More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0688 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4905  transposase IS66  63.73 
 
 		 551 aa  657    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3407  transposase  100 
 
 		 552 aa  1131    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0688  transposase  100 
 
 		 552 aa  1131    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5015  transposase IS66  62.24 
 
 		 549 aa  651    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2254  transposase IS66  61.75 
 
 		 538 aa  652    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505913  normal  0.0115325 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7045  transposase  100 
 
 		 552 aa  1131    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4978  IS66 family insertion sequence transposase protein  55.58 
 
 		 549 aa  611  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4397  transposase IS66  57.68 
 
 		 537 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3700  hypothetical protein  57.62 
 
 		 524 aa  598  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.751956 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5388  transposase IS66  58.14 
 
 		 562 aa  591  1e-167  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4817  transposase IS66  57.96 
 
 		 533 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.171914 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0784  transposase IS66  59.33 
 
 		 553 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7754  transposase  56.99 
 
 		 540 aa  543  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6726  transposase  51.39 
 
 		 556 aa  527  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0609  transposase  48.79 
 
 		 527 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4984  transposase  53.7 
 
 		 535 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6361  transposase  48.79 
 
 		 527 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1584  hypothetical protein  75.89 
 
 		 361 aa  481  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.747581 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0399  transposase IS66  52.97 
 
 		 461 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.402856  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  41.45 
 
 		 520 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2728  transposase IS66  42.29 
 
 		 545 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0274249  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0711  transposase IS66  42.13 
 
 		 545 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0898  transposase IS66  42.29 
 
 		 545 aa  369  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.888311  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4788  transposase IS66  42.29 
 
 		 545 aa  369  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0728  transposase IS66  42.91 
 
 		 540 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  40.82 
 
 		 531 aa  364  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  41.73 
 
 		 516 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  43.65 
 
 		 508 aa  362  1e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6513  transposase IS66  37.4 
 
 		 521 aa  362  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0611457 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0259  transposase  41.07 
 
 		 522 aa  361  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0154331 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6486  transposase IS66  37.65 
 
 		 522 aa  360  4e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212807  normal  0.436333 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0228  IS66 family element, transposase  40.49 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1653  IS66 family element, transposase  40.49 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0193  IS66 family element, transposase  40.49 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0712  IS66 family element, transposase  40.49 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0510  IS66 family element, transposase  40.49 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2711  IS66 family element, transposase  40.49 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.292603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2964  IS66 family element, transposase  40.49 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3708  IS66 family element, transposase  40.49 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00019301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2618  IS66 family element, transposase  40.49 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0707  IS66 family element, transposase  40.49 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2636  IS66 family element, transposase  40.49 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0147268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2413  IS66 family element, transposase  40.49 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2364  IS66 family element, transposase  40.49 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  40.49 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1117  IS66 family element, transposase  40.49 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  40.49 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  40.49 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1523  IS66 family element, transposase  40.49 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  40.49 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4625  IS66 family element, transposase  40.49 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3413  IS66 family element, transposase  40.49 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1584  IS66 family element, transposase  40.49 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  40.49 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2601  IS66 family element, transposase  40.49 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2109  IS66 family element, transposase  40.49 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4197  IS66 family element, transposase  40.49 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1866  IS66 family element, transposase  40.49 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.324382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2947  IS66 family element, transposase  40.49 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3096  IS66 family element, transposase  40.49 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.147891  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3675  IS66 family element, transposase  40.49 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3448  IS66 family element, transposase  40.49 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0017  IS66 family element, transposase  40.49 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4660  IS66 family element, transposase  40.49 
 
 		 512 aa  354  2e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4652  IS66 family element, transposase  40.3 
 
 		 512 aa  352  7e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0146  IS66 family element, transposase  40.3 
 
 		 512 aa  352  7e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  41.97 
 
 		 491 aa  349  7e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  40.82 
 
 		 523 aa  348  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  40.82 
 
 		 523 aa  348  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  40.82 
 
 		 523 aa  348  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  40.82 
 
 		 523 aa  348  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  40.82 
 
 		 523 aa  348  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1308  IS66 family element, transposase  39.02 
 
 		 512 aa  348  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.796856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2224  IS66 family element, transposase  39.02 
 
 		 512 aa  348  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101822  hitchhiker  0.0000000000417229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1183  IS66 family element, transposase  39.02 
 
 		 512 aa  348  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1812  IS66 family element, transposase  39.02 
 
 		 512 aa  348  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.438062  hitchhiker  0.000000148464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2841  IS66 family element, transposase  39.02 
 
 		 512 aa  348  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0678669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0344  IS66 family element, transposase  39.02 
 
 		 512 aa  348  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000788528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4292  IS66 family element, transposase  39.02 
 
 		 512 aa  348  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  40.82 
 
 		 523 aa  347  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5043  IS66 family element, transposase  39.02 
 
 		 512 aa  346  7e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1651  IS66 family element, transposase  38.83 
 
 		 512 aa  345  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0118  IS66 family element, transposase  38.83 
 
 		 512 aa  345  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.960295  normal  0.698521 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  40.45 
 
 		 523 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0068  transposase IS66  41.25 
 
 		 542 aa  343  5e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  41.43 
 
 		 532 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1757  IS66 family transposase  38.28 
 
 		 523 aa  339  8e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3368  IS66 family transposase  38.28 
 
 		 523 aa  339  8e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4879  IS66 family transposase  38.28 
 
 		 523 aa  339  8e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0047  IS66 family transposase  38.28 
 
 		 523 aa  339  8e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.637398  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0005  IS66 family transposase  38.28 
 
 		 523 aa  339  8e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0063  IS66 family transposase  38.28 
 
 		 523 aa  339  8e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.394688  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1407  IS66 family transposase  38.48 
 
 		 512 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0815  IS66 family transposase  38.48 
 
 		 512 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3343  IS66 family transposase  38.48 
 
 		 512 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1760  IS66 family transposase  38.48 
 
 		 512 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0839939  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3384  IS66 family transposase  38.48 
 
 		 512 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0038  IS66 family transposase  38.48 
 
 		 512 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0019  IS66 family transposase  38.48 
 
 		 512 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0068  IS66 family transposase  38.48 
 
 		 512 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>