More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2211 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0201  transposase IS66  64.59 
 
 
523 aa  690    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.228467  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0704  transposase IS66  64.79 
 
 
523 aa  692    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0762527  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2203  transposase  100 
 
 
530 aa  1103    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2211  transposase  100 
 
 
530 aa  1103    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2281  transposase  83.78 
 
 
527 aa  937    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2336  transposase IS66  68.61 
 
 
397 aa  594  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3056  transposase IS66  53.88 
 
 
529 aa  571  1e-161  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1836  transposase IS66  44.42 
 
 
529 aa  438  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000394472  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2627  transposase IS66  44.21 
 
 
529 aa  435  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2707  transposase IS66  44.21 
 
 
529 aa  435  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0584857  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2970  transposase IS66  44.21 
 
 
529 aa  435  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0501517  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0515  transposase IS66  41.26 
 
 
511 aa  403  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.016162  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0638  transposase IS66  41.95 
 
 
514 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6337  transposase IS66  40.34 
 
 
544 aa  389  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0610  transposase IS66  41.75 
 
 
514 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3220  ISPsy5, transposase  39.45 
 
 
503 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.221861  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3114  ISPpu13, transposase Orf2  38.94 
 
 
510 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90064  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3985  ISPpu13, transposase Orf2  38.94 
 
 
510 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.757297  hitchhiker  0.00792894 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0065  putative transposase  39.57 
 
 
526 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0077  putative ISPpu13, transposase Orf2  39.57 
 
 
526 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.247033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3736  putative transposase  39.57 
 
 
526 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0637  ISPpu15, transposase Orf2  41.6 
 
 
510 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4025  ISPpu15, transposase Orf2  41.6 
 
 
510 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.358489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4091  ISPpu15, transposase Orf2  41.6 
 
 
510 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0162386 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4745  ISPpu15, transposase Orf2  41.6 
 
 
510 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.551625  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2611  transposase  41.54 
 
 
495 aa  361  2e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0848316  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0069  transposase  41.73 
 
 
495 aa  361  2e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0098  transposase  41.73 
 
 
495 aa  361  2e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2707  transposase  41.54 
 
 
495 aa  361  2e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0243  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  3e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0335  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  3e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.137589  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1536  transposase IS66  39.62 
 
 
530 aa  360  3e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.881033  normal  0.856435 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2114  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  4e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2882  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  4e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  39.81 
 
 
694 aa  360  4e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0833  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.65936  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0291  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1018  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1061  transposase  41.73 
 
 
495 aa  359  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.336401  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1656  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.413998  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1442  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.612647  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0811  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.973056  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0928  transposase  41.73 
 
 
495 aa  359  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.977799  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1747  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0175  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0144  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.201351  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2404  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1576  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1007  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1780  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.175929  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2042  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0991  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1050  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0764997  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0115  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2163  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.94613  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0973  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.255905  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0046  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539045  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1672  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.586592  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0515  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0080  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0751  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1090  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.601639  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0876  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0219  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806088  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2684  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0678358  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2486  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.267041  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2598  transposase  41.73 
 
 
495 aa  359  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0389  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.784387  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0470  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0270  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0229  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2753  transposase  41.73 
 
 
495 aa  359  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2943  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2953  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0031  transposase  41.73 
 
 
495 aa  360  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1280  transposase  41.73 
 
 
495 aa  359  7e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.653734  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1205  transposase  41.73 
 
 
495 aa  359  7e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0783  transposase  41.73 
 
 
495 aa  359  7e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00157857  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1417  transposase  41.73 
 
 
495 aa  359  7e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1664  transposase  41.73 
 
 
495 aa  359  7e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0437  transposase  41.73 
 
 
495 aa  359  7e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2262  transposase  41.73 
 
 
495 aa  359  7e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.630405  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0214  transposase  41.73 
 
 
495 aa  359  7e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2732  transposase  41.73 
 
 
495 aa  359  7e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2178  transposase  41.73 
 
 
495 aa  359  7e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2630  transposase IS66  41.28 
 
 
526 aa  359  7e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00176311  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2663  transposase IS66  41.28 
 
 
526 aa  359  7e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0236  transposase  41.73 
 
 
495 aa  359  7e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2759  transposase  41.73 
 
 
495 aa  359  7e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0023  transposase  41.73 
 
 
495 aa  359  7e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1930  transposase  41.73 
 
 
495 aa  359  8e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.897519  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1984  transposase IS66  41.09 
 
 
526 aa  358  9e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547689  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2184  transposase IS66  41.09 
 
 
526 aa  358  9e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000882375  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2264  transposase  41.73 
 
 
495 aa  358  9.999999999999999e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.619364  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0236  transposase  41.54 
 
 
495 aa  358  9.999999999999999e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2250  transposase  41.54 
 
 
495 aa  358  9.999999999999999e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751402  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01103  hypothetical protein  42.25 
 
 
513 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1783  transposase IS66  39.35 
 
 
530 aa  358  9.999999999999999e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2190  transposase IS66  41.09 
 
 
526 aa  358  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183407  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3292  transposase IS66  41.09 
 
 
526 aa  358  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.118311  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>