More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1088 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1088  transposase IS66  100 
 
 
579 aa  1199    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1059  transposase IS66  100 
 
 
579 aa  1199    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.591253  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1482  transposase IS66  100 
 
 
579 aa  1199    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.216681 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1366  transposase IS66  100 
 
 
579 aa  1199    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0543753 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6939  transposase IS66  46.44 
 
 
517 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3794  putative transposase  45.17 
 
 
540 aa  472  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1865  transposase IS66  45.17 
 
 
540 aa  472  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223463  normal  0.192922 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2416  IS66 family transposase  44.99 
 
 
540 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.521306  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3501  ISPpu14, transposase Orf3  50.57 
 
 
511 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3964  ISPpu14, transposase Orf3  51.88 
 
 
511 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0893475 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3981  ISPpu14, transposase Orf3  50.57 
 
 
511 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0385183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4439  ISPpu14, transposase Orf3  50.57 
 
 
511 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414491  hitchhiker  0.0000684735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4443  ISPpu14, transposase Orf3  50.92 
 
 
511 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.801949  hitchhiker  0.0000589528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5396  ISPpu14, transposase Orf3  50.92 
 
 
511 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118381  hitchhiker  0.00957485 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5982  transposase IS66  43.99 
 
 
523 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0037  transposase IS66  51.41 
 
 
511 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.321823 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1170  transposase IS66  49.15 
 
 
507 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.438673  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3059  transposase IS66  49.15 
 
 
507 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59580  putative transposase  51.29 
 
 
511 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128729  hitchhiker  1.83127e-18 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1022  transposase IS66  49.1 
 
 
519 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2523  transposase IS66  49.1 
 
 
517 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297904  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1401  transposase IS66  49.1 
 
 
519 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0833  transposase IS66  44.81 
 
 
509 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.423143 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5173  transposase IS66  51.18 
 
 
511 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2711  transposase IS66  51.14 
 
 
506 aa  442  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1485  transposase IS66  44.81 
 
 
509 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000322511 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2975  transposase IS66  44.81 
 
 
509 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2669  transposase IS66  44.81 
 
 
509 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870521  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3322  transposase IS66  44.81 
 
 
509 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1170  transposase IS66  44.81 
 
 
509 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.934596  normal  0.320109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0572  transposase IS66  42.88 
 
 
504 aa  427  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0648577 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2455  transposase IS66  42.88 
 
 
504 aa  427  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2916  transposase IS66  42.88 
 
 
504 aa  427  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397115  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4449  transposase IS66  40.98 
 
 
528 aa  363  6e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.543683  normal  0.0438734 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51550  putative transposase  52.44 
 
 
366 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000328821  hitchhiker  0.0000539108 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  37.45 
 
 
545 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4709  transposase IS66  38.66 
 
 
497 aa  316  8e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276755  normal  0.140797 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  36.29 
 
 
545 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  36.1 
 
 
545 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  36.1 
 
 
545 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  36.1 
 
 
545 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  36.1 
 
 
545 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  38.95 
 
 
531 aa  302  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  38.72 
 
 
532 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  38.5 
 
 
523 aa  298  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  38.5 
 
 
523 aa  297  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  38.5 
 
 
523 aa  298  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  38.5 
 
 
523 aa  298  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  38.5 
 
 
523 aa  298  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  38.5 
 
 
523 aa  298  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  38.5 
 
 
523 aa  298  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  38.07 
 
 
508 aa  295  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6513  transposase IS66  34.37 
 
 
521 aa  291  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0611457 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  37.85 
 
 
491 aa  290  5.0000000000000004e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6486  transposase IS66  37.14 
 
 
522 aa  289  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212807  normal  0.436333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4984  transposase  37.59 
 
 
535 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  39.17 
 
 
520 aa  287  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6726  transposase  37.44 
 
 
556 aa  286  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544647  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4705  transposase IS66  37.27 
 
 
468 aa  283  5.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465239  normal  0.0997646 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4641  transposase IS66  37.27 
 
 
477 aa  283  6.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0259  transposase  35.42 
 
 
522 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0154331 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  38.02 
 
 
516 aa  280  8e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5043  IS66 family element, transposase  34.55 
 
 
512 aa  273  7e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4292  IS66 family element, transposase  34.55 
 
 
512 aa  272  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1183  IS66 family element, transposase  34.55 
 
 
512 aa  272  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2841  IS66 family element, transposase  34.55 
 
 
512 aa  272  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0678669  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2224  IS66 family element, transposase  34.55 
 
 
512 aa  272  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101822  hitchhiker  0.0000000000417229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0344  IS66 family element, transposase  34.55 
 
 
512 aa  272  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000788528  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1812  IS66 family element, transposase  34.55 
 
 
512 aa  272  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.438062  hitchhiker  0.000000148464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1308  IS66 family element, transposase  34.55 
 
 
512 aa  272  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.796856 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  37.27 
 
 
510 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0118  IS66 family element, transposase  34.55 
 
 
512 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.960295  normal  0.698521 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1651  IS66 family element, transposase  34.55 
 
 
512 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0038  IS66 family transposase  34.36 
 
 
512 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1086  transposase family  33.51 
 
 
521 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3384  IS66 family transposase  34.36 
 
 
512 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1760  IS66 family transposase  34.36 
 
 
512 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0839939  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0019  IS66 family transposase  34.36 
 
 
512 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0068  IS66 family transposase  34.36 
 
 
512 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1407  IS66 family transposase  34.36 
 
 
512 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4860  IS66 family transposase  34.36 
 
 
512 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3343  IS66 family transposase  34.36 
 
 
512 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0815  IS66 family transposase  34.36 
 
 
512 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4021  transposase IS66  41.19 
 
 
366 aa  268  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0728  transposase IS66  37.92 
 
 
540 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340756  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1653  IS66 family element, transposase  32.79 
 
 
512 aa  265  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  32.79 
 
 
512 aa  265  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0712  IS66 family element, transposase  32.79 
 
 
512 aa  265  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0707  IS66 family element, transposase  32.79 
 
 
512 aa  265  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0510  IS66 family element, transposase  32.79 
 
 
512 aa  265  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1117  IS66 family element, transposase  32.79 
 
 
512 aa  265  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  32.79 
 
 
512 aa  265  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  32.79 
 
 
512 aa  265  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1584  IS66 family element, transposase  32.79 
 
 
512 aa  265  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  32.79 
 
 
512 aa  265  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1523  IS66 family element, transposase  32.79 
 
 
512 aa  265  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  32.79 
 
 
512 aa  265  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2947  IS66 family element, transposase  32.79 
 
 
512 aa  265  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2636  IS66 family element, transposase  32.79 
 
 
512 aa  265  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0147268  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5535  transposase IS66  32.54 
 
 
537 aa  265  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>