More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2416 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_3322  transposase IS66  67.62 
 
 
509 aa  734    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3501  ISPpu14, transposase Orf3  66.25 
 
 
511 aa  664    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3964  ISPpu14, transposase Orf3  67.29 
 
 
511 aa  673    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0893475 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3981  ISPpu14, transposase Orf3  66.25 
 
 
511 aa  664    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0385183 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0833  transposase IS66  67.62 
 
 
509 aa  734    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.423143 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4439  ISPpu14, transposase Orf3  66.25 
 
 
511 aa  664    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414491  hitchhiker  0.0000684735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4443  ISPpu14, transposase Orf3  66.53 
 
 
511 aa  663    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.801949  hitchhiker  0.0000589528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5396  ISPpu14, transposase Orf3  66.53 
 
 
511 aa  663    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118381  hitchhiker  0.00957485 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1170  transposase IS66  67.62 
 
 
509 aa  734    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.934596  normal  0.320109 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0037  transposase IS66  67.49 
 
 
511 aa  674    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.321823 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5982  transposase IS66  62.19 
 
 
523 aa  664    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1485  transposase IS66  67.62 
 
 
509 aa  734    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000322511 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1401  transposase IS66  63.17 
 
 
519 aa  685    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6939  transposase IS66  81.47 
 
 
517 aa  881    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5173  transposase IS66  63.22 
 
 
511 aa  664    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1170  transposase IS66  63.35 
 
 
507 aa  683    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.438673  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2711  transposase IS66  63.73 
 
 
506 aa  669    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3059  transposase IS66  63.35 
 
 
507 aa  683    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2416  IS66 family transposase  100 
 
 
540 aa  1112    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.521306  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3794  putative transposase  99.81 
 
 
540 aa  1111    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1865  transposase IS66  99.81 
 
 
540 aa  1111    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223463  normal  0.192922 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2669  transposase IS66  67.62 
 
 
509 aa  734    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870521  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1022  transposase IS66  63.17 
 
 
519 aa  685    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59580  putative transposase  66.74 
 
 
511 aa  669    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128729  hitchhiker  1.83127e-18 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2523  transposase IS66  63.17 
 
 
517 aa  685    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297904  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2975  transposase IS66  67.62 
 
 
509 aa  734    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0572  transposase IS66  56.74 
 
 
504 aa  608  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0648577 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2455  transposase IS66  56.74 
 
 
504 aa  608  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2916  transposase IS66  56.74 
 
 
504 aa  608  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397115  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4449  transposase IS66  50.57 
 
 
528 aa  513  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.543683  normal  0.0438734 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1482  transposase IS66  44.99 
 
 
579 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.216681 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1088  transposase IS66  44.99 
 
 
579 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1366  transposase IS66  44.99 
 
 
579 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0543753 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1059  transposase IS66  44.99 
 
 
579 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.591253  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4021  transposase IS66  64.09 
 
 
366 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51550  putative transposase  72.01 
 
 
366 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000328821  hitchhiker  0.0000539108 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4709  transposase IS66  47.15 
 
 
497 aa  433  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276755  normal  0.140797 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  42.35 
 
 
545 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4641  transposase IS66  45.91 
 
 
477 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4705  transposase IS66  46.06 
 
 
468 aa  401  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465239  normal  0.0997646 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  41.42 
 
 
545 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  41.42 
 
 
545 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  41.42 
 
 
545 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  41.42 
 
 
545 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  41.6 
 
 
545 aa  397  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1190  transposase IS66  60.38 
 
 
435 aa  388  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.808109  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  40.19 
 
 
531 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  43.92 
 
 
508 aa  365  1e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  41.18 
 
 
532 aa  364  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0422  transposase IS66  68.15 
 
 
274 aa  361  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  41.44 
 
 
520 aa  353  5e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  40.7 
 
 
523 aa  350  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  40.7 
 
 
523 aa  350  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  40.7 
 
 
523 aa  350  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  40.7 
 
 
523 aa  350  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  40.7 
 
 
523 aa  350  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  40.7 
 
 
523 aa  349  6e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  40.5 
 
 
523 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1086  transposase family  38.31 
 
 
521 aa  339  7e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  41.44 
 
 
491 aa  338  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0259  transposase  40.5 
 
 
522 aa  335  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0154331 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0710  transposase IS66  67.51 
 
 
242 aa  332  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5535  transposase IS66  37.86 
 
 
537 aa  324  3e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  39.76 
 
 
516 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  39.1 
 
 
510 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6513  transposase IS66  35.59 
 
 
521 aa  319  7.999999999999999e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0611457 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1523  IS66 family element, transposase  37.1 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2109  IS66 family element, transposase  37.1 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1653  IS66 family element, transposase  37.1 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  37.1 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0712  IS66 family element, transposase  37.1 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1117  IS66 family element, transposase  37.1 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1584  IS66 family element, transposase  37.1 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  37.1 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3708  IS66 family element, transposase  37.1 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00019301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  37.1 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2364  IS66 family element, transposase  37.1 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1866  IS66 family element, transposase  37.1 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.324382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  37.1 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0017  IS66 family element, transposase  37.1 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2413  IS66 family element, transposase  37.1 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4197  IS66 family element, transposase  37.1 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0707  IS66 family element, transposase  37.1 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  37.1 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0510  IS66 family element, transposase  37.1 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4976  transposase IS66  36.85 
 
 
531 aa  318  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000420547  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3675  IS66 family element, transposase  37.1 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0228  IS66 family element, transposase  37.1 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0193  IS66 family element, transposase  37.1 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4625  IS66 family element, transposase  37.1 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2601  IS66 family element, transposase  37.1 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2618  IS66 family element, transposase  37.1 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2636  IS66 family element, transposase  37.1 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0147268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2711  IS66 family element, transposase  37.1 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.292603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2947  IS66 family element, transposase  37.1 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2964  IS66 family element, transposase  37.1 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3096  IS66 family element, transposase  37.1 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.147891  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3413  IS66 family element, transposase  37.1 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3448  IS66 family element, transposase  37.1 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5043  IS66 family element, transposase  38.48 
 
 
512 aa  317  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>