50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3195 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009433  Rsph17025_4397  transposase IS66  89.04 
 
 		 1614 bp  1219    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3700  hypothetical protein  89.22 
 
 		 1575 bp  1213    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.751956 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0733  transposase IS66  86.73 
 
 		 1305 bp  708    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3195    100 
 
 		 1697 bp  3364    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3735    89.05 
 
 		 579 bp  549  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0734  hypothetical protein  94.27 
 
 		 186 bp  240  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4978  IS66 family insertion sequence transposase protein  87.05 
 
 		 1650 bp  133  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4608  transposase IS66  82.42 
 
 		 1065 bp  97.6  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0241583  normal  0.199267 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7754  transposase  83.7 
 
 		 1623 bp  93.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109481 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0784  transposase IS66  92.31 
 
 		 1662 bp  89.7  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1436  hypothetical protein  91.18 
 
 		 714 bp  87.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2254  transposase IS66  87.65 
 
 		 1617 bp  81.8  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505913  normal  0.0115325 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4817  transposase IS66  80.31 
 
 		 1602 bp  81.8  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.171914 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4905  transposase IS66  87.34 
 
 		 1656 bp  77.8  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4904    87.34 
 
 		 2921 bp  77.8  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2995    82.01 
 
 		 1432 bp  77.8  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.598703  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4151  posible transposase  84.31 
 
 		 321 bp  75.8  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0115322  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4607  transposase and inactivated derivative  81.01 
 
 		 450 bp  75.8  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0215693  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5388  transposase IS66  84.31 
 
 		 1689 bp  75.8  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5015  transposase IS66  86.42 
 
 		 1650 bp  73.8  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2988    90.74 
 
 		 803 bp  67.9  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298454  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5078  transposase IS66  83.16 
 
 		 840 bp  61.9  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6361  transposase  88.14 
 
 		 1584 bp  61.9  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0609  transposase  88.14 
 
 		 1584 bp  61.9  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1585  transposase  93.02 
 
 		 681 bp  61.9  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1581  hypothetical protein  90 
 
 		 213 bp  60  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.329633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4984  transposase  84.42 
 
 		 1608 bp  58  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  94.44 
 
 		 1572 bp  56  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  94.44 
 
 		 1572 bp  56  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1104  TnpC protein  94.44 
 
 		 576 bp  56  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  94.44 
 
 		 1572 bp  56  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  94.44 
 
 		 1572 bp  56  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1584  hypothetical protein  94.44 
 
 		 1086 bp  56  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.747581 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  94.44 
 
 		 1572 bp  56  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  94.44 
 
 		 1572 bp  56  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  94.44 
 
 		 1572 bp  56  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2893  TnpC protein  94.44 
 
 		 228 bp  56  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.285732  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2042  TnpC protein  94.44 
 
 		 375 bp  56  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0089202  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0399  transposase IS66  94.29 
 
 		 1386 bp  54  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.402856  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4818  hypothetical protein  94.29 
 
 		 549 bp  54  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.192973 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4967    90.24 
 
 		 372 bp  50.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  96.55 
 
 		 1527 bp  50.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6190    90 
 
 		 827 bp  48.1  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3170    93.75 
 
 		 495 bp  48.1  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.307402  normal  0.769891 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3423  tryptophanase  100 
 
 		 1449 bp  48.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.592416  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1022  transposase IS66  100 
 
 		 1560 bp  48.1  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1401  transposase IS66  100 
 
 		 1560 bp  48.1  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2523  transposase IS66  100 
 
 		 1554 bp  48.1  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297904  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  93.75 
 
 		 1563 bp  48.1  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0744    96.43 
 
 		 702 bp  48.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>