74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0071 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E2712  IS66 family element, orf2  99.43 
 
 
348 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.844413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1524  IS66 family element, orf2  100 
 
 
348 bp  690    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1583  IS66 family element, orf2  99.43 
 
 
348 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1607  ISEc8 transposase  100 
 
 
348 bp  690    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790251  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1641  IS66 family element, orf2  99.71 
 
 
348 bp  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1645  IS66 family element, orf2  100 
 
 
348 bp  690    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1654  IS66 family element, orf2  99.71 
 
 
348 bp  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1867  IS66 family element, orf2  99.43 
 
 
348 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.381004  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2363  ISEc8 transposase  99.43 
 
 
348 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000786413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2414  IS66 family element, orf2  99.43 
 
 
348 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.175278  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2602  IS66 family element, orf2  99.71 
 
 
348 bp  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2619  IS66 family element, orf2  99.71 
 
 
348 bp  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2637  IS66 family element, orf2  99.43 
 
 
348 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1116  ISEc8 transposase  99.43 
 
 
348 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2948  IS66 family element, orf2  99.43 
 
 
348 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2963  IS66 family element, orf2  99.43 
 
 
348 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.532183  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3097  IS66 family element, orf2  99.43 
 
 
348 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00401392  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3414  IS66 family element, orf2  99.71 
 
 
348 bp  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3447  IS66 family element, orf2  99.71 
 
 
348 bp  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3676  IS66 family element, orf2  99.71 
 
 
348 bp  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3709  IS66 family element, orf2  99.43 
 
 
348 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000797988  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4196  IS66 family element, orf2  100 
 
 
348 bp  690    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4198    100 
 
 
4969 bp  690    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4624  ISEc8 transposase  99.71 
 
 
348 bp  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4638  IS66 family element, orf2  99.71 
 
 
348 bp  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1114  ISEc8 transposase  99.43 
 
 
348 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.883622  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0227  IS66 family element, orf2  100 
 
 
348 bp  690    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0194  IS66 family element, orf2  99.71 
 
 
348 bp  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0145  IS66 family element, orf2  99.43 
 
 
348 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8625  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0071    100 
 
 
348 bp  690    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673847  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0018  ISEc8 transposase  99.43 
 
 
348 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4659  IS66 family element, orf2  99.71 
 
 
348 bp  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.542564  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0511  IS66 family element, orf2  99.43 
 
 
348 bp  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0708  IS66 family element, orf2  99.71 
 
 
348 bp  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0711  IS66 family element, orf2  99.71 
 
 
348 bp  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.669363  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1002  IS66 family element, orf2  99.71 
 
 
348 bp  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1005  IS66 family element, orf2  99.71 
 
 
348 bp  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4653  IS66 family element, orf2  99.71 
 
 
348 bp  682    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2108  IS66 family element, orf2  99.66 
 
 
294 bp  575  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4878  IS66 family orf2  88.82 
 
 
348 bp  343  2e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5042  IS66 family element, orf2  87.36 
 
 
348 bp  341  8e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3875  IS66 family element, orf2  87.36 
 
 
348 bp  341  8e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2840  IS66 family element, orf2  87.36 
 
 
348 bp  341  8e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131854  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2223  IS66 family element, orf2  87.36 
 
 
348 bp  341  8e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0126387  hitchhiker  0.00000000000242445 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1813  IS66 family element, orf2  87.36 
 
 
348 bp  341  8e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.376504  hitchhiker  0.0000000512452 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1650  IS66 family element, orf2  87.36 
 
 
348 bp  341  8e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1309  IS66 family element, orf2  87.36 
 
 
348 bp  341  8e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1182  IS66 family element, orf2  87.36 
 
 
348 bp  341  8e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0343  IS66 family element, orf2  87.36 
 
 
348 bp  341  8e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000139365  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0117  IS66 family element, orf2  87.36 
 
 
348 bp  341  8e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.780843  normal  0.658153 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4291  IS66 family element, orf2  87.36 
 
 
348 bp  341  8e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4861  IS66 family orf2  88.5 
 
 
348 bp  335  5e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0020  IS66 family orf2  88.5 
 
 
348 bp  335  5e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0039  IS66 family orf2  88.5 
 
 
348 bp  335  5e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0069  IS66 family orf2  88.5 
 
 
348 bp  335  5e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0816  IS66 family orf2  88.5 
 
 
348 bp  335  5e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1406  IS66 family orf2  88.5 
 
 
348 bp  335  5e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1761  IS66 family orf2  88.5 
 
 
348 bp  335  5e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2932  IS66 family orf2  88.5 
 
 
348 bp  335  5e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3344  IS66 family orf2  88.5 
 
 
348 bp  335  5e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3385  IS66 family orf2  88.5 
 
 
348 bp  335  5e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1758  IS66 family orf2  94 
 
 
348 bp  75.8  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3367  IS66 family orf2  94 
 
 
348 bp  75.8  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.555204  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0046  IS66 family orf2  94 
 
 
348 bp  75.8  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.916394  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0004  IS66 family orf2  94 
 
 
348 bp  75.8  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0064  IS66 family orf2  94 
 
 
348 bp  75.8  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.719086  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4880  IS66 family orf2  94 
 
 
348 bp  75.8  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0035  IS66 family element, Orf2 protein  92 
 
 
348 bp  67.9  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0061    95.12 
 
 
174 bp  65.9  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0137502  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4904    94.12 
 
 
2921 bp  52  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4906  IS66 Orf2 family protein  94.12 
 
 
348 bp  52  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4275  ISSfl4 ORF2  88.89 
 
 
348 bp  50.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.935918  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0341  IS66 Orf2 like  87.5 
 
 
294 bp  48.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.20024  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1177  70 kDa peroxisomal membrane protein  93.55 
 
 
348 bp  46.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.664227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>