62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_B0061 on replicon NC_011204
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011204  SeD_B0061    100 
 
 		 174 bp  345  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0137502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4878  IS66 family orf2  85.98 
 
 		 348 bp  93.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0039  IS66 family orf2  85.05 
 
 		 348 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5042  IS66 family element, orf2  85.05 
 
 		 348 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4291  IS66 family element, orf2  85.05 
 
 		 348 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3875  IS66 family element, orf2  85.05 
 
 		 348 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2840  IS66 family element, orf2  85.05 
 
 		 348 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2223  IS66 family element, orf2  85.05 
 
 		 348 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0126387  hitchhiker  0.00000000000242445 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1813  IS66 family element, orf2  85.05 
 
 		 348 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.376504  hitchhiker  0.0000000512452 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1650  IS66 family element, orf2  85.05 
 
 		 348 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1309  IS66 family element, orf2  85.05 
 
 		 348 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1182  IS66 family element, orf2  85.05 
 
 		 348 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0343  IS66 family element, orf2  85.05 
 
 		 348 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000139365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0117  IS66 family element, orf2  85.05 
 
 		 348 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.780843  normal  0.658153 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0020  IS66 family orf2  85.05 
 
 		 348 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4861  IS66 family orf2  85.05 
 
 		 348 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3385  IS66 family orf2  85.05 
 
 		 348 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3344  IS66 family orf2  85.05 
 
 		 348 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2932  IS66 family orf2  85.05 
 
 		 348 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1761  IS66 family orf2  85.05 
 
 		 348 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1406  IS66 family orf2  85.05 
 
 		 348 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0816  IS66 family orf2  85.05 
 
 		 348 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0069  IS66 family orf2  85.05 
 
 		 348 bp  85.7  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4196  IS66 family element, orf2  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1005  IS66 family element, orf2  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4198    95.12 
 
 		 4969 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4624  ISEc8 transposase  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4638  IS66 family element, orf2  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4653  IS66 family element, orf2  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4659  IS66 family element, orf2  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.542564  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0018  ISEc8 transposase  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0071    95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673847  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0145  IS66 family element, orf2  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8625  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0194  IS66 family element, orf2  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0227  IS66 family element, orf2  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0711  IS66 family element, orf2  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.669363  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0708  IS66 family element, orf2  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0511  IS66 family element, orf2  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2363  ISEc8 transposase  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000786413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1002  IS66 family element, orf2  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1114  ISEc8 transposase  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.883622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1116  ISEc8 transposase  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1524  IS66 family element, orf2  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1583  IS66 family element, orf2  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1607  ISEc8 transposase  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790251  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1641  IS66 family element, orf2  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1645  IS66 family element, orf2  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1654  IS66 family element, orf2  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1867  IS66 family element, orf2  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.381004  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2414  IS66 family element, orf2  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.175278  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2602  IS66 family element, orf2  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2619  IS66 family element, orf2  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2637  IS66 family element, orf2  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2712  IS66 family element, orf2  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.844413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2948  IS66 family element, orf2  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2963  IS66 family element, orf2  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.532183  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3097  IS66 family element, orf2  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00401392  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3414  IS66 family element, orf2  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3447  IS66 family element, orf2  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3676  IS66 family element, orf2  95.12 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3709  IS66 family element, orf2  92.68 
 
 		 348 bp  58  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000797988  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2108  IS66 family element, orf2  82.18 
 
 		 294 bp  58  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>