0.458357 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1391  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 135 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405222  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  34.92 
 
 		 406 aa  50.8  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0168  response regulator receiver protein  37.89 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1939  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 		 691 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0201512 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0163  sensory box histidine kinase/response regulator  33.61 
 
 		 611 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>