More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0734 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0734  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3700  hypothetical protein  93.44 
 
 		 524 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.751956 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4397  transposase IS66  93.44 
 
 		 537 aa  117  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4607  transposase and inactivated derivative  75.41 
 
 		 149 aa  97.8  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0215693  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4978  IS66 family insertion sequence transposase protein  75.41 
 
 		 549 aa  94.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5388  transposase IS66  72.13 
 
 		 562 aa  94  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7754  transposase  73.77 
 
 		 540 aa  93.6  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109481 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0784  transposase IS66  71.19 
 
 		 553 aa  93.6  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4905  transposase IS66  72.13 
 
 		 551 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4151  posible transposase  70.49 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0115322  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2254  transposase IS66  70.49 
 
 		 538 aa  88.2  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505913  normal  0.0115325 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5015  transposase IS66  68.85 
 
 		 549 aa  87.4  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0609  transposase  60.66 
 
 		 527 aa  87  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1585  transposase  65.57 
 
 		 226 aa  87  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6361  transposase  60.66 
 
 		 527 aa  87  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7045  transposase  60.66 
 
 		 552 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0688  transposase  60.66 
 
 		 552 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3407  transposase  60.66 
 
 		 552 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4984  transposase  62.3 
 
 		 535 aa  84.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6726  transposase  65.57 
 
 		 556 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  63.93 
 
 		 520 aa  84.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4817  transposase IS66  65.57 
 
 		 533 aa  82  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.171914 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  60.66 
 
 		 516 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  62.3 
 
 		 491 aa  80.9  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4919  hypothetical protein  64.52 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.759352 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  62.3 
 
 		 508 aa  80.5  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  57.38 
 
 		 531 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3126  IS66 family transposase orfB  54.1 
 
 		 524 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2042  TnpC protein  57.38 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0089202  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  57.38 
 
 		 523 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2893  TnpC protein  57.38 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.285732  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3593  transposase IS66  60.66 
 
 		 404 aa  77  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.324594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1104  TnpC protein  57.38 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  57.38 
 
 		 523 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  57.38 
 
 		 523 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  57.38 
 
 		 523 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  57.38 
 
 		 523 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  57.38 
 
 		 523 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  57.38 
 
 		 523 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  57.38 
 
 		 532 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4540  transposase IS66  60.66 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1086  transposase family  57.38 
 
 		 521 aa  76.6  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0290  transposase family  50.82 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  5.19364e-43  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0047  IS66 family transposase  52.46 
 
 		 523 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.637398  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3368  IS66 family transposase  52.46 
 
 		 523 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4879  IS66 family transposase  52.46 
 
 		 523 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0063  IS66 family transposase  52.46 
 
 		 523 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.394688  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0005  IS66 family transposase  52.46 
 
 		 523 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1757  IS66 family transposase  52.46 
 
 		 523 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5535  transposase IS66  55.74 
 
 		 537 aa  73.6  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6513  transposase IS66  50.82 
 
 		 521 aa  73.6  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0611457 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0344  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000788528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2841  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0678669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1308  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.796856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1183  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1651  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4656  Aec53  52.46 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204904  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1812  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.438062  hitchhiker  0.000000148464 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6486  transposase IS66  50.82 
 
 		 522 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212807  normal  0.436333 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4976  transposase IS66  57.38 
 
 		 531 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000420547  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4292  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2224  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101822  hitchhiker  0.0000000000417229 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2591  putative transposase, TnpC  55.74 
 
 		 524 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0118  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.960295  normal  0.698521 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3384  IS66 family transposase  52.46 
 
 		 512 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2109  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1866  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.324382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4660  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0193  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1653  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3413  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3343  IS66 family transposase  52.46 
 
 		 512 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2601  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3448  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3708  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00019301  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0146  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  71.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1117  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3096  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.147891  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2964  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1584  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3675  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0068  IS66 family transposase  52.46 
 
 		 512 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2947  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0712  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0805  putative transposase IS66  55.74 
 
 		 378 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0017  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0815  IS66 family transposase  52.46 
 
 		 512 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0228  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4197  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2413  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  52.46 
 
 		 512 aa  72  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0572  transposase IS66  59.02 
 
 		 504 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0648577 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2455  transposase IS66  59.02 
 
 		 504 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2916  transposase IS66  59.02 
 
 		 504 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1407  IS66 family transposase  52.46 
 
 		 512 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1760  IS66 family transposase  52.46 
 
 		 512 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0839939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>