More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4641 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008758  Pnap_4449  transposase IS66  88.35 
 
 
528 aa  835    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.543683  normal  0.0438734 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4641  transposase IS66  100 
 
 
477 aa  987    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4705  transposase IS66  99.56 
 
 
468 aa  944    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465239  normal  0.0997646 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4709  transposase IS66  99.56 
 
 
497 aa  938    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276755  normal  0.140797 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6939  transposase IS66  46.19 
 
 
517 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1170  transposase IS66  47.12 
 
 
507 aa  412  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.438673  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3059  transposase IS66  47.12 
 
 
507 aa  412  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2711  transposase IS66  47.53 
 
 
506 aa  409  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2975  transposase IS66  46.27 
 
 
509 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1485  transposase IS66  46.27 
 
 
509 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000322511 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0833  transposase IS66  46.27 
 
 
509 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.423143 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3322  transposase IS66  46.27 
 
 
509 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2669  transposase IS66  46.27 
 
 
509 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870521  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1170  transposase IS66  46.27 
 
 
509 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.934596  normal  0.320109 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2416  IS66 family transposase  45.91 
 
 
540 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.521306  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3794  putative transposase  45.91 
 
 
540 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1865  transposase IS66  45.91 
 
 
540 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223463  normal  0.192922 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5982  transposase IS66  49.42 
 
 
523 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4443  ISPpu14, transposase Orf3  47.34 
 
 
511 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.801949  hitchhiker  0.0000589528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5396  ISPpu14, transposase Orf3  47.34 
 
 
511 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118381  hitchhiker  0.00957485 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0572  transposase IS66  46.58 
 
 
504 aa  392  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0648577 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2455  transposase IS66  46.58 
 
 
504 aa  392  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2916  transposase IS66  46.58 
 
 
504 aa  392  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397115  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3501  ISPpu14, transposase Orf3  47.34 
 
 
511 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3981  ISPpu14, transposase Orf3  47.34 
 
 
511 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0385183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4439  ISPpu14, transposase Orf3  47.34 
 
 
511 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414491  hitchhiker  0.0000684735 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5173  transposase IS66  45.93 
 
 
511 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59580  putative transposase  46.88 
 
 
511 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128729  hitchhiker  1.83127e-18 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3964  ISPpu14, transposase Orf3  46.65 
 
 
511 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0893475 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0037  transposase IS66  46.65 
 
 
511 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.321823 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1022  transposase IS66  43.89 
 
 
519 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1401  transposase IS66  43.89 
 
 
519 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2523  transposase IS66  43.89 
 
 
517 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297904  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  40.24 
 
 
545 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  40.24 
 
 
545 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  39.76 
 
 
545 aa  311  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  39.76 
 
 
545 aa  311  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  39.76 
 
 
545 aa  311  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  39.76 
 
 
545 aa  311  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  39.49 
 
 
532 aa  300  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  38.11 
 
 
531 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4877  transposase IS66  38.63 
 
 
529 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386958  normal  0.659358 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  37.44 
 
 
523 aa  289  9e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  37.44 
 
 
523 aa  289  9e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  37.44 
 
 
523 aa  289  9e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  37.44 
 
 
523 aa  289  9e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  37.44 
 
 
523 aa  289  9e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  37.33 
 
 
523 aa  288  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0693  transposase  37.36 
 
 
537 aa  288  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  37.22 
 
 
523 aa  286  8e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1059  transposase IS66  37.27 
 
 
579 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.591253  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1088  transposase IS66  37.27 
 
 
579 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1366  transposase IS66  37.27 
 
 
579 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0543753 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1482  transposase IS66  37.27 
 
 
579 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.216681 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51550  putative transposase  49.32 
 
 
366 aa  279  7e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000328821  hitchhiker  0.0000539108 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3724  hypothetical protein  37.28 
 
 
527 aa  279  7e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  36.96 
 
 
520 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0259  transposase  37.62 
 
 
522 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0154331 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4021  transposase IS66  43.04 
 
 
366 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6322  transposase IS66  39.37 
 
 
505 aa  269  7e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8372  transposase IS66  39.37 
 
 
505 aa  269  7e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4341  transposase IS66  39.37 
 
 
505 aa  269  7e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  37.41 
 
 
510 aa  266  5.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  40.39 
 
 
508 aa  266  8e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5535  transposase IS66  37.12 
 
 
537 aa  265  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  36.82 
 
 
516 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  38.21 
 
 
491 aa  260  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0078  transposase family  36.05 
 
 
533 aa  258  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  7.38697e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0659  transposase IS66  36.61 
 
 
514 aa  256  5e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1190  transposase IS66  44.37 
 
 
435 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.808109  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9623  transposase  36.53 
 
 
539 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264971  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0171  transposase IS66  36.38 
 
 
523 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0431  transposase IS66  36.38 
 
 
523 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0146215 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0915  transposase IS66  36.38 
 
 
523 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.137432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1419  transposase IS66  36.38 
 
 
523 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3715  IS66 Orf2 family protein  36.38 
 
 
523 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3722  hypothetical protein  36.38 
 
 
523 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3763  hypothetical protein  36.38 
 
 
523 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.727828  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4305  hypothetical protein  36.38 
 
 
523 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4308  hypothetical protein  36.38 
 
 
523 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3983  transposase IS66  35.56 
 
 
461 aa  253  5.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3516  IS66 Orf2 family protein  36.38 
 
 
513 aa  253  6e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.578775  normal  0.957908 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4165  transposase IS66  35.1 
 
 
523 aa  251  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.699531  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6513  transposase IS66  33.33 
 
 
521 aa  249  9e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0611457 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  35.56 
 
 
694 aa  246  6e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0185  IS66 family transposase  35.95 
 
 
520 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1223  IS66 family transposase  35.95 
 
 
520 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6486  transposase IS66  33.79 
 
 
522 aa  244  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212807  normal  0.436333 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1783  transposase IS66  36.6 
 
 
530 aa  243  3.9999999999999997e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1536  transposase IS66  36.83 
 
 
530 aa  243  6e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.881033  normal  0.856435 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1757  IS66 family transposase  34.92 
 
 
523 aa  242  9e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3368  IS66 family transposase  34.92 
 
 
523 aa  242  9e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0005  IS66 family transposase  34.92 
 
 
523 aa  242  9e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0047  IS66 family transposase  34.92 
 
 
523 aa  242  9e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.637398  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0063  IS66 family transposase  34.92 
 
 
523 aa  242  9e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.394688  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4879  IS66 family transposase  34.92 
 
 
523 aa  242  9e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4660  IS66 family element, transposase  33.03 
 
 
512 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3126  IS66 family transposase orfB  34.84 
 
 
524 aa  240  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2964  IS66 family element, transposase  32.81 
 
 
512 aa  240  5e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3413  IS66 family element, transposase  32.81 
 
 
512 aa  240  5e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>