21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2988 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2988    100 
 
 		 803 bp  1592    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298454  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4905  transposase IS66  82.96 
 
 		 1656 bp  188  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4904    82.96 
 
 		 2921 bp  188  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4608  transposase IS66  81.01 
 
 		 1065 bp  153  9e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0241583  normal  0.199267 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0784  transposase IS66  84.06 
 
 		 1662 bp  91.7  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4978  IS66 family insertion sequence transposase protein  92.45 
 
 		 1650 bp  73.8  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4817  transposase IS66  83.19 
 
 		 1602 bp  73.8  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.171914 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3700  hypothetical protein  79.04 
 
 		 1575 bp  69.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.751956 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4397  transposase IS66  79.04 
 
 		 1614 bp  69.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2995    90.74 
 
 		 1432 bp  67.9  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.598703  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5015  transposase IS66  82.73 
 
 		 1650 bp  67.9  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3195    90.74 
 
 		 1697 bp  67.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2254  transposase IS66  77.88 
 
 		 1617 bp  63.9  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505913  normal  0.0115325 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0733  transposase IS66  89.09 
 
 		 1305 bp  61.9  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7754  transposase  88.68 
 
 		 1623 bp  58  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109481 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5388  transposase IS66  90.91 
 
 		 1689 bp  56  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2186  uridine kinase  100 
 
 		 672 bp  56  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.717082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6334    85.92 
 
 		 248 bp  54  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0798031  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6361  transposase  82.72 
 
 		 1584 bp  50.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0609  transposase  82.72 
 
 		 1584 bp  50.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1457    85 
 
 		 312 bp  48.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>