More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6486 on replicon NC_009622
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009622  Smed_6486  transposase IS66  100 
 
 		 522 aa  1071    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212807  normal  0.436333 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6513  transposase IS66  100 
 
 		 521 aa  1015    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0611457 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  50 
 
 		 508 aa  456  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  46.6 
 
 		 520 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  47.74 
 
 		 516 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  47.5 
 
 		 532 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  48.41 
 
 		 523 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  48.41 
 
 		 523 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  48.41 
 
 		 523 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  48.41 
 
 		 523 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  48.41 
 
 		 523 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  48.41 
 
 		 523 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  48.41 
 
 		 523 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  45.93 
 
 		 531 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  46.2 
 
 		 491 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1812  IS66 family element, transposase  44.69 
 
 		 512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.438062  hitchhiker  0.000000148464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2224  IS66 family element, transposase  44.69 
 
 		 512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101822  hitchhiker  0.0000000000417229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0344  IS66 family element, transposase  44.69 
 
 		 512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000788528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1651  IS66 family element, transposase  44.69 
 
 		 512 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5043  IS66 family element, transposase  44.69 
 
 		 512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1308  IS66 family element, transposase  44.69 
 
 		 512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.796856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2841  IS66 family element, transposase  44.69 
 
 		 512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0678669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4292  IS66 family element, transposase  44.69 
 
 		 512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0118  IS66 family element, transposase  44.69 
 
 		 512 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.960295  normal  0.698521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6726  transposase  41.95 
 
 		 556 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1183  IS66 family element, transposase  44.69 
 
 		 512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0228  IS66 family element, transposase  44.25 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0017  IS66 family element, transposase  44.25 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4197  IS66 family element, transposase  44.25 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0038  IS66 family transposase  44.69 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2711  IS66 family element, transposase  44.25 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.292603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2636  IS66 family element, transposase  44.25 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0147268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2947  IS66 family element, transposase  44.25 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0259  transposase  43.83 
 
 		 522 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0154331 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3675  IS66 family element, transposase  44.25 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3708  IS66 family element, transposase  44.25 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00019301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1584  IS66 family element, transposase  44.25 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2413  IS66 family element, transposase  44.25 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1653  IS66 family element, transposase  44.25 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0019  IS66 family transposase  44.69 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0068  IS66 family transposase  44.69 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1407  IS66 family transposase  44.69 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0815  IS66 family transposase  44.69 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1760  IS66 family transposase  44.69 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0839939  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3343  IS66 family transposase  44.69 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4860  IS66 family transposase  44.69 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3384  IS66 family transposase  44.69 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  44.25 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  44.25 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3448  IS66 family element, transposase  44.25 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1523  IS66 family element, transposase  44.25 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2964  IS66 family element, transposase  44.25 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3413  IS66 family element, transposase  44.25 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3096  IS66 family element, transposase  44.25 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.147891  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0193  IS66 family element, transposase  44.25 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0728  transposase IS66  43.28 
 
 		 540 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4625  IS66 family element, transposase  44.25 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0510  IS66 family element, transposase  44.25 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0712  IS66 family element, transposase  44.25 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0707  IS66 family element, transposase  44.25 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2601  IS66 family element, transposase  44.25 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2618  IS66 family element, transposase  44.25 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1866  IS66 family element, transposase  44.25 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.324382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2109  IS66 family element, transposase  44.25 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2364  IS66 family element, transposase  44.25 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  44.25 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  44.25 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0898  transposase IS66  42.77 
 
 		 545 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.888311  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2728  transposase IS66  42.77 
 
 		 545 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0274249  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1117  IS66 family element, transposase  44.25 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  44.25 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4788  transposase IS66  42.77 
 
 		 545 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4660  IS66 family element, transposase  44.25 
 
 		 512 aa  402  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4652  IS66 family element, transposase  44.05 
 
 		 512 aa  401  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0146  IS66 family element, transposase  44.05 
 
 		 512 aa  401  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0711  transposase IS66  43.35 
 
 		 545 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4984  transposase  41.58 
 
 		 535 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4976  transposase IS66  42.74 
 
 		 531 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000420547  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0068  transposase IS66  42.77 
 
 		 542 aa  385  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0005  IS66 family transposase  42.06 
 
 		 523 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0063  IS66 family transposase  42.06 
 
 		 523 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.394688  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1757  IS66 family transposase  42.06 
 
 		 523 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4879  IS66 family transposase  42.06 
 
 		 523 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3368  IS66 family transposase  42.06 
 
 		 523 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4978  IS66 family insertion sequence transposase protein  40.16 
 
 		 549 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0047  IS66 family transposase  42.06 
 
 		 523 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.637398  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0078  transposase family  40.71 
 
 		 533 aa  376  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  7.38697e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1339  IS66 family element, transposase  41.81 
 
 		 537 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0609  transposase  41.37 
 
 		 527 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6361  transposase  41.37 
 
 		 527 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2123  IS66 family transposase  41.2 
 
 		 537 aa  375  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4905  transposase IS66  39.28 
 
 		 551 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4397  transposase IS66  40.08 
 
 		 537 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3126  IS66 family transposase orfB  41.65 
 
 		 524 aa  375  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0906  IS66 family element, transposase  41.03 
 
 		 530 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.417331  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2591  putative transposase, TnpC  41.77 
 
 		 524 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1847  IS66 family element, transposase  41.03 
 
 		 530 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2961  IS66 family element, transposase  41.03 
 
 		 530 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.834706  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1284  IS66 family element, transposase  41.03 
 
 		 530 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0847  IS66 family element, transposase  41.03 
 
 		 530 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>