More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4984 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4984  transposase  100 
 
 
535 aa  1082    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6726  transposase  88.74 
 
 
556 aa  904    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544647  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0609  transposase  58.06 
 
 
527 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6361  transposase  58.06 
 
 
527 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422327  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4978  IS66 family insertion sequence transposase protein  55.68 
 
 
549 aa  596  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5015  transposase IS66  58.8 
 
 
549 aa  593  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2254  transposase IS66  58.16 
 
 
538 aa  588  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505913  normal  0.0115325 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5388  transposase IS66  55.64 
 
 
562 aa  587  1e-166  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4905  transposase IS66  57.46 
 
 
551 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4397  transposase IS66  55.43 
 
 
537 aa  565  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0784  transposase IS66  56.32 
 
 
553 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3700  hypothetical protein  55.73 
 
 
524 aa  557  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.751956 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3407  transposase  55.96 
 
 
552 aa  553  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7045  transposase  55.96 
 
 
552 aa  553  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0688  transposase  55.96 
 
 
552 aa  553  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7754  transposase  55.74 
 
 
540 aa  541  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.109481 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4817  transposase IS66  56.19 
 
 
533 aa  537  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.171914 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  47.65 
 
 
520 aa  465  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  46.18 
 
 
523 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  46.18 
 
 
523 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  46.18 
 
 
523 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  46.18 
 
 
523 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  46.18 
 
 
523 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  46 
 
 
523 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  46 
 
 
523 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  46.83 
 
 
531 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  49.19 
 
 
508 aa  451  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  48.69 
 
 
532 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0399  transposase IS66  51.3 
 
 
461 aa  441  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.402856  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  44.47 
 
 
516 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  47.08 
 
 
491 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6513  transposase IS66  42.8 
 
 
521 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0611457 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6486  transposase IS66  42.91 
 
 
522 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212807  normal  0.436333 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4976  transposase IS66  42.91 
 
 
531 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000420547  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0017  IS66 family element, transposase  43.32 
 
 
512 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4625  IS66 family element, transposase  43.32 
 
 
512 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4660  IS66 family element, transposase  43.13 
 
 
512 aa  396  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2964  IS66 family element, transposase  43.32 
 
 
512 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1653  IS66 family element, transposase  43.32 
 
 
512 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2636  IS66 family element, transposase  43.32 
 
 
512 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0147268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2947  IS66 family element, transposase  43.32 
 
 
512 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2711  IS66 family element, transposase  43.32 
 
 
512 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.292603  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0259  transposase  43.94 
 
 
522 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0154331 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3448  IS66 family element, transposase  43.32 
 
 
512 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3096  IS66 family element, transposase  43.32 
 
 
512 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.147891  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3413  IS66 family element, transposase  43.32 
 
 
512 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2618  IS66 family element, transposase  43.32 
 
 
512 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4197  IS66 family element, transposase  43.32 
 
 
512 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2601  IS66 family element, transposase  43.32 
 
 
512 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0228  IS66 family element, transposase  43.32 
 
 
512 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0193  IS66 family element, transposase  43.32 
 
 
512 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1117  IS66 family element, transposase  43.32 
 
 
512 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1584  IS66 family element, transposase  43.32 
 
 
512 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2364  IS66 family element, transposase  43.32 
 
 
512 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1523  IS66 family element, transposase  43.32 
 
 
512 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0712  IS66 family element, transposase  43.32 
 
 
512 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  43.32 
 
 
512 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  43.32 
 
 
512 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  43.32 
 
 
512 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  43.32 
 
 
512 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2413  IS66 family element, transposase  43.32 
 
 
512 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3675  IS66 family element, transposase  43.32 
 
 
512 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3708  IS66 family element, transposase  43.32 
 
 
512 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00019301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0510  IS66 family element, transposase  43.32 
 
 
512 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0707  IS66 family element, transposase  43.32 
 
 
512 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  43.32 
 
 
512 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2109  IS66 family element, transposase  43.32 
 
 
512 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1866  IS66 family element, transposase  43.32 
 
 
512 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.324382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4652  IS66 family element, transposase  43.13 
 
 
512 aa  395  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0146  IS66 family element, transposase  43.13 
 
 
512 aa  395  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2728  transposase IS66  42.27 
 
 
545 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0274249  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1812  IS66 family element, transposase  42.18 
 
 
512 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.438062  hitchhiker  0.000000148464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0344  IS66 family element, transposase  42.18 
 
 
512 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000788528  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1183  IS66 family element, transposase  42.18 
 
 
512 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4292  IS66 family element, transposase  42.18 
 
 
512 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1308  IS66 family element, transposase  42.18 
 
 
512 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.796856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5043  IS66 family element, transposase  42.18 
 
 
512 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2841  IS66 family element, transposase  42.18 
 
 
512 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0678669  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2224  IS66 family element, transposase  42.18 
 
 
512 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101822  hitchhiker  0.0000000000417229 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0898  transposase IS66  42.1 
 
 
545 aa  391  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.888311  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4788  transposase IS66  42.1 
 
 
545 aa  391  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0118  IS66 family element, transposase  41.98 
 
 
512 aa  388  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.960295  normal  0.698521 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5535  transposase IS66  42.77 
 
 
537 aa  389  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0019  IS66 family transposase  41.98 
 
 
512 aa  385  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0038  IS66 family transposase  41.98 
 
 
512 aa  385  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0815  IS66 family transposase  41.98 
 
 
512 aa  385  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2123  IS66 family transposase  47.22 
 
 
537 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0068  IS66 family transposase  41.98 
 
 
512 aa  385  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1407  IS66 family transposase  41.98 
 
 
512 aa  385  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1760  IS66 family transposase  41.98 
 
 
512 aa  385  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0839939  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3343  IS66 family transposase  41.98 
 
 
512 aa  385  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3384  IS66 family transposase  41.98 
 
 
512 aa  385  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4860  IS66 family transposase  41.98 
 
 
512 aa  385  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0068  transposase IS66  41.65 
 
 
542 aa  386  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1651  IS66 family element, transposase  41.98 
 
 
512 aa  388  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0711  transposase IS66  42.4 
 
 
545 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0078  transposase family  41.8 
 
 
533 aa  385  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  7.38697e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0005  IS66 family transposase  41.4 
 
 
523 aa  384  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0047  IS66 family transposase  41.4 
 
 
523 aa  384  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.637398  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1757  IS66 family transposase  41.4 
 
 
523 aa  384  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>