185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4198 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E2963  IS66 family element, orf2  99.43 
 
 		 348 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.532183  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3097  IS66 family element, orf2  99.43 
 
 		 348 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00401392  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2964  IS66 family element, transposase  99.87 
 
 		 1539 bp  3035    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2948  IS66 family element, orf2  99.43 
 
 		 348 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3413  IS66 family element, transposase  99.87 
 
 		 1539 bp  3035    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3096  IS66 family element, transposase  99.87 
 
 		 1539 bp  3035    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.147891  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2947  IS66 family element, transposase  99.87 
 
 		 1539 bp  3035    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0019  IS66 family transposase  89.81 
 
 		 1539 bp  1750    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0017  IS66 family element, transposase  99.87 
 
 		 1539 bp  3035    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  98.97 
 
 		 390 bp  741    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3448  IS66 family element, transposase  99.87 
 
 		 1539 bp  3035    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4197  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 1539 bp  3051    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4624  ISEc8 transposase  99.71 
 
 		 348 bp  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3709  IS66 family element, orf2  99.43 
 
 		 348 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000797988  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0038  IS66 family transposase  89.81 
 
 		 1539 bp  1750    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0146  IS66 family element, transposase  99.81 
 
 		 1539 bp  3027    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  98.97 
 
 		 390 bp  741    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4195  LpfC  100 
 
 		 624 bp  1231    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3414  IS66 family element, orf2  99.71 
 
 		 348 bp  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0068  IS66 family transposase  89.81 
 
 		 1539 bp  1750    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  99.5 
 
 		 402 bp  781    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  98.97 
 
 		 390 bp  741    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0815  IS66 family transposase  89.81 
 
 		 1539 bp  1750    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0071    100 
 
 		 348 bp  690    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673847  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  98.97 
 
 		 390 bp  741    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  98.97 
 
 		 390 bp  741    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  99.49 
 
 		 390 bp  757    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1407  IS66 family transposase  89.81 
 
 		 1539 bp  1750    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3708  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 1539 bp  3051    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00019301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4625  IS66 family element, transposase  99.81 
 
 		 1539 bp  3027    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1760  IS66 family transposase  89.81 
 
 		 1539 bp  1750    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0839939  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4659  IS66 family element, orf2  99.71 
 
 		 348 bp  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.542564  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  98.97 
 
 		 390 bp  741    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4637    99.64 
 
 		 1407 bp  2744    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  98.97 
 
 		 390 bp  741    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4660  IS66 family element, transposase  99.74 
 
 		 1539 bp  3019    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2933    89.75 
 
 		 1540 bp  1737    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3343  IS66 family transposase  89.81 
 
 		 1539 bp  1750    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0018  ISEc8 transposase  99.43 
 
 		 348 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  98.97 
 
 		 390 bp  741    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4196  IS66 family element, orf2  100 
 
 		 348 bp  690    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3447  IS66 family element, orf2  99.71 
 
 		 348 bp  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3384  IS66 family transposase  89.81 
 
 		 1539 bp  1750    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0070    99.87 
 
 		 1539 bp  3039    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000253615  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  98.97 
 
 		 390 bp  741    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4241  outer membrane usher protein FimD  99.95 
 
 		 2520 bp  3806    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4860  IS66 family transposase  89.81 
 
 		 1539 bp  1750    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  99.49 
 
 		 390 bp  757    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  98.97 
 
 		 390 bp  741    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4877    86.76 
 
 		 1385 bp  1070    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0145  IS66 family element, orf2  99.43 
 
 		 348 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8625  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3676  IS66 family element, orf2  99.71 
 
 		 348 bp  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4198    100 
 
 		 4969 bp  9850    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4882    98.35 
 
 		 381 bp  674    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3675  IS66 family element, transposase  99.87 
 
 		 1539 bp  3035    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4094  long polar fimbrial operon protein LpfC  89.35 
 
 		 2523 bp  2189    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.118889 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0510  IS66 family element, transposase  99.94 
 
 		 1539 bp  3043    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0511  IS66 family element, orf2  99.43 
 
 		 348 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0707  IS66 family element, transposase  99.87 
 
 		 1539 bp  3035    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0708  IS66 family element, orf2  99.71 
 
 		 348 bp  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0711  IS66 family element, orf2  99.71 
 
 		 348 bp  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.669363  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0712  IS66 family element, transposase  99.87 
 
 		 1539 bp  3035    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  99.94 
 
 		 1539 bp  3043    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1002  IS66 family element, orf2  99.71 
 
 		 348 bp  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4638  IS66 family element, orf2  99.71 
 
 		 348 bp  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1005  IS66 family element, orf2  99.71 
 
 		 348 bp  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  99.94 
 
 		 1539 bp  3043    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  99.87 
 
 		 1539 bp  3035    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1114  ISEc8 transposase  99.43 
 
 		 348 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.883622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1116  ISEc8 transposase  99.43 
 
 		 348 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1117  IS66 family element, transposase  99.87 
 
 		 1539 bp  3035    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1523  IS66 family element, transposase  99.94 
 
 		 1539 bp  3043    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1524  IS66 family element, orf2  100 
 
 		 348 bp  690    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1583  IS66 family element, orf2  99.43 
 
 		 348 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1584  IS66 family element, transposase  99.94 
 
 		 1539 bp  3043    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1606  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 1317 bp  2472    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000125107  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1607  ISEc8 transposase  100 
 
 		 348 bp  690    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790251  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  99.94 
 
 		 1539 bp  3043    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1641  IS66 family element, orf2  99.71 
 
 		 348 bp  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 1539 bp  3051    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1645  IS66 family element, orf2  100 
 
 		 348 bp  690    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1653  IS66 family element, transposase  99.87 
 
 		 1539 bp  3035    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1654  IS66 family element, orf2  99.71 
 
 		 348 bp  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1866  IS66 family element, transposase  99.87 
 
 		 1539 bp  3035    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.324382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1867  IS66 family element, orf2  99.43 
 
 		 348 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.381004  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4652  IS66 family element, transposase  99.74 
 
 		 1539 bp  3019    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2109  IS66 family element, transposase  99.87 
 
 		 1539 bp  3035    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2363  ISEc8 transposase  99.43 
 
 		 348 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000786413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2364  IS66 family element, transposase  99.87 
 
 		 1539 bp  3035    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2413  IS66 family element, transposase  99.87 
 
 		 1539 bp  3035    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2414  IS66 family element, orf2  99.43 
 
 		 348 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.175278  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2601  IS66 family element, transposase  99.87 
 
 		 1539 bp  3035    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2602  IS66 family element, orf2  99.71 
 
 		 348 bp  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2618  IS66 family element, transposase  99.81 
 
 		 1539 bp  3027    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2619  IS66 family element, orf2  99.71 
 
 		 348 bp  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2636  IS66 family element, transposase  99.87 
 
 		 1539 bp  3035    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0147268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2637  IS66 family element, orf2  99.43 
 
 		 348 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4653  IS66 family element, orf2  99.71 
 
 		 348 bp  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2711  IS66 family element, transposase  99.87 
 
 		 1539 bp  3035    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.292603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2712  IS66 family element, orf2  99.43 
 
 		 348 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.844413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>