16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1190 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6439    100 
 
 		 4201 bp  5192    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000012776 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1190    100 
 
 		 3415 bp  6770    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3856  hypothetical protein  100 
 
 		 1770 bp  317  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1943  oxidoreductase, molybdopterin-binding subunit  92.99 
 
 		 990 bp  305  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0448477  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1697  hypothetical protein  81.35 
 
 		 789 bp  262  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1850  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  81.04 
 
 		 789 bp  258  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000906575  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1923  DNA adenine methylase  84.8 
 
 		 972 bp  256  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595545  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1068  DNA adenine methylase  84.5 
 
 		 789 bp  248  9e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.859034  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0177  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  84.94 
 
 		 792 bp  131  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.044334 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0463  putative N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  89.19 
 
 		 792 bp  83.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2682  DNA adenine methylase  86.75 
 
 		 792 bp  77.8  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1638  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  84.54 
 
 		 795 bp  73.8  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.355798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1982    84.52 
 
 		 603 bp  63.9  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207252 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2898  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  94.74 
 
 		 792 bp  60  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160115 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  94.74 
 
 		 792 bp  60  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  hitchhiker  0.00000213835 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1221  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  96.88 
 
 		 798 bp  56  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0898175  hitchhiker  0.0000277159 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>