More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_D0019 on replicon NC_009788
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009788  EcE24377A_D0019  IS66 family transposase  100 
 
 
512 aa  1056    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0017  IS66 family element, transposase  92.19 
 
 
512 aa  960    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0068  IS66 family transposase  100 
 
 
512 aa  1056    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0065  IS66 family element, transposase  64.21 
 
 
530 aa  634    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.116785  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4652  IS66 family element, transposase  91.99 
 
 
512 aa  957    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4625  IS66 family element, transposase  92.19 
 
 
512 aa  960    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0510  IS66 family element, transposase  92.19 
 
 
512 aa  960    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  92.19 
 
 
512 aa  960    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3899  IS66 family element, transposase  64.21 
 
 
530 aa  634    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3096  IS66 family element, transposase  92.19 
 
 
512 aa  960    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.147891  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4197  IS66 family element, transposase  93.08 
 
 
512 aa  958    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3708  IS66 family element, transposase  93.08 
 
 
512 aa  958    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00019301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2964  IS66 family element, transposase  92.19 
 
 
512 aa  960    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2961  IS66 family element, transposase  64.21 
 
 
530 aa  634    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.834706  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2618  IS66 family element, transposase  92.19 
 
 
512 aa  960    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0712  IS66 family element, transposase  92.19 
 
 
512 aa  960    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0707  IS66 family element, transposase  92.19 
 
 
512 aa  960    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0193  IS66 family element, transposase  92.19 
 
 
512 aa  960    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5043  IS66 family element, transposase  96.88 
 
 
512 aa  1023    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2636  IS66 family element, transposase  92.19 
 
 
512 aa  960    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0147268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4660  IS66 family element, transposase  91.8 
 
 
512 aa  957    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1760  IS66 family transposase  100 
 
 
512 aa  1056    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0839939  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3448  IS66 family element, transposase  92.19 
 
 
512 aa  960    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3413  IS66 family element, transposase  92.19 
 
 
512 aa  960    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3675  IS66 family element, transposase  92.19 
 
 
512 aa  960    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1117  IS66 family element, transposase  92.19 
 
 
512 aa  960    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  92.19 
 
 
512 aa  960    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  92.19 
 
 
512 aa  960    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1523  IS66 family element, transposase  93.08 
 
 
512 aa  958    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1284  IS66 family element, transposase  64.21 
 
 
530 aa  634    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  92.19 
 
 
512 aa  960    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0146  IS66 family element, transposase  91.99 
 
 
512 aa  957    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1606  IS66 family element, transposase  89.34 
 
 
438 aa  754    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000125107  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1584  IS66 family element, transposase  92.19 
 
 
512 aa  960    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  93.08 
 
 
512 aa  958    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2364  IS66 family element, transposase  92.19 
 
 
512 aa  960    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1651  IS66 family element, transposase  96.88 
 
 
512 aa  1023    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1812  IS66 family element, transposase  97.07 
 
 
512 aa  1025    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.438062  hitchhiker  0.000000148464 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2413  IS66 family element, transposase  92.19 
 
 
512 aa  960    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624161  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2841  IS66 family element, transposase  97.07 
 
 
512 aa  1025    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0678669  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0118  IS66 family element, transposase  96.88 
 
 
512 aa  1023    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.960295  normal  0.698521 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2711  IS66 family element, transposase  92.19 
 
 
512 aa  960    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.292603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2947  IS66 family element, transposase  92.19 
 
 
512 aa  960    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1653  IS66 family element, transposase  92.19 
 
 
512 aa  960    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1847  IS66 family element, transposase  64.21 
 
 
530 aa  634    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2224  IS66 family element, transposase  97.07 
 
 
512 aa  1025    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101822  hitchhiker  0.0000000000417229 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2601  IS66 family element, transposase  92.19 
 
 
512 aa  960    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0228  IS66 family element, transposase  93.08 
 
 
512 aa  958    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4292  IS66 family element, transposase  97.07 
 
 
512 aa  1025    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1866  IS66 family element, transposase  92.19 
 
 
512 aa  960    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.324382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2109  IS66 family element, transposase  92.19 
 
 
512 aa  960    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0344  IS66 family element, transposase  97.07 
 
 
512 aa  1025    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000788528  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1183  IS66 family element, transposase  97.07 
 
 
512 aa  1025    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1308  IS66 family element, transposase  97.07 
 
 
512 aa  1025    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.796856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1339  IS66 family element, transposase  64.42 
 
 
537 aa  641    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3343  IS66 family transposase  100 
 
 
512 aa  1056    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2123  IS66 family transposase  64.42 
 
 
537 aa  644    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4860  IS66 family transposase  100 
 
 
512 aa  1056    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0038  IS66 family transposase  100 
 
 
512 aa  1056    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1407  IS66 family transposase  100 
 
 
512 aa  1056    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0815  IS66 family transposase  100 
 
 
512 aa  1056    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3384  IS66 family transposase  100 
 
 
512 aa  1056    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0847  IS66 family element, transposase  64 
 
 
530 aa  633  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4623  IS66 family element, transposase  64 
 
 
530 aa  632  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0906  IS66 family element, transposase  64 
 
 
530 aa  633  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.417331  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0255  IS66 family element, transposase  64 
 
 
530 aa  633  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0023  IS66 family element, transposase  64 
 
 
530 aa  633  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2143  IS66 family element, transposase  64.21 
 
 
517 aa  634  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3368  IS66 family transposase  59.47 
 
 
523 aa  593  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0005  IS66 family transposase  59.47 
 
 
523 aa  593  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0063  IS66 family transposase  59.47 
 
 
523 aa  593  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.394688  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4879  IS66 family transposase  59.47 
 
 
523 aa  593  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0047  IS66 family transposase  59.47 
 
 
523 aa  593  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.637398  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1757  IS66 family transposase  59.47 
 
 
523 aa  593  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3126  IS66 family transposase orfB  59.35 
 
 
524 aa  587  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0078  transposase family  55.09 
 
 
533 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  7.38697e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  55.95 
 
 
520 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  55.78 
 
 
516 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  55.1 
 
 
523 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  55.1 
 
 
523 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  55.1 
 
 
523 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  55.1 
 
 
523 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  55.1 
 
 
523 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  56.07 
 
 
531 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  54.12 
 
 
523 aa  535  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0259  transposase  53.5 
 
 
522 aa  535  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0154331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  55.69 
 
 
532 aa  536  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  54.51 
 
 
523 aa  534  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4976  transposase IS66  53.42 
 
 
531 aa  529  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000420547  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  56.33 
 
 
508 aa  525  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2591  putative transposase, TnpC  53.17 
 
 
524 aa  522  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  50.72 
 
 
491 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0805  putative transposase IS66  61.54 
 
 
378 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248518  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5535  transposase IS66  47 
 
 
537 aa  455  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6513  transposase IS66  44.12 
 
 
521 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0611457 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6486  transposase IS66  44.69 
 
 
522 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212807  normal  0.436333 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4273  ISSfl4 ORF3  92.23 
 
 
206 aa  397  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.53324  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4656  Aec53  64.31 
 
 
303 aa  393  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204904  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0036  transposase family  52.76 
 
 
410 aa  380  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4397  transposase IS66  42.69 
 
 
537 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>