More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0039 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0637  ISPpu15, transposase Orf2  85.69 
 
 		 510 aa  908    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3114  ISPpu13, transposase Orf2  74.22 
 
 		 510 aa  800    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90064  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0522  transposase IS66  87.35 
 
 		 506 aa  925    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1719  transposase IS66  87.35 
 
 		 506 aa  925    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.702381  hitchhiker  0.0000463056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3985  ISPpu13, transposase Orf2  74.22 
 
 		 510 aa  800    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.757297  hitchhiker  0.00792894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4025  ISPpu15, transposase Orf2  85.69 
 
 		 510 aa  908    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.358489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4091  ISPpu15, transposase Orf2  86.07 
 
 		 510 aa  910    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0162386 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4745  ISPpu15, transposase Orf2  85.69 
 
 		 510 aa  908    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.551625  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0035  ISPsy5, transposase  100 
 
 		 517 aa  1066    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.701861  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0039  ISPsy5, transposase  100 
 
 		 517 aa  1066    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0196  ISPsy5, transposase  100 
 
 		 517 aa  1066    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.904246  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0670  ISPsy5, transposase  100 
 
 		 517 aa  1066    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1020  ISPsy5, transposase  100 
 
 		 517 aa  1066    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1098  ISPsy5, transposase  100 
 
 		 517 aa  1066    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1189  ISPsy5, transposase  100 
 
 		 517 aa  1066    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.633516  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1227  ISPsy5, transposase  100 
 
 		 517 aa  1066    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2437  ISPsy5, transposase  100 
 
 		 517 aa  1066    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.713289  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2460  ISPsy5, transposase  100 
 
 		 517 aa  1066    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333191  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2840  ISPsy5, transposase  100 
 
 		 517 aa  1066    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0352443  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2971  ISPsy5, transposase  100 
 
 		 517 aa  1066    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3213  ISPsy5, transposase  100 
 
 		 517 aa  1066    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3216  ISPsy5, transposase  100 
 
 		 517 aa  1066    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.727249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3220  ISPsy5, transposase  75.53 
 
 		 503 aa  805    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.221861  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3613  ISPsy5, transposase  100 
 
 		 517 aa  1066    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3651  ISPsy5, transposase  100 
 
 		 517 aa  1066    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151984  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3996  ISPsy5, transposase  100 
 
 		 517 aa  1066    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222693  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3999  ISPsy5, transposase  100 
 
 		 517 aa  1066    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00912569  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4251  ISPsy5, transposase  100 
 
 		 517 aa  1066    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4389  ISPsy5, transposase  100 
 
 		 517 aa  1066    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4567  ISPsy5, transposase  100 
 
 		 517 aa  1066    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4693  ISPsy5, transposase  100 
 
 		 517 aa  1066    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4737  ISPsy5, transposase  100 
 
 		 517 aa  1066    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.39192  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4764  ISPsy5, transposase  100 
 
 		 517 aa  1066    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4994  ISPsy5, transposase  100 
 
 		 517 aa  1066    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5212  ISPsy5, transposase  100 
 
 		 517 aa  1066    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5215  ISPsy5, transposase  100 
 
 		 517 aa  1066    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5304  ISPsy5, transposase  99.81 
 
 		 517 aa  1064    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5368  ISPsy5, transposase  100 
 
 		 517 aa  1066    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5411  ISPsy5, transposase  100 
 
 		 517 aa  1066    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5443  ISPsy5, transposase  100 
 
 		 517 aa  1066    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5445  ISPsy5, transposase  100 
 
 		 517 aa  1066    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5543  ISPsy5, transposase  100 
 
 		 517 aa  1066    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5591  ISPsy5, transposase  100 
 
 		 517 aa  1066    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0434  transposase IS66  69.22 
 
 		 520 aa  709    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.543739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3638  transposase IS66  69.22 
 
 		 520 aa  709    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0036  transposase IS66  68.69 
 
 		 524 aa  708    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0431  transposase IS66  69.22 
 
 		 520 aa  709    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1548  transposase IS66  69.22 
 
 		 520 aa  709    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.446339 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1163  transposase IS66  69.22 
 
 		 520 aa  709    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230902  normal  0.467895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1050  transposase IS66  69.22 
 
 		 520 aa  709    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4114  transposase IS66  69.22 
 
 		 520 aa  709    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1988  transposase IS66  69.22 
 
 		 520 aa  709    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.317222 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0160  transposase IS66  68.95 
 
 		 522 aa  709    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3084  transposase IS66  69.22 
 
 		 520 aa  709    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.280234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4792  transposase IS66  87.35 
 
 		 506 aa  925    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1003  transposase IS66  51.34 
 
 		 581 aa  520  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1616  transposase IS66  51.34 
 
 		 581 aa  520  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.772385  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1274  transposase IS66  53.27 
 
 		 606 aa  444  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0129566 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1783  transposase IS66  48.35 
 
 		 530 aa  442  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2620  transposase IS66  46.95 
 
 		 515 aa  444  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0332564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2650  transposase IS66  46.95 
 
 		 515 aa  444  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.956476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  48.15 
 
 		 694 aa  441  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1536  transposase IS66  48.15 
 
 		 530 aa  439  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.881033  normal  0.856435 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0321  transposase IS66  45.87 
 
 		 526 aa  432  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000571248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0474  transposase IS66  45.87 
 
 		 526 aa  432  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.330634 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0656  transposase IS66  45.87 
 
 		 526 aa  432  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.762551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0662  transposase IS66  45.87 
 
 		 526 aa  432  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0971394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0677  transposase IS66  45.87 
 
 		 526 aa  432  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1790  transposase IS66  45.87 
 
 		 526 aa  432  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0368561  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1976  transposase IS66  45.87 
 
 		 526 aa  432  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.212724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1984  transposase IS66  45.87 
 
 		 526 aa  432  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2184  transposase IS66  45.87 
 
 		 526 aa  432  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000882375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2190  transposase IS66  45.87 
 
 		 526 aa  432  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3292  transposase IS66  45.87 
 
 		 526 aa  432  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.118311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2630  transposase IS66  45.87 
 
 		 526 aa  429  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00176311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2663  transposase IS66  45.87 
 
 		 526 aa  429  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2632  transposase IS66  45.47 
 
 		 488 aa  390  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0406553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1656  transposase  40.88 
 
 		 495 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.413998  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2114  transposase  40.88 
 
 		 495 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1930  transposase  41.27 
 
 		 495 aa  372  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.897519  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1293  transposase  40.88 
 
 		 495 aa  371  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.185567  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1280  transposase  40.88 
 
 		 495 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.653734  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1747  transposase  40.88 
 
 		 495 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0236  transposase  40.88 
 
 		 495 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1576  transposase  40.88 
 
 		 495 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1672  transposase  40.88 
 
 		 495 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.586592  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0144  transposase  40.88 
 
 		 495 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.201351  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2163  transposase  40.88 
 
 		 495 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.94613  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1417  transposase  40.88 
 
 		 495 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2042  transposase  40.88 
 
 		 495 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0291  transposase  40.88 
 
 		 495 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0437  transposase  40.88 
 
 		 495 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0214  transposase  40.88 
 
 		 495 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0811  transposase  40.88 
 
 		 495 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.973056  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0783  transposase  40.88 
 
 		 495 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00157857  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1205  transposase  40.88 
 
 		 495 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0115  transposase  40.88 
 
 		 495 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1664  transposase  40.88 
 
 		 495 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1442  transposase  40.88 
 
 		 495 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.612647  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1061  transposase  40.88 
 
 		 495 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.336401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>