89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4904 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4907  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 411 bp  815    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4904    100 
 
 		 2921 bp  5790    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4905  transposase IS66  100 
 
 		 1656 bp  3283    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4906  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 348 bp  690    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6339  IS66 Orf2 family protein  90.56 
 
 		 354 bp  287  9e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.191496 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3807  IS66 Orf2 like  87.83 
 
 		 354 bp  234  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194698  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2254  transposase IS66  81.02 
 
 		 1617 bp  200  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505913  normal  0.0115325 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2792  IS66 Orf2 like  85.65 
 
 		 450 bp  194  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0836026  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2988    82.96 
 
 		 803 bp  188  6e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298454  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5015  transposase IS66  80.89 
 
 		 1650 bp  184  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4608  transposase IS66  81.11 
 
 		 1065 bp  176  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0241583  normal  0.199267 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6727  hypothetical protein  82.11 
 
 		 351 bp  145  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.523617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6149    88.55 
 
 		 144 bp  141  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.753376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4817  transposase IS66  81.61 
 
 		 1602 bp  137  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.171914 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0784  transposase IS66  91.67 
 
 		 1662 bp  127  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3700  hypothetical protein  80.57 
 
 		 1575 bp  125  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.751956 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4397  transposase IS66  80.57 
 
 		 1614 bp  125  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4978  IS66 family insertion sequence transposase protein  82.11 
 
 		 1650 bp  107  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5078  transposase IS66  85.45 
 
 		 840 bp  91.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4985    86 
 
 		 183 bp  87.7  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4986    86.21 
 
 		 162 bp  87.7  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7754  transposase  91.94 
 
 		 1623 bp  83.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109481 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4609  IS66 Orf2 family protein  82 
 
 		 348 bp  83.8  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225742  normal  0.160384 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6190    82.14 
 
 		 827 bp  79.8  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4607  transposase and inactivated derivative  92.86 
 
 		 450 bp  79.8  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0215693  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3195    87.34 
 
 		 1697 bp  77.8  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5388  transposase IS66  90.32 
 
 		 1689 bp  75.8  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1457    80.79 
 
 		 312 bp  69.9  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1584  hypothetical protein  85.54 
 
 		 1086 bp  69.9  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.747581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6336    87.69 
 
 		 261 bp  65.9  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0667339  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4984  transposase  85.92 
 
 		 1608 bp  61.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4816  IS66 Orf2 family protein  84.62 
 
 		 348 bp  60  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.191561 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5014  IS66 Orf2 family protein  91.3 
 
 		 348 bp  60  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4819  IS66 Orf2 family protein  84.62 
 
 		 348 bp  60  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.115753 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1016  hypothetical protein  94.59 
 
 		 375 bp  58  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2995    80.75 
 
 		 1432 bp  58  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.598703  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7045  transposase  84.72 
 
 		 1659 bp  56  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4818  hypothetical protein  90.91 
 
 		 549 bp  56  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.192973 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1396  hypothetical protein  96.88 
 
 		 576 bp  56  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223414 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3407  transposase  84.72 
 
 		 1659 bp  56  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0688  transposase  84.72 
 
 		 1659 bp  56  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9094    84.72 
 
 		 1660 bp  56  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.288319  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0610  hypothetical protein  84.51 
 
 		 348 bp  54  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6362  hypothetical protein  84.51 
 
 		 348 bp  54  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4967    89.36 
 
 		 372 bp  54  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3097  IS66 family element, orf2  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00401392  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1005  IS66 family element, orf2  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3414  IS66 family element, orf2  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3447  IS66 family element, orf2  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3676  IS66 family element, orf2  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3709  IS66 family element, orf2  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000797988  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4196  IS66 family element, orf2  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4198    94.12 
 
 		 4969 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4624  ISEc8 transposase  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4638  IS66 family element, orf2  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4653  IS66 family element, orf2  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4659  IS66 family element, orf2  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.542564  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0018  ISEc8 transposase  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0071    94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673847  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0145  IS66 family element, orf2  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8625  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0194  IS66 family element, orf2  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0227  IS66 family element, orf2  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1607  ISEc8 transposase  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790251  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1728  transposase  94.12 
 
 		 354 bp  52  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2253  IS66 Orf2 family protein  89.13 
 
 		 348 bp  52  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556164  hitchhiker  0.00787404 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  90.48 
 
 		 1533 bp  52  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0511  IS66 family element, orf2  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0708  IS66 family element, orf2  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0711  IS66 family element, orf2  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.669363  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1002  IS66 family element, orf2  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0341  IS66 Orf2 like  100 
 
 		 294 bp  52  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.20024  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1114  ISEc8 transposase  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.883622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1116  ISEc8 transposase  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1524  IS66 family element, orf2  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1583  IS66 family element, orf2  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2963  IS66 family element, orf2  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.532183  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1641  IS66 family element, orf2  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1645  IS66 family element, orf2  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1654  IS66 family element, orf2  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1867  IS66 family element, orf2  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.381004  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2108  IS66 family element, orf2  94.12 
 
 		 294 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2363  ISEc8 transposase  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000786413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2414  IS66 family element, orf2  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.175278  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2602  IS66 family element, orf2  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2619  IS66 family element, orf2  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2637  IS66 family element, orf2  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2712  IS66 family element, orf2  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.844413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2948  IS66 family element, orf2  94.12 
 
 		 348 bp  52  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7465  IS66 Orf2 family protein  88.89 
 
 		 354 bp  50.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>