More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1485 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3501  ISPpu14, transposase Orf3  64.97 
 
 		 511 aa  671    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3964  ISPpu14, transposase Orf3  64.58 
 
 		 511 aa  670    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0893475 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3981  ISPpu14, transposase Orf3  64.97 
 
 		 511 aa  671    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0385183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4439  ISPpu14, transposase Orf3  64.97 
 
 		 511 aa  671    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414491  hitchhiker  0.0000684735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4443  ISPpu14, transposase Orf3  64.83 
 
 		 511 aa  663    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.801949  hitchhiker  0.0000589528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5396  ISPpu14, transposase Orf3  64.83 
 
 		 511 aa  663    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118381  hitchhiker  0.00957485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5173  transposase IS66  63.19 
 
 		 511 aa  659    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1485  transposase IS66  100 
 
 		 509 aa  1047    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000322511 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0037  transposase IS66  64.77 
 
 		 511 aa  669    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.321823 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1022  transposase IS66  62.23 
 
 		 519 aa  677    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6939  transposase IS66  69.2 
 
 		 517 aa  742    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2975  transposase IS66  100 
 
 		 509 aa  1047    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1170  transposase IS66  60.99 
 
 		 507 aa  668    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.438673  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2711  transposase IS66  61.04 
 
 		 506 aa  659    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3059  transposase IS66  60.99 
 
 		 507 aa  668    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2523  transposase IS66  62.23 
 
 		 517 aa  678    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297904  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2416  IS66 family transposase  67.62 
 
 		 540 aa  734    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.521306  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3322  transposase IS66  100 
 
 		 509 aa  1047    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3794  putative transposase  67.62 
 
 		 540 aa  735    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1865  transposase IS66  67.62 
 
 		 540 aa  735    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223463  normal  0.192922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59580  putative transposase  64.83 
 
 		 511 aa  664    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128729  hitchhiker  1.83127e-18 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5982  transposase IS66  61.2 
 
 		 523 aa  646    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1401  transposase IS66  62.23 
 
 		 519 aa  677    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0833  transposase IS66  100 
 
 		 509 aa  1047    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423143 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1170  transposase IS66  100 
 
 		 509 aa  1047    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.934596  normal  0.320109 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2669  transposase IS66  100 
 
 		 509 aa  1047    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870521  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0572  transposase IS66  57.62 
 
 		 504 aa  611  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0648577 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2455  transposase IS66  57.62 
 
 		 504 aa  611  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2916  transposase IS66  57.62 
 
 		 504 aa  611  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4449  transposase IS66  52.6 
 
 		 528 aa  520  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.543683  normal  0.0438734 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4021  transposase IS66  64.56 
 
 		 366 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1482  transposase IS66  44.81 
 
 		 579 aa  442  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216681 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1059  transposase IS66  44.81 
 
 		 579 aa  442  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.591253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1088  transposase IS66  44.81 
 
 		 579 aa  442  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1366  transposase IS66  44.81 
 
 		 579 aa  442  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543753 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4709  transposase IS66  48.38 
 
 		 497 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276755  normal  0.140797 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51550  putative transposase  66.88 
 
 		 366 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000328821  hitchhiker  0.0000539108 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  45.16 
 
 		 545 aa  428  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  45.16 
 
 		 545 aa  431  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  44.35 
 
 		 545 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  44.35 
 
 		 545 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  44.35 
 
 		 545 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  44.35 
 
 		 545 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4641  transposase IS66  46.27 
 
 		 477 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4705  transposase IS66  47.26 
 
 		 468 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465239  normal  0.0997646 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  44.33 
 
 		 508 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  42.97 
 
 		 531 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1190  transposase IS66  59.87 
 
 		 435 aa  388  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.808109  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  43.63 
 
 		 532 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  44.54 
 
 		 520 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  41.03 
 
 		 523 aa  362  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  41.03 
 
 		 523 aa  362  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  41.03 
 
 		 523 aa  362  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  41.03 
 
 		 523 aa  362  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  41.03 
 
 		 523 aa  362  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0422  transposase IS66  66.67 
 
 		 274 aa  362  1e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  41.03 
 
 		 523 aa  361  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  42.37 
 
 		 523 aa  358  9e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  42.86 
 
 		 491 aa  356  6.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  40.27 
 
 		 516 aa  346  6e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1523  IS66 family element, transposase  38.54 
 
 		 512 aa  342  9e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  38.54 
 
 		 512 aa  342  9e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3708  IS66 family element, transposase  38.54 
 
 		 512 aa  342  9e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00019301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4197  IS66 family element, transposase  38.54 
 
 		 512 aa  342  9e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0228  IS66 family element, transposase  38.54 
 
 		 512 aa  342  9e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2636  IS66 family element, transposase  38.54 
 
 		 512 aa  342  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0147268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2711  IS66 family element, transposase  38.54 
 
 		 512 aa  342  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.292603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2947  IS66 family element, transposase  38.54 
 
 		 512 aa  342  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2364  IS66 family element, transposase  38.54 
 
 		 512 aa  342  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1866  IS66 family element, transposase  38.54 
 
 		 512 aa  342  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.324382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3096  IS66 family element, transposase  38.54 
 
 		 512 aa  342  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.147891  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  38.54 
 
 		 512 aa  342  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0712  IS66 family element, transposase  38.54 
 
 		 512 aa  342  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1117  IS66 family element, transposase  38.54 
 
 		 512 aa  342  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  38.54 
 
 		 512 aa  342  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1584  IS66 family element, transposase  38.54 
 
 		 512 aa  342  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1653  IS66 family element, transposase  38.54 
 
 		 512 aa  342  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2413  IS66 family element, transposase  38.54 
 
 		 512 aa  342  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2109  IS66 family element, transposase  38.54 
 
 		 512 aa  342  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2601  IS66 family element, transposase  38.54 
 
 		 512 aa  342  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2964  IS66 family element, transposase  38.54 
 
 		 512 aa  342  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4625  IS66 family element, transposase  38.54 
 
 		 512 aa  342  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0510  IS66 family element, transposase  38.54 
 
 		 512 aa  342  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0707  IS66 family element, transposase  38.54 
 
 		 512 aa  342  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  38.54 
 
 		 512 aa  342  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  38.54 
 
 		 512 aa  342  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0193  IS66 family element, transposase  38.54 
 
 		 512 aa  342  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3448  IS66 family element, transposase  38.54 
 
 		 512 aa  342  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3413  IS66 family element, transposase  38.54 
 
 		 512 aa  342  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2618  IS66 family element, transposase  38.54 
 
 		 512 aa  342  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3675  IS66 family element, transposase  38.54 
 
 		 512 aa  342  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0017  IS66 family element, transposase  38.54 
 
 		 512 aa  342  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4660  IS66 family element, transposase  38.54 
 
 		 512 aa  341  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0146  IS66 family element, transposase  38.34 
 
 		 512 aa  340  5e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4652  IS66 family element, transposase  38.34 
 
 		 512 aa  340  5e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0259  transposase  39.64 
 
 		 522 aa  340  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0154331 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5043  IS66 family element, transposase  38.72 
 
 		 512 aa  336  5.999999999999999e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4292  IS66 family element, transposase  38.72 
 
 		 512 aa  336  7e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1308  IS66 family element, transposase  38.72 
 
 		 512 aa  336  7e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.796856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0344  IS66 family element, transposase  38.72 
 
 		 512 aa  336  7e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000788528  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>