83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6439 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6439    100 
 
 		 4201 bp  8328    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000012776 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1190    100 
 
 		 3415 bp  5192    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  80.66 
 
 		 1572 bp  591  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  80.66 
 
 		 1572 bp  591  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  80.66 
 
 		 1572 bp  591  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  80.66 
 
 		 1572 bp  591  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  80.66 
 
 		 1572 bp  591  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  80.58 
 
 		 1572 bp  583  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  80.65 
 
 		 1572 bp  573  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3856  hypothetical protein  100 
 
 		 1770 bp  317  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1943  oxidoreductase, molybdopterin-binding subunit  92.99 
 
 		 990 bp  305  6e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0448477  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1104  TnpC protein  79.64 
 
 		 576 bp  178  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2891  TnpC protein  80.59 
 
 		 468 bp  165  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3170    79.33 
 
 		 495 bp  137  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.307402  normal  0.769891 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2042  TnpC protein  80.72 
 
 		 375 bp  105  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0089202  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3169  putative IS66 transposase, TnpC  79.14 
 
 		 681 bp  91.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180033  normal  0.755183 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  92.98 
 
 		 1527 bp  81.8  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  77 
 
 		 1563 bp  79.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  90.32 
 
 		 1476 bp  75.8  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1176  TnpC protein  80.11 
 
 		 489 bp  71.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.969692  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2811  transposase  83.67 
 
 		 489 bp  67.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0162    89.29 
 
 		 1302 bp  63.9  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4976  transposase IS66  82.61 
 
 		 1596 bp  56  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000420547  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0161    82.69 
 
 		 264 bp  56  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  86.44 
 
 		 1599 bp  54  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0815  IS66 family transposase  86.21 
 
 		 1539 bp  52  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0038  IS66 family transposase  86.21 
 
 		 1539 bp  52  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0019  IS66 family transposase  86.21 
 
 		 1539 bp  52  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0118  IS66 family element, transposase  86.21 
 
 		 1539 bp  52  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.960295  normal  0.698521 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0344  IS66 family element, transposase  86.21 
 
 		 1539 bp  52  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000788528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1183  IS66 family element, transposase  86.21 
 
 		 1539 bp  52  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1308  IS66 family element, transposase  86.21 
 
 		 1539 bp  52  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.796856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1651  IS66 family element, transposase  86.21 
 
 		 1539 bp  52  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2224  IS66 family element, transposase  86.21 
 
 		 1539 bp  52  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101822  hitchhiker  0.0000000000417229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2841  IS66 family element, transposase  86.21 
 
 		 1539 bp  52  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0678669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5043  IS66 family element, transposase  86.21 
 
 		 1539 bp  52  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0068  IS66 family transposase  86.21 
 
 		 1539 bp  52  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4877    86.21 
 
 		 1385 bp  52  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4860  IS66 family transposase  86.21 
 
 		 1539 bp  52  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3384  IS66 family transposase  86.21 
 
 		 1539 bp  52  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3343  IS66 family transposase  86.21 
 
 		 1539 bp  52  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2933    86.21 
 
 		 1540 bp  52  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1760  IS66 family transposase  86.21 
 
 		 1539 bp  52  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0839939  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1407  IS66 family transposase  86.21 
 
 		 1539 bp  52  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4292  IS66 family element, transposase  86.21 
 
 		 1539 bp  52  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3448  IS66 family element, transposase  82.02 
 
 		 1539 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3675  IS66 family element, transposase  82.02 
 
 		 1539 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3708  IS66 family element, transposase  82.02 
 
 		 1539 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00019301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4197  IS66 family element, transposase  82.02 
 
 		 1539 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4198    82.02 
 
 		 4969 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4625  IS66 family element, transposase  82.02 
 
 		 1539 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4637    82.02 
 
 		 1407 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0017  IS66 family element, transposase  82.02 
 
 		 1539 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0070    82.02 
 
 		 1539 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000253615  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0193  IS66 family element, transposase  82.02 
 
 		 1539 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0228  IS66 family element, transposase  82.02 
 
 		 1539 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2893  TnpC protein  84.62 
 
 		 228 bp  50.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.285732  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  82.02 
 
 		 1539 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  87.76 
 
 		 1551 bp  50.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0510  IS66 family element, transposase  82.02 
 
 		 1539 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0707  IS66 family element, transposase  82.02 
 
 		 1539 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0712  IS66 family element, transposase  82.02 
 
 		 1539 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  82.02 
 
 		 1539 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  82.02 
 
 		 1539 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  82.02 
 
 		 1539 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1117  IS66 family element, transposase  82.02 
 
 		 1539 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1523  IS66 family element, transposase  82.02 
 
 		 1539 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1584  IS66 family element, transposase  82.02 
 
 		 1539 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1606  IS66 family element, transposase  82.02 
 
 		 1317 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000125107  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  82.02 
 
 		 1539 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3413  IS66 family element, transposase  82.02 
 
 		 1539 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1653  IS66 family element, transposase  82.02 
 
 		 1539 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1866  IS66 family element, transposase  82.02 
 
 		 1539 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.324382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2109  IS66 family element, transposase  82.02 
 
 		 1539 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2364  IS66 family element, transposase  82.02 
 
 		 1539 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2413  IS66 family element, transposase  82.02 
 
 		 1539 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2601  IS66 family element, transposase  82.02 
 
 		 1539 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2618  IS66 family element, transposase  82.02 
 
 		 1539 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2636  IS66 family element, transposase  82.02 
 
 		 1539 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0147268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2711  IS66 family element, transposase  82.02 
 
 		 1539 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.292603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2947  IS66 family element, transposase  82.02 
 
 		 1539 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2964  IS66 family element, transposase  82.02 
 
 		 1539 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3096  IS66 family element, transposase  82.02 
 
 		 1539 bp  50.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.147891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>