20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0162 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  83.9 
 
 
1596 bp  916    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0162    100 
 
 
1302 bp  2581    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  95.08 
 
 
1599 bp  2072    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4896    80.66 
 
 
890 bp  238  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0163    100 
 
 
285 bp  135  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  84.25 
 
 
1551 bp  93.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  85.45 
 
 
1572 bp  91.7  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  85.45 
 
 
1572 bp  91.7  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  85.45 
 
 
1572 bp  91.7  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  85.45 
 
 
1572 bp  91.7  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  85.45 
 
 
1572 bp  91.7  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  85.45 
 
 
1572 bp  91.7  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  84.55 
 
 
1572 bp  83.8  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6439    89.29 
 
 
4201 bp  63.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000012776 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  83.33 
 
 
1563 bp  60  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  84.72 
 
 
1527 bp  56  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1176  TnpC protein  80.3 
 
 
489 bp  56  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.969692  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2811  transposase  80.3 
 
 
489 bp  56  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0941    89.13 
 
 
1055 bp  52  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4976  transposase IS66  91.67 
 
 
1596 bp  48.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000420547  normal  0.71393 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>