More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4151 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007490  RSP_4151  posible transposase  100 
 
 
106 aa  218  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0115322  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3700  hypothetical protein  66.04 
 
 
524 aa  153  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.751956 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4397  transposase IS66  66.04 
 
 
537 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4607  transposase and inactivated derivative  66.04 
 
 
149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0215693  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4905  transposase IS66  66.04 
 
 
551 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0784  transposase IS66  61.32 
 
 
553 aa  140  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5388  transposase IS66  60.38 
 
 
562 aa  137  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4978  IS66 family insertion sequence transposase protein  61.32 
 
 
549 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5015  transposase IS66  61.32 
 
 
549 aa  133  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0609  transposase  60.38 
 
 
527 aa  133  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6361  transposase  60.38 
 
 
527 aa  133  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422327  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7754  transposase  59.43 
 
 
540 aa  131  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.109481 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2254  transposase IS66  60.38 
 
 
538 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505913  normal  0.0115325 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4984  transposase  58.49 
 
 
535 aa  130  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0688  transposase  57.55 
 
 
552 aa  130  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7045  transposase  57.55 
 
 
552 aa  130  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3407  transposase  57.55 
 
 
552 aa  130  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1585  transposase  58.49 
 
 
226 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4817  transposase IS66  59.43 
 
 
533 aa  127  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.171914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6726  transposase  54.72 
 
 
556 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544647  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  50 
 
 
491 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4656  Aec53  43.4 
 
 
303 aa  99.4  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204904  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0898  transposase IS66  49.02 
 
 
545 aa  98.2  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.888311  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0711  transposase IS66  49.02 
 
 
545 aa  98.6  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2728  transposase IS66  49.02 
 
 
545 aa  98.6  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0274249  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0728  transposase IS66  47.42 
 
 
540 aa  98.2  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340756  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3126  IS66 family transposase orfB  42.45 
 
 
524 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4788  transposase IS66  49.02 
 
 
545 aa  98.2  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  47 
 
 
545 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  48 
 
 
545 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  47 
 
 
545 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  47 
 
 
545 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  47 
 
 
545 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0068  transposase IS66  48 
 
 
542 aa  97.1  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1086  transposase family  47.57 
 
 
521 aa  96.7  9e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  47 
 
 
545 aa  96.3  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  46.23 
 
 
508 aa  95.9  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  44.34 
 
 
531 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4879  IS66 family transposase  41.51 
 
 
523 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0063  IS66 family transposase  41.51 
 
 
523 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.394688  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0047  IS66 family transposase  41.51 
 
 
523 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.637398  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0005  IS66 family transposase  41.51 
 
 
523 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3368  IS66 family transposase  41.51 
 
 
523 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1757  IS66 family transposase  41.51 
 
 
523 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  43.4 
 
 
520 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  46.73 
 
 
510 aa  94.4  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  44.34 
 
 
532 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1336  ISSfl3 OrfC  50 
 
 
205 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5982  transposase IS66  49.49 
 
 
523 aa  93.6  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0805  putative transposase IS66  44.34 
 
 
378 aa  93.6  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248518  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3331  transposase IS66  48 
 
 
514 aa  93.2  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3964  transposase IS66  48 
 
 
514 aa  93.2  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3926  transposase IS66  48 
 
 
514 aa  93.2  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2669  transposase IS66  47 
 
 
509 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870521  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3322  transposase IS66  47 
 
 
509 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  43.4 
 
 
523 aa  92  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  43.4 
 
 
523 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  43.4 
 
 
523 aa  92  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  43.4 
 
 
523 aa  92  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  43.4 
 
 
523 aa  92  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  43.4 
 
 
523 aa  92  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  43.4 
 
 
523 aa  92  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0259  transposase  44.34 
 
 
522 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0154331 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0833  transposase IS66  47 
 
 
509 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.423143 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2975  transposase IS66  47 
 
 
509 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1485  transposase IS66  47 
 
 
509 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000322511 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0734  hypothetical protein  70.49 
 
 
61 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1170  transposase IS66  47 
 
 
509 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.934596  normal  0.320109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1022  transposase IS66  47 
 
 
519 aa  91.7  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5512  transposase IS66  44.44 
 
 
290 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499564  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6513  transposase IS66  38.68 
 
 
521 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0611457 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6094  transposase IS66  44.44 
 
 
290 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1401  transposase IS66  47 
 
 
519 aa  91.7  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1224  transposase IS66  44.44 
 
 
290 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0108232  normal  0.0928681 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1608  transposase family  40.57 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.61911e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2523  transposase IS66  47 
 
 
517 aa  92  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297904  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6486  transposase IS66  38.68 
 
 
522 aa  91.3  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212807  normal  0.436333 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1104  TnpC protein  43.4 
 
 
191 aa  91.3  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6364  transposase IS66  44.44 
 
 
524 aa  90.9  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39651  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4292  IS66 family element, transposase  41.51 
 
 
512 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2841  IS66 family element, transposase  41.51 
 
 
512 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0678669  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2224  IS66 family element, transposase  41.51 
 
 
512 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101822  hitchhiker  0.0000000000417229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0344  IS66 family element, transposase  41.51 
 
 
512 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000788528  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1812  IS66 family element, transposase  41.51 
 
 
512 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.438062  hitchhiker  0.000000148464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1183  IS66 family element, transposase  41.51 
 
 
512 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1308  IS66 family element, transposase  41.51 
 
 
512 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.796856 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0572  transposase IS66  46.46 
 
 
504 aa  90.1  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0648577 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2455  transposase IS66  46.46 
 
 
504 aa  90.1  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2916  transposase IS66  46.46 
 
 
504 aa  90.1  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397115  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1170  transposase IS66  47.47 
 
 
507 aa  89.4  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.438673  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2711  transposase IS66  47.47 
 
 
506 aa  89.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3059  transposase IS66  47.47 
 
 
507 aa  89.4  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1088  transposase IS66  44.76 
 
 
579 aa  89  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1059  transposase IS66  44.76 
 
 
579 aa  89  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.591253  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1482  transposase IS66  44.76 
 
 
579 aa  89  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.216681 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1366  transposase IS66  44.76 
 
 
579 aa  89  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0543753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5043  IS66 family element, transposase  41.51 
 
 
512 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3593  transposase IS66  46.23 
 
 
404 aa  89.4  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.324594  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4540  transposase IS66  46.23 
 
 
337 aa  89  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2042  TnpC protein  41.84 
 
 
124 aa  88.2  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0089202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>