More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3331 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3331  response regulator receiver protein  100 
 
 		 124 aa  248  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0906  response regulator receiver protein  55 
 
 		 125 aa  134  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.101181 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3745  response regulator receiver domain-containing protein  37.17 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1727  response regulator receiver  34.17 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0248964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4830  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.071515 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 662 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0093  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2217  histidine kinase  38.68 
 
 		 396 aa  65.1  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0256212 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.53 
 
 		 364 aa  64.3  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  35.78 
 
 		 533 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  33.33 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1226  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915128  normal  0.471544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  34.86 
 
 		 533 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0861  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0503153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  35.9 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2105  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4799  hypothetical protein  34.82 
 
 		 867 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2334  response regulator receiver  41.12 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0685092  normal  0.85818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2613  response regulator receiver protein  41.12 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4683  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0616  two component transcriptional regulator  34.26 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1456  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.78 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  34.95 
 
 		 544 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  29.2 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  29.2 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0864  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632773 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2581  sigma-54 dependent transcriptional regulator  32.23 
 
 		 456 aa  58.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0123  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  35.78 
 
 		 482 aa  58.2  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.26388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2289  response regulator receiver protein  40.19 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1911  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 		 787 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0413731  normal  0.503462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3963  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.150847 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3607  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621989  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2444  histidine kinase  32.74 
 
 		 559 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 		 1164 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.26 
 
 		 239 aa  57.8  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0260801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3336  histidine kinase  33.94 
 
 		 531 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3979  histidine kinase  30.89 
 
 		 778 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.405731  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48160  putative sensor/response regulator hybrid  34.21 
 
 		 858 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2947  response regulator receiver protein  38.27 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.386371  normal  0.0170157 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1329  PAS sensor protein  35.09 
 
 		 1164 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.488954 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  35.58 
 
 		 539 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02891  flagellar regulatory protein C  29.84 
 
 		 445 aa  57.4  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 		 943 aa  57.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1777  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.08 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0722021  normal  0.591414 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1385  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 695 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 1079 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5728  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 		 727 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 		 920 aa  56.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 		 1106 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0878  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 		 754 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3612  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  30 
 
 		 796 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463414  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4539  response regulator receiver protein  35.58 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.866024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  29.31 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4170  response regulator receiver  35.58 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1662  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 809 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 		 743 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  31.03 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1530  response regulator receiver protein  33.6 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.754323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0165  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 		 826 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01426  histidine kinase  31.07 
 
 		 507 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643455  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1939  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 		 691 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0201512 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1300  PAS  36.7 
 
 		 695 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.233563 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2043  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.55 
 
 		 691 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3549  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 		 702 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  31.67 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5761  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 		 708 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  33.96 
 
 		 785 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4655  response regulator receiver protein  38.82 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.230035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 		 846 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000921222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  35.92 
 
 		 1065 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 		 1036 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1782  sensor histidine kinase/response regulator  30.33 
 
 		 783 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  29.31 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.54 
 
 		 1132 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0388  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 		 793 aa  55.1  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0628  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.31 
 
 		 446 aa  54.7  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3762  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.198596 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1490  sensory box histidine kinase/response regulator  36.7 
 
 		 695 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135352  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2506  histidine kinase  34.95 
 
 		 538 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.971833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  26.09 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1541  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4732  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.65 
 
 		 728 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0447  two component transcriptional regulator  34.51 
 
 		 229 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000245325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1041  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.63 
 
 		 1121 aa  53.9  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.700011  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  36.79 
 
 		 749 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6268  two component transcriptional regulator  39.05 
 
 		 239 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.482642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>