More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0399 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0399  transposase IS66  100 
 
 		 461 aa  944    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.402856  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4905  transposase IS66  58.5 
 
 		 551 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4978  IS66 family insertion sequence transposase protein  55.46 
 
 		 549 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0784  transposase IS66  57.86 
 
 		 553 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5015  transposase IS66  56.92 
 
 		 549 aa  508  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2254  transposase IS66  56.69 
 
 		 538 aa  508  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505913  normal  0.0115325 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3700  hypothetical protein  55.24 
 
 		 524 aa  501  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.751956 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4397  transposase IS66  55.24 
 
 		 537 aa  500  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5388  transposase IS66  58.01 
 
 		 562 aa  494  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4817  transposase IS66  55.35 
 
 		 533 aa  480  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.171914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7754  transposase  54.77 
 
 		 540 aa  463  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109481 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7045  transposase  53.35 
 
 		 552 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0688  transposase  53.35 
 
 		 552 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3407  transposase  53.35 
 
 		 552 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0609  transposase  51.95 
 
 		 527 aa  435  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6361  transposase  51.95 
 
 		 527 aa  435  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6726  transposase  48.03 
 
 		 556 aa  418  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4984  transposase  51.2 
 
 		 535 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0733  transposase IS66  43.94 
 
 		 434 aa  319  7e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1584  hypothetical protein  57.34 
 
 		 361 aa  319  7.999999999999999e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.747581 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0707  IS66 family element, transposase  41.95 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1117  IS66 family element, transposase  41.95 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  41.95 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2413  IS66 family element, transposase  41.95 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0712  IS66 family element, transposase  41.95 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0510  IS66 family element, transposase  41.95 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4625  IS66 family element, transposase  41.95 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0017  IS66 family element, transposase  41.95 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2364  IS66 family element, transposase  41.95 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0228  IS66 family element, transposase  41.95 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2109  IS66 family element, transposase  41.95 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  41.95 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1584  IS66 family element, transposase  41.95 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1523  IS66 family element, transposase  41.95 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  41.95 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1653  IS66 family element, transposase  41.95 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2947  IS66 family element, transposase  41.95 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2964  IS66 family element, transposase  41.95 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3096  IS66 family element, transposase  41.95 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.147891  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3413  IS66 family element, transposase  41.95 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3448  IS66 family element, transposase  41.95 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3708  IS66 family element, transposase  41.95 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00019301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3675  IS66 family element, transposase  41.95 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2711  IS66 family element, transposase  41.95 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.292603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2601  IS66 family element, transposase  41.95 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2618  IS66 family element, transposase  41.95 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  41.95 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  41.95 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1866  IS66 family element, transposase  41.95 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.324382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2636  IS66 family element, transposase  41.95 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0147268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4197  IS66 family element, transposase  41.95 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0193  IS66 family element, transposase  41.95 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4660  IS66 family element, transposase  41.95 
 
 		 512 aa  311  2e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0146  IS66 family element, transposase  41.72 
 
 		 512 aa  310  4e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4652  IS66 family element, transposase  41.72 
 
 		 512 aa  310  4e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2841  IS66 family element, transposase  41.08 
 
 		 512 aa  306  7e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0678669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4292  IS66 family element, transposase  41.08 
 
 		 512 aa  306  7e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1308  IS66 family element, transposase  41.08 
 
 		 512 aa  306  7e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.796856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1183  IS66 family element, transposase  41.08 
 
 		 512 aa  306  7e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2224  IS66 family element, transposase  41.08 
 
 		 512 aa  306  7e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101822  hitchhiker  0.0000000000417229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1812  IS66 family element, transposase  41.08 
 
 		 512 aa  306  7e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.438062  hitchhiker  0.000000148464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0344  IS66 family element, transposase  41.08 
 
 		 512 aa  306  7e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000788528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5043  IS66 family element, transposase  41.08 
 
 		 512 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3343  IS66 family transposase  41.08 
 
 		 512 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3384  IS66 family transposase  41.08 
 
 		 512 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1760  IS66 family transposase  41.08 
 
 		 512 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0839939  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4860  IS66 family transposase  41.08 
 
 		 512 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0038  IS66 family transposase  41.08 
 
 		 512 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0815  IS66 family transposase  41.08 
 
 		 512 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0068  IS66 family transposase  41.08 
 
 		 512 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0019  IS66 family transposase  41.08 
 
 		 512 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1407  IS66 family transposase  41.08 
 
 		 512 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1651  IS66 family element, transposase  40.86 
 
 		 512 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0118  IS66 family element, transposase  40.86 
 
 		 512 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.960295  normal  0.698521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4608  transposase IS66  55.44 
 
 		 354 aa  303  4.0000000000000003e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0241583  normal  0.199267 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  40.41 
 
 		 531 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  41.16 
 
 		 532 aa  293  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  40.44 
 
 		 508 aa  290  4e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  39.59 
 
 		 520 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  39.29 
 
 		 491 aa  284  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6513  transposase IS66  34.85 
 
 		 521 aa  282  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0611457 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  38.32 
 
 		 516 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6486  transposase IS66  34.72 
 
 		 522 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212807  normal  0.436333 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0259  transposase  37.95 
 
 		 522 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0154331 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3368  IS66 family transposase  38.46 
 
 		 523 aa  277  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4879  IS66 family transposase  38.46 
 
 		 523 aa  277  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0047  IS66 family transposase  38.46 
 
 		 523 aa  277  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.637398  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0005  IS66 family transposase  38.46 
 
 		 523 aa  277  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1757  IS66 family transposase  38.46 
 
 		 523 aa  277  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0063  IS66 family transposase  38.46 
 
 		 523 aa  277  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.394688  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3126  IS66 family transposase orfB  38.46 
 
 		 524 aa  276  5e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1606  IS66 family element, transposase  41.25 
 
 		 438 aa  276  7e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000125107  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0078  transposase family  36.56 
 
 		 533 aa  271  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  7.38697e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5535  transposase IS66  36.28 
 
 		 537 aa  266  5.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2123  IS66 family transposase  37.93 
 
 		 537 aa  265  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4976  transposase IS66  36.65 
 
 		 531 aa  263  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000420547  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  38.77 
 
 		 523 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  38.77 
 
 		 523 aa  262  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  38.77 
 
 		 523 aa  262  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  38.77 
 
 		 523 aa  262  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>