More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0515 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0515  transposase IS66  100 
 
 
511 aa  1071    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.016162  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2970  transposase IS66  44.34 
 
 
529 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0501517  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2707  transposase IS66  44.34 
 
 
529 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0584857  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2627  transposase IS66  44.34 
 
 
529 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1836  transposase IS66  44.34 
 
 
529 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000394472  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2203  transposase  41.26 
 
 
530 aa  403  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2211  transposase  41.26 
 
 
530 aa  403  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2281  transposase  40.78 
 
 
527 aa  390  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0704  transposase IS66  42.35 
 
 
523 aa  388  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0762527  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0201  transposase IS66  42.16 
 
 
523 aa  385  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.228467  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1437  transposase IS66  44.62 
 
 
464 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3056  transposase IS66  39.29 
 
 
529 aa  368  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2336  transposase IS66  44.02 
 
 
397 aa  359  7e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0638  transposase IS66  36.04 
 
 
514 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0929  transposase IS66  35.96 
 
 
516 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0524356  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0642  transposase IS66  35.96 
 
 
516 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153379  normal  0.0230063 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0610  transposase IS66  36.04 
 
 
514 aa  306  7e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3114  ISPpu13, transposase Orf2  35.79 
 
 
510 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90064  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3985  ISPpu13, transposase Orf2  35.79 
 
 
510 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.757297  hitchhiker  0.00792894 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2264  transposase  36.84 
 
 
495 aa  298  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.619364  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0098  transposase  36.65 
 
 
495 aa  297  3e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0069  transposase  36.65 
 
 
495 aa  297  3e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1930  transposase  36.84 
 
 
495 aa  297  3e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.897519  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0637  ISPpu15, transposase Orf2  35.79 
 
 
510 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4025  ISPpu15, transposase Orf2  35.79 
 
 
510 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.358489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4745  ISPpu15, transposase Orf2  35.79 
 
 
510 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.551625  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1293  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  4e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.185567  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1656  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.413998  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1672  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.586592  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0783  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00157857  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1442  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.612647  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1576  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0219  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806088  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0175  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0751  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1090  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.601639  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1050  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0764997  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0229  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0080  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0470  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0515  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0389  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.784387  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0876  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0833  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.65936  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0991  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0973  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.255905  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1018  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1007  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0115  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1780  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.175929  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0437  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1280  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.653734  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0214  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0236  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1664  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1747  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2262  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.630405  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1205  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2178  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0144  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.201351  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0291  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0811  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.973056  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2486  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.267041  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2404  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2732  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2684  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0678358  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2953  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0023  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0031  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1417  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0046  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539045  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2943  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2759  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2163  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.94613  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2042  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0270  transposase  36.65 
 
 
495 aa  296  6e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0928  transposase  36.72 
 
 
495 aa  296  6e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.977799  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2598  transposase  36.72 
 
 
495 aa  296  6e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2753  transposase  36.72 
 
 
495 aa  296  6e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1061  transposase  36.72 
 
 
495 aa  296  6e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.336401  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4091  ISPpu15, transposase Orf2  35.58 
 
 
510 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0162386 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2611  transposase  36.45 
 
 
495 aa  296  7e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0848316  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2707  transposase  36.52 
 
 
495 aa  296  8e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0236  transposase  36.45 
 
 
495 aa  295  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2250  transposase  36.52 
 
 
495 aa  295  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751402  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2882  transposase  36.65 
 
 
495 aa  295  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2114  transposase  36.72 
 
 
495 aa  295  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0335  transposase  36.52 
 
 
495 aa  293  4e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.137589  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0243  transposase  36.45 
 
 
495 aa  293  5e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6337  transposase IS66  35.81 
 
 
544 aa  292  9e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3220  ISPsy5, transposase  33.66 
 
 
503 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.221861  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1783  transposase IS66  33.59 
 
 
530 aa  286  7e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  33.59 
 
 
694 aa  286  8e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1719  transposase IS66  34.91 
 
 
506 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.702381  hitchhiker  0.0000463056 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4792  transposase IS66  34.91 
 
 
506 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0522  transposase IS66  34.91 
 
 
506 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117674  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1536  transposase IS66  33.21 
 
 
530 aa  283  6.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.881033  normal  0.856435 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0039  ISPsy5, transposase  34.97 
 
 
517 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0196  ISPsy5, transposase  34.97 
 
 
517 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.904246  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3651  ISPsy5, transposase  34.97 
 
 
517 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>