More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1001 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0017  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 512 aa  1049    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0065  IS66 family element, transposase  64.63 
 
 		 530 aa  641    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.116785  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4652  IS66 family element, transposase  99.8 
 
 		 512 aa  1046    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4625  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 512 aa  1049    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0712  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 512 aa  1049    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 512 aa  1049    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3413  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 512 aa  1049    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2947  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 512 aa  1049    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3096  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 512 aa  1049    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.147891  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3675  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 512 aa  1049    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2961  IS66 family element, transposase  64.63 
 
 		 530 aa  641    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.834706  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2964  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 512 aa  1049    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2618  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 512 aa  1049    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0255  IS66 family element, transposase  64.42 
 
 		 530 aa  639    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0023  IS66 family element, transposase  64.42 
 
 		 530 aa  639    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0510  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 512 aa  1049    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3448  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 512 aa  1049    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0038  IS66 family transposase  92.19 
 
 		 512 aa  960    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0815  IS66 family transposase  92.19 
 
 		 512 aa  960    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2123  IS66 family transposase  64.84 
 
 		 537 aa  649    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0068  IS66 family transposase  92.19 
 
 		 512 aa  960    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1407  IS66 family transposase  92.19 
 
 		 512 aa  960    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0019  IS66 family transposase  92.19 
 
 		 512 aa  960    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1760  IS66 family transposase  92.19 
 
 		 512 aa  960    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0839939  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0193  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 512 aa  1049    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1866  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 512 aa  1049    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.324382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0847  IS66 family element, transposase  64.42 
 
 		 530 aa  639    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3708  IS66 family element, transposase  99.8 
 
 		 512 aa  1047    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00019301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3899  IS66 family element, transposase  64.63 
 
 		 530 aa  641    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4197  IS66 family element, transposase  99.8 
 
 		 512 aa  1047    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1284  IS66 family element, transposase  64.63 
 
 		 530 aa  641    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1117  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 512 aa  1049    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1523  IS66 family element, transposase  99.8 
 
 		 512 aa  1047    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1606  IS66 family element, transposase  98.58 
 
 		 438 aa  841    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000125107  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1584  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 512 aa  1049    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 512 aa  1049    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  99.8 
 
 		 512 aa  1047    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0146  IS66 family element, transposase  99.8 
 
 		 512 aa  1046    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 512 aa  1049    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 512 aa  1049    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0906  IS66 family element, transposase  64.42 
 
 		 530 aa  639    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.417331  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2711  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 512 aa  1049    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.292603  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1651  IS66 family element, transposase  89.45 
 
 		 512 aa  935    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1812  IS66 family element, transposase  89.65 
 
 		 512 aa  939    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.438062  hitchhiker  0.000000148464 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2636  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 512 aa  1049    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0147268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1183  IS66 family element, transposase  89.65 
 
 		 512 aa  939    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2224  IS66 family element, transposase  89.65 
 
 		 512 aa  939    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101822  hitchhiker  0.0000000000417229 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0707  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 512 aa  1049    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4660  IS66 family element, transposase  99.61 
 
 		 512 aa  1046    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2601  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 512 aa  1049    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4623  IS66 family element, transposase  64.42 
 
 		 530 aa  639    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1847  IS66 family element, transposase  64.63 
 
 		 530 aa  641    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1653  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 512 aa  1049    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3384  IS66 family transposase  92.19 
 
 		 512 aa  960    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2109  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 512 aa  1049    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0228  IS66 family element, transposase  99.8 
 
 		 512 aa  1047    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4292  IS66 family element, transposase  89.65 
 
 		 512 aa  939    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2841  IS66 family element, transposase  89.65 
 
 		 512 aa  939    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0678669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2413  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 512 aa  1049    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2364  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 512 aa  1049    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0118  IS66 family element, transposase  89.45 
 
 		 512 aa  935    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.960295  normal  0.698521 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2143  IS66 family element, transposase  64.63 
 
 		 517 aa  641    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5043  IS66 family element, transposase  89.45 
 
 		 512 aa  935    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1339  IS66 family element, transposase  64.84 
 
 		 537 aa  647    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1308  IS66 family element, transposase  89.65 
 
 		 512 aa  939    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.796856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0344  IS66 family element, transposase  89.65 
 
 		 512 aa  939    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000788528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3343  IS66 family transposase  92.19 
 
 		 512 aa  960    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4860  IS66 family transposase  92.19 
 
 		 512 aa  960    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4879  IS66 family transposase  58.32 
 
 		 523 aa  609  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0005  IS66 family transposase  58.32 
 
 		 523 aa  609  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0063  IS66 family transposase  58.32 
 
 		 523 aa  609  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.394688  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1757  IS66 family transposase  58.32 
 
 		 523 aa  609  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0047  IS66 family transposase  58.32 
 
 		 523 aa  609  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.637398  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3368  IS66 family transposase  58.32 
 
 		 523 aa  609  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3126  IS66 family transposase orfB  58.21 
 
 		 524 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0078  transposase family  55.85 
 
 		 533 aa  587  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  7.38697e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  56.58 
 
 		 516 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  55.68 
 
 		 520 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  55.13 
 
 		 531 aa  559  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  55.43 
 
 		 523 aa  553  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  55.43 
 
 		 523 aa  553  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  55.43 
 
 		 523 aa  553  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  55.43 
 
 		 523 aa  553  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  55.43 
 
 		 523 aa  553  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0259  transposase  54.69 
 
 		 522 aa  552  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0154331 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  55.04 
 
 		 523 aa  548  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  54.84 
 
 		 523 aa  548  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  57.02 
 
 		 532 aa  545  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4976  transposase IS66  54.84 
 
 		 531 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000420547  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2591  putative transposase, TnpC  53.57 
 
 		 524 aa  532  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  56.56 
 
 		 508 aa  530  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  50.92 
 
 		 491 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5535  transposase IS66  47.06 
 
 		 537 aa  468  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0805  putative transposase IS66  61.37 
 
 		 378 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6513  transposase IS66  44.49 
 
 		 521 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0611457 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4656  Aec53  66.67 
 
 		 303 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204904  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6486  transposase IS66  44.25 
 
 		 522 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212807  normal  0.436333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6726  transposase  43.66 
 
 		 556 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0036  transposase family  52.06 
 
 		 410 aa  396  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4397  transposase IS66  42.5 
 
 		 537 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>