More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_51550 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_51550  putative transposase  100 
 
 
366 aa  755    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000328821  hitchhiker  0.0000539108 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3964  ISPpu14, transposase Orf3  99.66 
 
 
511 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0893475 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0037  transposase IS66  98.98 
 
 
511 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.321823 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3501  ISPpu14, transposase Orf3  97.95 
 
 
511 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3981  ISPpu14, transposase Orf3  97.95 
 
 
511 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0385183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4439  ISPpu14, transposase Orf3  97.95 
 
 
511 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414491  hitchhiker  0.0000684735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4443  ISPpu14, transposase Orf3  96.25 
 
 
511 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.801949  hitchhiker  0.0000589528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5396  ISPpu14, transposase Orf3  96.25 
 
 
511 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118381  hitchhiker  0.00957485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59580  putative transposase  96.25 
 
 
511 aa  590  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128729  hitchhiker  1.83127e-18 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5173  transposase IS66  91.47 
 
 
511 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3794  putative transposase  72.35 
 
 
540 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1865  transposase IS66  72.35 
 
 
540 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223463  normal  0.192922 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6939  transposase IS66  71.33 
 
 
517 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2416  IS66 family transposase  72.01 
 
 
540 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.521306  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0833  transposase IS66  66.88 
 
 
509 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.423143 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1170  transposase IS66  66.88 
 
 
509 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.934596  normal  0.320109 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2975  transposase IS66  66.88 
 
 
509 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3322  transposase IS66  66.88 
 
 
509 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1485  transposase IS66  66.88 
 
 
509 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000322511 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2669  transposase IS66  66.88 
 
 
509 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870521  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1170  transposase IS66  67.24 
 
 
507 aa  432  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.438673  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3059  transposase IS66  67.24 
 
 
507 aa  432  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2711  transposase IS66  66.89 
 
 
506 aa  429  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1401  transposase IS66  66.44 
 
 
519 aa  423  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2523  transposase IS66  66.44 
 
 
517 aa  423  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297904  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1022  transposase IS66  66.44 
 
 
519 aa  423  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0572  transposase IS66  65.2 
 
 
504 aa  395  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0648577 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2455  transposase IS66  65.2 
 
 
504 aa  395  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2916  transposase IS66  65.2 
 
 
504 aa  395  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397115  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5982  transposase IS66  65.44 
 
 
523 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1482  transposase IS66  52.44 
 
 
579 aa  331  1e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.216681 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1366  transposase IS66  52.44 
 
 
579 aa  331  1e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0543753 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1088  transposase IS66  52.44 
 
 
579 aa  331  1e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1059  transposase IS66  52.44 
 
 
579 aa  331  1e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.591253  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4449  transposase IS66  53.22 
 
 
528 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.543683  normal  0.0438734 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4709  transposase IS66  50.16 
 
 
497 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276755  normal  0.140797 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4641  transposase IS66  49.32 
 
 
477 aa  279  6e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4705  transposase IS66  49.32 
 
 
468 aa  279  6e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465239  normal  0.0997646 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4021  transposase IS66  69.44 
 
 
366 aa  271  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  48.34 
 
 
531 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  48.5 
 
 
532 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  44.9 
 
 
545 aa  264  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  48 
 
 
520 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  44.56 
 
 
545 aa  258  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  44.56 
 
 
545 aa  258  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  44.56 
 
 
545 aa  258  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  44.56 
 
 
545 aa  258  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  44.56 
 
 
545 aa  258  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  45 
 
 
523 aa  256  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  45 
 
 
523 aa  256  5e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  45 
 
 
523 aa  256  5e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  45 
 
 
523 aa  256  5e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  45 
 
 
523 aa  256  5e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  45 
 
 
523 aa  256  5e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  45.96 
 
 
508 aa  256  6e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  45 
 
 
523 aa  256  6e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6513  transposase IS66  43.85 
 
 
521 aa  255  8e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0611457 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6486  transposase IS66  43.85 
 
 
522 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212807  normal  0.436333 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0416  transposase IS66  60.73 
 
 
194 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0584328 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0259  transposase  41.97 
 
 
522 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0154331 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3593  transposase IS66  44 
 
 
404 aa  241  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.324594  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0078  transposase family  41 
 
 
533 aa  239  6.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  7.38697e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3126  IS66 family transposase orfB  43.42 
 
 
524 aa  238  9e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0005  IS66 family transposase  43.09 
 
 
523 aa  237  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0063  IS66 family transposase  43.09 
 
 
523 aa  237  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.394688  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0047  IS66 family transposase  43.09 
 
 
523 aa  237  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.637398  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  43.56 
 
 
491 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1757  IS66 family transposase  43.09 
 
 
523 aa  237  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3368  IS66 family transposase  43.09 
 
 
523 aa  237  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4879  IS66 family transposase  43.09 
 
 
523 aa  237  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0638  transposase IS66  41.41 
 
 
514 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  43 
 
 
516 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5043  IS66 family element, transposase  44.33 
 
 
512 aa  235  9e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2224  IS66 family element, transposase  44.33 
 
 
512 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101822  hitchhiker  0.0000000000417229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1812  IS66 family element, transposase  44.33 
 
 
512 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.438062  hitchhiker  0.000000148464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2841  IS66 family element, transposase  44.33 
 
 
512 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0678669  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1308  IS66 family element, transposase  44.33 
 
 
512 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.796856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4292  IS66 family element, transposase  44.33 
 
 
512 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0344  IS66 family element, transposase  44.33 
 
 
512 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000788528  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1183  IS66 family element, transposase  44.33 
 
 
512 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0712  IS66 family element, transposase  42.67 
 
 
512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1653  IS66 family element, transposase  42.67 
 
 
512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1523  IS66 family element, transposase  42.67 
 
 
512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  42.67 
 
 
512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  42.67 
 
 
512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3384  IS66 family transposase  44 
 
 
512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1760  IS66 family transposase  44 
 
 
512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0839939  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  42.67 
 
 
512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0707  IS66 family element, transposase  42.67 
 
 
512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  42.67 
 
 
512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0510  IS66 family element, transposase  42.67 
 
 
512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3413  IS66 family element, transposase  42.67 
 
 
512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4860  IS66 family transposase  44 
 
 
512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  42.67 
 
 
512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1407  IS66 family transposase  44 
 
 
512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2601  IS66 family element, transposase  42.67 
 
 
512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2618  IS66 family element, transposase  42.67 
 
 
512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2711  IS66 family element, transposase  42.67 
 
 
512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.292603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2413  IS66 family element, transposase  42.67 
 
 
512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2636  IS66 family element, transposase  42.67 
 
 
512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0147268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>