16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9094 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7045  transposase  99.94 
 
 		 1659 bp  3275    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9094    100 
 
 		 1660 bp  3291    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.288319  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0688  transposase  99.94 
 
 		 1659 bp  3275    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3407  transposase  99.94 
 
 		 1659 bp  3275    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6190    80.42 
 
 		 827 bp  194  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1584  hypothetical protein  82.21 
 
 		 1086 bp  186  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.747581 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3797    80.5 
 
 		 447 bp  87.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.182164  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2254  transposase IS66  82.86 
 
 		 1617 bp  87.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505913  normal  0.0115325 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1585  transposase  91.38 
 
 		 681 bp  75.8  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7754  transposase  83.95 
 
 		 1623 bp  58  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109481 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5388  transposase IS66  86.89 
 
 		 1689 bp  58  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5015  transposase IS66  80 
 
 		 1650 bp  56  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4904    84.72 
 
 		 2921 bp  56  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4905  transposase IS66  84.72 
 
 		 1656 bp  56  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4978  IS66 family insertion sequence transposase protein  82.02 
 
 		 1650 bp  50.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4817  transposase IS66  79.84 
 
 		 1602 bp  50.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.171914 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>