More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4439 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1170  transposase IS66  65.17 
 
 		 509 aa  703    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.934596  normal  0.320109 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3501  ISPpu14, transposase Orf3  100 
 
 		 511 aa  1058    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3964  ISPpu14, transposase Orf3  97.06 
 
 		 511 aa  981    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0893475 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3981  ISPpu14, transposase Orf3  100 
 
 		 511 aa  1058    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0385183 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1485  transposase IS66  65.17 
 
 		 509 aa  703    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000322511 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4439  ISPpu14, transposase Orf3  100 
 
 		 511 aa  1058    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414491  hitchhiker  0.0000684735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4443  ISPpu14, transposase Orf3  97.46 
 
 		 511 aa  985    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.801949  hitchhiker  0.0000589528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5396  ISPpu14, transposase Orf3  97.46 
 
 		 511 aa  985    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118381  hitchhiker  0.00957485 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3322  transposase IS66  65.17 
 
 		 509 aa  703    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6939  transposase IS66  64.64 
 
 		 517 aa  693    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2523  transposase IS66  61.78 
 
 		 517 aa  667    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297904  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0833  transposase IS66  65.17 
 
 		 509 aa  703    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423143 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5173  transposase IS66  87.08 
 
 		 511 aa  895    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1170  transposase IS66  62.62 
 
 		 507 aa  669    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.438673  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2711  transposase IS66  61.88 
 
 		 506 aa  665    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3059  transposase IS66  62.62 
 
 		 507 aa  669    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2416  IS66 family transposase  64.3 
 
 		 540 aa  698    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.521306  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3794  putative transposase  64.49 
 
 		 540 aa  699    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1865  transposase IS66  64.49 
 
 		 540 aa  699    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223463  normal  0.192922 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2669  transposase IS66  65.17 
 
 		 509 aa  703    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870521  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59580  putative transposase  95.48 
 
 		 511 aa  958    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128729  hitchhiker  1.83127e-18 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1401  transposase IS66  61.78 
 
 		 519 aa  666    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2975  transposase IS66  65.17 
 
 		 509 aa  703    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0037  transposase IS66  97.65 
 
 		 511 aa  987    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.321823 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1022  transposase IS66  61.78 
 
 		 519 aa  666    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5982  transposase IS66  59.23 
 
 		 523 aa  613  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51550  putative transposase  97.95 
 
 		 366 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000328821  hitchhiker  0.0000539108 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0572  transposase IS66  59.27 
 
 		 504 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0648577 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2455  transposase IS66  59.27 
 
 		 504 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2916  transposase IS66  59.27 
 
 		 504 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4021  transposase IS66  67.45 
 
 		 366 aa  492  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4449  transposase IS66  48.93 
 
 		 528 aa  484  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.543683  normal  0.0438734 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1059  transposase IS66  50.57 
 
 		 579 aa  451  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.591253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1088  transposase IS66  50.57 
 
 		 579 aa  451  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1366  transposase IS66  50.57 
 
 		 579 aa  451  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543753 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1482  transposase IS66  50.57 
 
 		 579 aa  451  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216681 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4709  transposase IS66  47.82 
 
 		 497 aa  430  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276755  normal  0.140797 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  43.03 
 
 		 545 aa  405  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  42.83 
 
 		 545 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  42.83 
 
 		 545 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  42.83 
 
 		 545 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  43.03 
 
 		 545 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4641  transposase IS66  47.14 
 
 		 477 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4705  transposase IS66  47.14 
 
 		 468 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465239  normal  0.0997646 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  42.83 
 
 		 545 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  42.74 
 
 		 531 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  43 
 
 		 532 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  44.21 
 
 		 508 aa  375  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1190  transposase IS66  57.56 
 
 		 435 aa  365  1e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.808109  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  41.93 
 
 		 520 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  40.75 
 
 		 523 aa  363  4e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  40.75 
 
 		 523 aa  363  4e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  40.75 
 
 		 523 aa  363  4e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  40.75 
 
 		 523 aa  363  4e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  40.75 
 
 		 523 aa  363  4e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  40.55 
 
 		 523 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  41.31 
 
 		 523 aa  362  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  39.15 
 
 		 516 aa  342  8e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  41.04 
 
 		 491 aa  338  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6513  transposase IS66  35.85 
 
 		 521 aa  335  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0611457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6726  transposase  38.01 
 
 		 556 aa  332  8e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3413  IS66 family element, transposase  38.02 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2109  IS66 family element, transposase  38.02 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1584  IS66 family element, transposase  38.02 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1117  IS66 family element, transposase  38.02 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2364  IS66 family element, transposase  38.02 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3096  IS66 family element, transposase  38.02 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.147891  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3448  IS66 family element, transposase  38.02 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2618  IS66 family element, transposase  38.02 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2636  IS66 family element, transposase  38.02 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0147268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  38.02 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0712  IS66 family element, transposase  38.02 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0193  IS66 family element, transposase  38.02 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2601  IS66 family element, transposase  38.02 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  38.02 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  38.02 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2947  IS66 family element, transposase  38.02 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0017  IS66 family element, transposase  38.02 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0707  IS66 family element, transposase  38.02 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0510  IS66 family element, transposase  38.02 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1653  IS66 family element, transposase  38.02 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4625  IS66 family element, transposase  38.02 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2964  IS66 family element, transposase  38.02 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  38.02 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3675  IS66 family element, transposase  38.02 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2413  IS66 family element, transposase  38.02 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2711  IS66 family element, transposase  38.02 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.292603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1866  IS66 family element, transposase  38.02 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.324382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3708  IS66 family element, transposase  38.02 
 
 		 512 aa  330  4e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00019301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  38.02 
 
 		 512 aa  330  4e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0228  IS66 family element, transposase  38.02 
 
 		 512 aa  330  4e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1523  IS66 family element, transposase  38.02 
 
 		 512 aa  330  4e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0259  transposase  38.74 
 
 		 522 aa  330  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0154331 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4197  IS66 family element, transposase  38.02 
 
 		 512 aa  330  4e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4660  IS66 family element, transposase  37.82 
 
 		 512 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4652  IS66 family element, transposase  37.82 
 
 		 512 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6486  transposase IS66  34.96 
 
 		 522 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212807  normal  0.436333 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0146  IS66 family element, transposase  37.82 
 
 		 512 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0038  IS66 family transposase  38.02 
 
 		 512 aa  327  3e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0019  IS66 family transposase  38.02 
 
 		 512 aa  327  3e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>