More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1836 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2627  transposase IS66  99.43 
 
 
529 aa  1097    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1836  transposase IS66  100 
 
 
529 aa  1103    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000394472  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2970  transposase IS66  99.43 
 
 
529 aa  1097    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0501517  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2707  transposase IS66  99.43 
 
 
529 aa  1097    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0584857  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1437  transposase IS66  62.3 
 
 
464 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0515  transposase IS66  44.34 
 
 
511 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.016162  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2281  transposase  42.88 
 
 
527 aa  440  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2203  transposase  44.42 
 
 
530 aa  438  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2211  transposase  44.42 
 
 
530 aa  438  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3056  transposase IS66  46.06 
 
 
529 aa  437  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0704  transposase IS66  43.33 
 
 
523 aa  430  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0762527  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0201  transposase IS66  43.13 
 
 
523 aa  427  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.228467  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2336  transposase IS66  48.07 
 
 
397 aa  397  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0638  transposase IS66  39.55 
 
 
514 aa  349  8e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0610  transposase IS66  39.55 
 
 
514 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3638  transposase IS66  39.48 
 
 
520 aa  330  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3084  transposase IS66  39.48 
 
 
520 aa  330  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.280234  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4114  transposase IS66  39.48 
 
 
520 aa  330  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1988  transposase IS66  39.48 
 
 
520 aa  330  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.317222 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0431  transposase IS66  39.48 
 
 
520 aa  330  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0434  transposase IS66  39.48 
 
 
520 aa  330  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.543739  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1050  transposase IS66  39.48 
 
 
520 aa  330  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1163  transposase IS66  39.48 
 
 
520 aa  330  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230902  normal  0.467895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1548  transposase IS66  39.48 
 
 
520 aa  330  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.446339 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0160  transposase IS66  39.32 
 
 
522 aa  330  4e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328115  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0036  transposase IS66  39.17 
 
 
524 aa  329  8e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2620  transposase IS66  37.33 
 
 
515 aa  325  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0332564  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2650  transposase IS66  37.33 
 
 
515 aa  325  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.956476  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  38.57 
 
 
694 aa  321  1.9999999999999998e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1783  transposase IS66  38.57 
 
 
530 aa  320  3e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1536  transposase IS66  38.57 
 
 
530 aa  320  5e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.881033  normal  0.856435 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0065  putative transposase  36.31 
 
 
526 aa  316  6e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0077  putative ISPpu13, transposase Orf2  36.31 
 
 
526 aa  316  6e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.247033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3736  putative transposase  36.31 
 
 
526 aa  316  6e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1984  transposase IS66  37.9 
 
 
526 aa  313  5.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547689  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2184  transposase IS66  37.9 
 
 
526 aa  313  5.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000882375  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6337  transposase IS66  37.3 
 
 
544 aa  312  9e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0321  transposase IS66  37.9 
 
 
526 aa  312  9e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000571248  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0474  transposase IS66  37.9 
 
 
526 aa  312  9e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.330634 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0656  transposase IS66  37.9 
 
 
526 aa  312  9e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.762551  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0662  transposase IS66  37.9 
 
 
526 aa  312  9e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0971394  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0677  transposase IS66  37.9 
 
 
526 aa  312  9e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607766  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1790  transposase IS66  37.9 
 
 
526 aa  312  9e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0368561  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1976  transposase IS66  37.9 
 
 
526 aa  312  9e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.212724  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2190  transposase IS66  37.9 
 
 
526 aa  312  9e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183407  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3292  transposase IS66  37.9 
 
 
526 aa  312  9e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.118311  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3114  ISPpu13, transposase Orf2  37.01 
 
 
510 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90064  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3985  ISPpu13, transposase Orf2  37.01 
 
 
510 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.757297  hitchhiker  0.00792894 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2630  transposase IS66  37.5 
 
 
526 aa  308  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00176311  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2663  transposase IS66  37.5 
 
 
526 aa  308  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3220  ISPsy5, transposase  36.69 
 
 
503 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.221861  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0637  ISPpu15, transposase Orf2  36.69 
 
 
510 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4025  ISPpu15, transposase Orf2  36.69 
 
 
510 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.358489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4745  ISPpu15, transposase Orf2  36.69 
 
 
510 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.551625  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4091  ISPpu15, transposase Orf2  36.49 
 
 
510 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0162386 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01487  hypothetical protein  36.15 
 
 
517 aa  303  5.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0642  transposase IS66  35.62 
 
 
516 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153379  normal  0.0230063 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0929  transposase IS66  35.62 
 
 
516 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0524356  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01103  hypothetical protein  35.05 
 
 
513 aa  303  7.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01181  hypothetical protein  35.05 
 
 
513 aa  301  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06986  hypothetical protein  38.17 
 
 
522 aa  301  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06965  hypothetical protein  35.05 
 
 
513 aa  301  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4744  transposase IS66  35.6 
 
 
546 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0098  transposase  35.85 
 
 
495 aa  301  3e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2882  transposase  35.85 
 
 
495 aa  300  3e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0069  transposase  35.85 
 
 
495 aa  301  3e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05454  hypothetical protein  37.96 
 
 
510 aa  300  3e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05757  hypothetical protein  38.52 
 
 
521 aa  301  3e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1747  transposase  35.85 
 
 
495 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1656  transposase  35.85 
 
 
495 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.413998  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2163  transposase  35.85 
 
 
495 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.94613  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0270  transposase  35.85 
 
 
495 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0833  transposase  35.85 
 
 
495 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.65936  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2486  transposase  35.85 
 
 
495 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.267041  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2953  transposase  35.85 
 
 
495 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0811  transposase  35.85 
 
 
495 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.973056  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0080  transposase  35.85 
 
 
495 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2114  transposase  35.85 
 
 
495 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1780  transposase  35.85 
 
 
495 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.175929  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0175  transposase  35.85 
 
 
495 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2404  transposase  35.85 
 
 
495 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0389  transposase  35.85 
 
 
495 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.784387  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2684  transposase  35.85 
 
 
495 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0678358  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0470  transposase  35.85 
 
 
495 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0291  transposase  35.85 
 
 
495 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0046  transposase  35.85 
 
 
495 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539045  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1090  transposase  35.85 
 
 
495 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.601639  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2943  transposase  35.85 
 
 
495 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0236  transposase  35.85 
 
 
495 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1576  transposase  35.85 
 
 
495 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1442  transposase  35.85 
 
 
495 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.612647  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1672  transposase  35.85 
 
 
495 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.586592  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2042  transposase  35.85 
 
 
495 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0973  transposase  35.85 
 
 
495 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.255905  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00179  transposase  38.17 
 
 
522 aa  300  4e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0219  transposase  35.85 
 
 
495 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806088  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1018  transposase  35.85 
 
 
495 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0876  transposase  35.85 
 
 
495 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0515  transposase  35.85 
 
 
495 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0991  transposase  35.85 
 
 
495 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>