More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1086 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1086  transposase family  100 
 
 		 521 aa  1074    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1340  ISSfl3 OrfC  71.18 
 
 		 285 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3794  putative transposase  38.31 
 
 		 540 aa  353  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1865  transposase IS66  38.31 
 
 		 540 aa  353  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223463  normal  0.192922 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2416  IS66 family transposase  38.31 
 
 		 540 aa  353  5e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.521306  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0572  transposase IS66  38.28 
 
 		 504 aa  350  3e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0648577 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2455  transposase IS66  38.28 
 
 		 504 aa  350  3e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2916  transposase IS66  38.28 
 
 		 504 aa  350  3e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6939  transposase IS66  37.86 
 
 		 517 aa  350  5e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1485  transposase IS66  37.84 
 
 		 509 aa  343  4e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000322511 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2975  transposase IS66  37.84 
 
 		 509 aa  343  4e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2669  transposase IS66  37.84 
 
 		 509 aa  343  4e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870521  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1170  transposase IS66  37.84 
 
 		 509 aa  343  4e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.934596  normal  0.320109 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3322  transposase IS66  37.84 
 
 		 509 aa  343  4e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0833  transposase IS66  37.84 
 
 		 509 aa  343  4e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2523  transposase IS66  37.01 
 
 		 517 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297904  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1022  transposase IS66  37.01 
 
 		 519 aa  332  1e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1401  transposase IS66  37.01 
 
 		 519 aa  332  1e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4449  transposase IS66  38.51 
 
 		 528 aa  321  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.543683  normal  0.0438734 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  37.27 
 
 		 545 aa  316  8e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2711  transposase IS66  36.38 
 
 		 506 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1336  ISSfl3 OrfC  73.89 
 
 		 205 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1170  transposase IS66  37.93 
 
 		 507 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.438673  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3059  transposase IS66  37.93 
 
 		 507 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5982  transposase IS66  36.79 
 
 		 523 aa  314  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0037  transposase IS66  37.92 
 
 		 511 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.321823 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3964  ISPpu14, transposase Orf3  37.71 
 
 		 511 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0893475 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  37.4 
 
 		 545 aa  311  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  37.4 
 
 		 545 aa  311  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  37.4 
 
 		 545 aa  311  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  37.4 
 
 		 545 aa  311  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  36.99 
 
 		 545 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3501  ISPpu14, transposase Orf3  36.81 
 
 		 511 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3981  ISPpu14, transposase Orf3  36.81 
 
 		 511 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0385183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4439  ISPpu14, transposase Orf3  36.81 
 
 		 511 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414491  hitchhiker  0.0000684735 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59580  putative transposase  36.61 
 
 		 511 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128729  hitchhiker  1.83127e-18 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4341  transposase IS66  38.85 
 
 		 505 aa  302  9e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5173  transposase IS66  36.98 
 
 		 511 aa  302  9e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8372  transposase IS66  38.85 
 
 		 505 aa  302  9e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6322  transposase IS66  38.85 
 
 		 505 aa  302  9e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4443  ISPpu14, transposase Orf3  36.88 
 
 		 511 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.801949  hitchhiker  0.0000589528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5396  ISPpu14, transposase Orf3  36.88 
 
 		 511 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118381  hitchhiker  0.00957485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  37.47 
 
 		 510 aa  297  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  38 
 
 		 508 aa  297  4e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5015  transposase IS66  38.37 
 
 		 549 aa  290  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  35.35 
 
 		 531 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  35.73 
 
 		 532 aa  289  8e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6337  transposase IS66  34.71 
 
 		 544 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4709  transposase IS66  37.28 
 
 		 497 aa  289  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276755  normal  0.140797 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  33.72 
 
 		 523 aa  288  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  33.72 
 
 		 523 aa  288  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  33.72 
 
 		 523 aa  288  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  33.72 
 
 		 523 aa  288  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  33.72 
 
 		 523 aa  288  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6726  transposase  38.13 
 
 		 556 aa  287  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1366  transposase IS66  33.51 
 
 		 579 aa  286  5.999999999999999e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543753 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1482  transposase IS66  33.51 
 
 		 579 aa  286  5.999999999999999e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216681 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1088  transposase IS66  33.51 
 
 		 579 aa  286  5.999999999999999e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1059  transposase IS66  33.51 
 
 		 579 aa  286  5.999999999999999e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.591253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6513  transposase IS66  33.78 
 
 		 521 aa  286  7e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0611457 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  33.33 
 
 		 523 aa  286  9e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  33.53 
 
 		 523 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0065  putative transposase  35.54 
 
 		 526 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0077  putative ISPpu13, transposase Orf2  35.54 
 
 		 526 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.247033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3736  putative transposase  35.54 
 
 		 526 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2254  transposase IS66  37.44 
 
 		 538 aa  284  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505913  normal  0.0115325 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  35.58 
 
 		 491 aa  282  9e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1783  transposase IS66  35.15 
 
 		 530 aa  281  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  34.24 
 
 		 520 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1536  transposase IS66  35.96 
 
 		 530 aa  280  4e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.881033  normal  0.856435 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  35.41 
 
 		 694 aa  280  6e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6486  transposase IS66  34.35 
 
 		 522 aa  279  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212807  normal  0.436333 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0704  transposase IS66  33.46 
 
 		 523 aa  278  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0762527  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0609  transposase  34.7 
 
 		 527 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6361  transposase  34.7 
 
 		 527 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3700  hypothetical protein  34.85 
 
 		 524 aa  277  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.751956 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4397  transposase IS66  34.47 
 
 		 537 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0201  transposase IS66  33.27 
 
 		 523 aa  276  7e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.228467  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0784  transposase IS66  35.11 
 
 		 553 aa  274  3e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1930  transposase  34.94 
 
 		 495 aa  274  4.0000000000000004e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.897519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3220  ISPsy5, transposase  35.04 
 
 		 503 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.221861  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4782  transposase IS66  34.47 
 
 		 530 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  32.56 
 
 		 516 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4978  IS66 family insertion sequence transposase protein  33.08 
 
 		 549 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3114  ISPpu13, transposase Orf2  35.68 
 
 		 510 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90064  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3985  ISPpu13, transposase Orf2  35.68 
 
 		 510 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.757297  hitchhiker  0.00792894 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2281  transposase  32.78 
 
 		 527 aa  268  2e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4877  transposase IS66  33.78 
 
 		 529 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386958  normal  0.659358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4984  transposase  36.3 
 
 		 535 aa  267  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4817  transposase IS66  34.82 
 
 		 533 aa  266  5e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.171914 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5388  transposase IS66  36.95 
 
 		 562 aa  266  5.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0236  transposase  34.52 
 
 		 495 aa  265  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0098  transposase  34.31 
 
 		 495 aa  265  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0069  transposase  34.31 
 
 		 495 aa  265  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0243  transposase  34.31 
 
 		 495 aa  265  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0335  transposase  34.31 
 
 		 495 aa  265  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.137589  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1747  transposase  34.31 
 
 		 495 aa  265  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2404  transposase  34.31 
 
 		 495 aa  265  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1780  transposase  34.31 
 
 		 495 aa  265  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.175929  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2042  transposase  34.31 
 
 		 495 aa  265  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>