More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1340 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1340  ISSfl3 OrfC  100 
 
 
285 aa  586  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1086  transposase family  71.18 
 
 
521 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2416  IS66 family transposase  37.37 
 
 
540 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.521306  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3794  putative transposase  37.37 
 
 
540 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1865  transposase IS66  37.37 
 
 
540 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223463  normal  0.192922 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1485  transposase IS66  36.94 
 
 
509 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000322511 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2669  transposase IS66  36.94 
 
 
509 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870521  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1170  transposase IS66  36.94 
 
 
509 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.934596  normal  0.320109 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3322  transposase IS66  36.94 
 
 
509 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2975  transposase IS66  36.94 
 
 
509 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0833  transposase IS66  36.94 
 
 
509 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.423143 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4021  transposase IS66  36.23 
 
 
366 aa  181  8.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6939  transposase IS66  35.79 
 
 
517 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1190  transposase IS66  35.02 
 
 
435 aa  177  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.808109  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1022  transposase IS66  35.02 
 
 
519 aa  177  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1401  transposase IS66  35.02 
 
 
519 aa  177  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2523  transposase IS66  35.02 
 
 
517 aa  177  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297904  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0572  transposase IS66  34.21 
 
 
504 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0648577 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2455  transposase IS66  34.21 
 
 
504 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2916  transposase IS66  34.21 
 
 
504 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397115  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0422  transposase IS66  39.06 
 
 
274 aa  169  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5982  transposase IS66  34.42 
 
 
523 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1170  transposase IS66  33.21 
 
 
507 aa  159  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.438673  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3059  transposase IS66  33.21 
 
 
507 aa  159  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4449  transposase IS66  35.2 
 
 
528 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.543683  normal  0.0438734 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4705  transposase IS66  36.51 
 
 
468 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465239  normal  0.0997646 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4709  transposase IS66  36.51 
 
 
497 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276755  normal  0.140797 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3307  transposase IS66  36.36 
 
 
341 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.448509 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4641  transposase IS66  36.51 
 
 
477 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  33.96 
 
 
523 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  33.96 
 
 
523 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  33.96 
 
 
523 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  33.96 
 
 
523 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  33.96 
 
 
523 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  33.96 
 
 
523 aa  149  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0710  transposase IS66  37.28 
 
 
242 aa  149  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2711  transposase IS66  32.3 
 
 
506 aa  149  7e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8372  transposase IS66  37.31 
 
 
505 aa  149  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4341  transposase IS66  37.31 
 
 
505 aa  149  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6322  transposase IS66  37.31 
 
 
505 aa  149  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  33.96 
 
 
523 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3501  ISPpu14, transposase Orf3  35.09 
 
 
511 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3981  ISPpu14, transposase Orf3  35.09 
 
 
511 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0385183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4439  ISPpu14, transposase Orf3  35.09 
 
 
511 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414491  hitchhiker  0.0000684735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4443  ISPpu14, transposase Orf3  35.09 
 
 
511 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.801949  hitchhiker  0.0000589528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5396  ISPpu14, transposase Orf3  35.09 
 
 
511 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118381  hitchhiker  0.00957485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59580  putative transposase  34.66 
 
 
511 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128729  hitchhiker  1.83127e-18 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0037  transposase IS66  35.09 
 
 
511 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.321823 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5173  transposase IS66  34.7 
 
 
511 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  34.72 
 
 
508 aa  142  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1930  transposase  33.07 
 
 
495 aa  142  5e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.897519  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6513  transposase IS66  32.74 
 
 
521 aa  142  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0611457 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3964  ISPpu14, transposase Orf3  35.71 
 
 
511 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0893475 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1274  transposase IS66  35.27 
 
 
606 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0129566 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2203  transposase  33.69 
 
 
530 aa  140  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2211  transposase  33.69 
 
 
530 aa  140  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3114  ISPpu13, transposase Orf2  34.98 
 
 
510 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90064  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3985  ISPpu13, transposase Orf2  34.98 
 
 
510 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.757297  hitchhiker  0.00792894 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0659  transposase IS66  34.8 
 
 
514 aa  139  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  29.68 
 
 
516 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  34.33 
 
 
510 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4817  transposase IS66  37.29 
 
 
533 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.171914 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  33.46 
 
 
545 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0243  transposase  32.28 
 
 
495 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  33.46 
 
 
545 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  33.46 
 
 
545 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  33.97 
 
 
532 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0335  transposase  32.28 
 
 
495 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.137589  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  33.46 
 
 
545 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  35 
 
 
520 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  33.86 
 
 
545 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1061  transposase  32.28 
 
 
495 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.336401  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1664  transposase  32.28 
 
 
495 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2114  transposase  32.28 
 
 
495 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2042  transposase  32.28 
 
 
495 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1576  transposase  32.28 
 
 
495 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0437  transposase  32.28 
 
 
495 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1442  transposase  32.28 
 
 
495 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.612647  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0291  transposase  32.28 
 
 
495 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1747  transposase  32.28 
 
 
495 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1672  transposase  32.28 
 
 
495 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.586592  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1656  transposase  32.28 
 
 
495 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.413998  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2178  transposase  32.28 
 
 
495 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2250  transposase  32.28 
 
 
495 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751402  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1780  transposase  32.28 
 
 
495 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.175929  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2163  transposase  32.28 
 
 
495 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.94613  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1280  transposase  32.28 
 
 
495 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.653734  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1205  transposase  32.28 
 
 
495 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1417  transposase  32.28 
 
 
495 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2262  transposase  32.28 
 
 
495 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.630405  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0069  transposase  32.28 
 
 
495 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2486  transposase  32.28 
 
 
495 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.267041  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2404  transposase  32.28 
 
 
495 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2598  transposase  32.28 
 
 
495 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2611  transposase  32.28 
 
 
495 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0848316  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2684  transposase  32.28 
 
 
495 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0678358  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2753  transposase  32.28 
 
 
495 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2707  transposase  32.28 
 
 
495 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2264  transposase  32.28 
 
 
495 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.619364  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0080  transposase  32.28 
 
 
495 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>