20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3170 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3170    100 
 
 
495 bp  981    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.307402  normal  0.769891 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1104  TnpC protein  82.93 
 
 
576 bp  155  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  82.93 
 
 
1572 bp  155  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  82.93 
 
 
1572 bp  155  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  82.93 
 
 
1572 bp  155  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  82.93 
 
 
1572 bp  155  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  82.93 
 
 
1572 bp  155  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  82.93 
 
 
1572 bp  155  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  82.93 
 
 
1572 bp  155  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6439    79.33 
 
 
4201 bp  137  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000012776 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2042  TnpC protein  83.6 
 
 
375 bp  129  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0089202  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  79.75 
 
 
1563 bp  123  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2893  TnpC protein  82.96 
 
 
228 bp  85.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.285732  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2891  TnpC protein  83.18 
 
 
468 bp  69.9  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  85.29 
 
 
1551 bp  56  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0362    92.11 
 
 
303 bp  52  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.366476  hitchhiker  0.000139614 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3195    93.75 
 
 
1697 bp  48.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0734  hypothetical protein  93.75 
 
 
186 bp  48.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1570  esterase/lipase/thioesterase family protein  100 
 
 
915 bp  46.1  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.329769  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  83.1 
 
 
1527 bp  46.1  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>