More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2281 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0704  transposase IS66  63.76 
 
 
523 aa  683    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0762527  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0201  transposase IS66  63.57 
 
 
523 aa  680    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.228467  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2203  transposase  83.78 
 
 
530 aa  937    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2211  transposase  83.78 
 
 
530 aa  937    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2281  transposase  100 
 
 
527 aa  1095    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2336  transposase IS66  67 
 
 
397 aa  583  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3056  transposase IS66  52.27 
 
 
529 aa  565  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1836  transposase IS66  42.88 
 
 
529 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000394472  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2627  transposase IS66  42.69 
 
 
529 aa  437  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2707  transposase IS66  42.69 
 
 
529 aa  437  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0584857  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2970  transposase IS66  42.69 
 
 
529 aa  437  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0501517  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0638  transposase IS66  42.74 
 
 
514 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0515  transposase IS66  40.78 
 
 
511 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.016162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0610  transposase IS66  42.54 
 
 
514 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6337  transposase IS66  40.2 
 
 
544 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2611  transposase  41.81 
 
 
495 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0848316  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0751  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0229  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2404  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2753  transposase  42.01 
 
 
495 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0515  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0219  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806088  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0069  transposase  42.01 
 
 
495 aa  369  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0046  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539045  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0335  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.137589  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2163  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.94613  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0291  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1205  transposase  42.01 
 
 
495 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1061  transposase  42.01 
 
 
495 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.336401  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1780  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.175929  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1442  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.612647  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1930  transposase  42.01 
 
 
495 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.897519  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0031  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2042  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1747  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0214  transposase  42.01 
 
 
495 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0437  transposase  42.01 
 
 
495 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0236  transposase  42.01 
 
 
495 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0811  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.973056  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1280  transposase  42.01 
 
 
495 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.653734  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0783  transposase  42.01 
 
 
495 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00157857  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0973  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.255905  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2707  transposase  41.81 
 
 
495 aa  369  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2684  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0678358  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0991  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1576  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0270  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2598  transposase  42.01 
 
 
495 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1664  transposase  42.01 
 
 
495 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0243  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1656  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.413998  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2262  transposase  42.01 
 
 
495 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.630405  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0115  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0144  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.201351  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2178  transposase  42.01 
 
 
495 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2759  transposase  42.01 
 
 
495 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2732  transposase  42.01 
 
 
495 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0876  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2943  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2953  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0175  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0389  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.784387  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0470  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2250  transposase  41.81 
 
 
495 aa  366  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751402  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0236  transposase  41.81 
 
 
495 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2264  transposase  42.01 
 
 
495 aa  366  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.619364  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2114  transposase  42.01 
 
 
495 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0098  transposase  42.01 
 
 
495 aa  369  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1007  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1018  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1050  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0764997  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1090  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.601639  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0833  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.65936  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0023  transposase  42.01 
 
 
495 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1417  transposase  42.01 
 
 
495 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0928  transposase  42.01 
 
 
495 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.977799  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2882  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1672  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.586592  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2486  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.267041  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0080  transposase  42.01 
 
 
495 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1293  transposase  41.81 
 
 
495 aa  364  2e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.185567  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3114  ISPpu13, transposase Orf2  39.73 
 
 
510 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90064  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3985  ISPpu13, transposase Orf2  39.73 
 
 
510 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.757297  hitchhiker  0.00792894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3220  ISPsy5, transposase  39.65 
 
 
503 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.221861  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2982  transposase IS66  51.9 
 
 
370 aa  354  2e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.545749  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  41.36 
 
 
694 aa  353  2.9999999999999997e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0065  putative transposase  39.31 
 
 
526 aa  353  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0077  putative ISPpu13, transposase Orf2  39.31 
 
 
526 aa  353  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.247033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3736  putative transposase  39.31 
 
 
526 aa  353  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1783  transposase IS66  41.15 
 
 
530 aa  353  4e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1536  transposase IS66  41.36 
 
 
530 aa  353  5e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.881033  normal  0.856435 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02979  hypothetical protein  42.39 
 
 
514 aa  352  7e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06986  hypothetical protein  42.18 
 
 
522 aa  352  1e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01103  hypothetical protein  41.28 
 
 
513 aa  352  1e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01626  hypothetical protein  42.39 
 
 
522 aa  351  1e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1984  transposase IS66  40.91 
 
 
526 aa  352  1e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547689  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2184  transposase IS66  40.91 
 
 
526 aa  352  1e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000882375  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2630  transposase IS66  41.49 
 
 
526 aa  352  1e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00176311  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2663  transposase IS66  41.49 
 
 
526 aa  352  1e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01487  hypothetical protein  42.39 
 
 
517 aa  351  1e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>