More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4709 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008758  Pnap_4449  transposase IS66  88.03 
 
 		 528 aa  896    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.543683  normal  0.0438734 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4641  transposase IS66  99.56 
 
 		 477 aa  938    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4705  transposase IS66  99.79 
 
 		 468 aa  964    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465239  normal  0.0997646 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4709  transposase IS66  100 
 
 		 497 aa  1027    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276755  normal  0.140797 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6939  transposase IS66  47 
 
 		 517 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1170  transposase IS66  47.9 
 
 		 507 aa  443  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.438673  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3059  transposase IS66  47.9 
 
 		 507 aa  443  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3322  transposase IS66  47.11 
 
 		 509 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1170  transposase IS66  47.11 
 
 		 509 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.934596  normal  0.320109 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2975  transposase IS66  47.11 
 
 		 509 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2669  transposase IS66  47.11 
 
 		 509 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870521  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0833  transposase IS66  47.11 
 
 		 509 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423143 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1485  transposase IS66  47.11 
 
 		 509 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000322511 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2711  transposase IS66  48.3 
 
 		 506 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2416  IS66 family transposase  47.15 
 
 		 540 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.521306  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3794  putative transposase  47.15 
 
 		 540 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1865  transposase IS66  47.15 
 
 		 540 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223463  normal  0.192922 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5982  transposase IS66  50.22 
 
 		 523 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0572  transposase IS66  47.74 
 
 		 504 aa  427  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0648577 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2455  transposase IS66  47.74 
 
 		 504 aa  427  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2916  transposase IS66  47.74 
 
 		 504 aa  427  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397115  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3501  ISPpu14, transposase Orf3  48.02 
 
 		 511 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3981  ISPpu14, transposase Orf3  48.02 
 
 		 511 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0385183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4439  ISPpu14, transposase Orf3  48.02 
 
 		 511 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414491  hitchhiker  0.0000684735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4443  ISPpu14, transposase Orf3  48.02 
 
 		 511 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.801949  hitchhiker  0.0000589528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5396  ISPpu14, transposase Orf3  48.02 
 
 		 511 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118381  hitchhiker  0.00957485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59580  putative transposase  47.58 
 
 		 511 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128729  hitchhiker  1.83127e-18 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5173  transposase IS66  46.17 
 
 		 511 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3964  ISPpu14, transposase Orf3  47.36 
 
 		 511 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0893475 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0037  transposase IS66  47.36 
 
 		 511 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.321823 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1401  transposase IS66  44.86 
 
 		 519 aa  409  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2523  transposase IS66  44.86 
 
 		 517 aa  409  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297904  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1022  transposase IS66  44.86 
 
 		 519 aa  409  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  39.39 
 
 		 545 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  40.04 
 
 		 545 aa  334  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  39.61 
 
 		 545 aa  332  6e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  39.61 
 
 		 545 aa  332  6e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  39.61 
 
 		 545 aa  332  6e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  39.61 
 
 		 545 aa  332  6e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  39.35 
 
 		 532 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  37.86 
 
 		 523 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  37.86 
 
 		 523 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  37.86 
 
 		 523 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  37.86 
 
 		 523 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  37.86 
 
 		 523 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  37.76 
 
 		 523 aa  318  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  38.26 
 
 		 531 aa  317  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1059  transposase IS66  38.66 
 
 		 579 aa  316  7e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.591253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1088  transposase IS66  38.66 
 
 		 579 aa  316  7e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1366  transposase IS66  38.66 
 
 		 579 aa  316  7e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543753 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1482  transposase IS66  38.66 
 
 		 579 aa  316  7e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216681 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  37.65 
 
 		 523 aa  315  9e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51550  putative transposase  50.16 
 
 		 366 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000328821  hitchhiker  0.0000539108 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4877  transposase IS66  38.06 
 
 		 529 aa  306  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386958  normal  0.659358 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  37.5 
 
 		 520 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0693  transposase  36.94 
 
 		 537 aa  302  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0259  transposase  37.56 
 
 		 522 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0154331 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3724  hypothetical protein  37.99 
 
 		 527 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  40.57 
 
 		 508 aa  292  8e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  36.97 
 
 		 516 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5535  transposase IS66  37.45 
 
 		 537 aa  286  8e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  38.53 
 
 		 491 aa  285  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8372  transposase IS66  39.14 
 
 		 505 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6322  transposase IS66  39.14 
 
 		 505 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4341  transposase IS66  39.14 
 
 		 505 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0078  transposase family  36.32 
 
 		 533 aa  283  5.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  7.38697e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  37.53 
 
 		 510 aa  282  9e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6513  transposase IS66  33.76 
 
 		 521 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0611457 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1086  transposase family  36.8 
 
 		 521 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6486  transposase IS66  34.42 
 
 		 522 aa  273  5.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212807  normal  0.436333 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4021  transposase IS66  41.52 
 
 		 366 aa  272  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0659  transposase IS66  36.96 
 
 		 514 aa  272  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9623  transposase  36.42 
 
 		 539 aa  270  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264971  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1757  IS66 family transposase  35.31 
 
 		 523 aa  270  5e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3368  IS66 family transposase  35.31 
 
 		 523 aa  270  5e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4879  IS66 family transposase  35.31 
 
 		 523 aa  270  5e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0063  IS66 family transposase  35.31 
 
 		 523 aa  270  5e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.394688  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0005  IS66 family transposase  35.31 
 
 		 523 aa  270  5e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0047  IS66 family transposase  35.31 
 
 		 523 aa  270  5e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.637398  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3126  IS66 family transposase orfB  35.23 
 
 		 524 aa  268  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  36.54 
 
 		 694 aa  266  8.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0171  transposase IS66  35.84 
 
 		 523 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0431  transposase IS66  35.84 
 
 		 523 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0146215 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0915  transposase IS66  35.84 
 
 		 523 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.137432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1419  transposase IS66  35.84 
 
 		 523 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3715  IS66 Orf2 family protein  35.84 
 
 		 523 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3722  hypothetical protein  35.84 
 
 		 523 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3763  hypothetical protein  35.84 
 
 		 523 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.727828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4305  hypothetical protein  35.84 
 
 		 523 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4308  hypothetical protein  35.84 
 
 		 523 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3516  IS66 Orf2 family protein  35.84 
 
 		 513 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.578775  normal  0.957908 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1783  transposase IS66  36.32 
 
 		 530 aa  263  4e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4660  IS66 family element, transposase  33.12 
 
 		 512 aa  263  4e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1536  transposase IS66  36.54 
 
 		 530 aa  263  6e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.881033  normal  0.856435 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0707  IS66 family element, transposase  32.91 
 
 		 512 aa  263  6e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1866  IS66 family element, transposase  32.91 
 
 		 512 aa  263  6e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.324382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4625  IS66 family element, transposase  32.91 
 
 		 512 aa  263  6e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  32.91 
 
 		 512 aa  263  6e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  32.91 
 
 		 512 aa  263  6e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0510  IS66 family element, transposase  32.91 
 
 		 512 aa  263  6e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>