More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0422 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0422  transposase IS66  100 
 
 
274 aa  553  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6939  transposase IS66  69.03 
 
 
517 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2975  transposase IS66  66.67 
 
 
509 aa  362  4e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3322  transposase IS66  66.67 
 
 
509 aa  362  4e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2669  transposase IS66  66.67 
 
 
509 aa  362  4e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870521  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1485  transposase IS66  66.67 
 
 
509 aa  362  4e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000322511 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0833  transposase IS66  66.67 
 
 
509 aa  362  4e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.423143 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1170  transposase IS66  66.67 
 
 
509 aa  362  4e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.934596  normal  0.320109 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2416  IS66 family transposase  68.15 
 
 
540 aa  361  8e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.521306  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3794  putative transposase  68.15 
 
 
540 aa  361  8e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1865  transposase IS66  68.15 
 
 
540 aa  361  8e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223463  normal  0.192922 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5982  transposase IS66  63.94 
 
 
523 aa  338  4e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1170  transposase IS66  63.74 
 
 
507 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.438673  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3059  transposase IS66  63.74 
 
 
507 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4021  transposase IS66  65.19 
 
 
366 aa  337  9.999999999999999e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1190  transposase IS66  63.7 
 
 
435 aa  333  2e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.808109  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2523  transposase IS66  63.7 
 
 
517 aa  332  4e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297904  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1022  transposase IS66  63.7 
 
 
519 aa  332  4e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1401  transposase IS66  63.7 
 
 
519 aa  332  4e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2711  transposase IS66  61.71 
 
 
506 aa  330  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0710  transposase IS66  64.98 
 
 
242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5173  transposase IS66  59.11 
 
 
511 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3501  ISPpu14, transposase Orf3  60.59 
 
 
511 aa  291  8e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3981  ISPpu14, transposase Orf3  60.59 
 
 
511 aa  291  8e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0385183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4439  ISPpu14, transposase Orf3  60.59 
 
 
511 aa  291  8e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414491  hitchhiker  0.0000684735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4443  ISPpu14, transposase Orf3  66.82 
 
 
511 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.801949  hitchhiker  0.0000589528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5396  ISPpu14, transposase Orf3  66.82 
 
 
511 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118381  hitchhiker  0.00957485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0037  transposase IS66  59.85 
 
 
511 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.321823 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59580  putative transposase  59.48 
 
 
511 aa  288  9e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128729  hitchhiker  1.83127e-18 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3964  ISPpu14, transposase Orf3  65.92 
 
 
511 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0893475 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0572  transposase IS66  57.96 
 
 
504 aa  280  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0648577 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2455  transposase IS66  57.96 
 
 
504 aa  280  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2916  transposase IS66  57.96 
 
 
504 aa  280  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397115  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4705  transposase IS66  44.57 
 
 
468 aa  228  7e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465239  normal  0.0997646 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4709  transposase IS66  44.57 
 
 
497 aa  228  8e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276755  normal  0.140797 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4641  transposase IS66  45.35 
 
 
477 aa  227  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4449  transposase IS66  44.53 
 
 
528 aa  218  7.999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.543683  normal  0.0438734 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  44.94 
 
 
545 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  45.34 
 
 
545 aa  198  9e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  44.94 
 
 
545 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  44.94 
 
 
545 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  44.94 
 
 
545 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  44.94 
 
 
545 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  46.22 
 
 
508 aa  189  5.999999999999999e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  45.49 
 
 
532 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  40.51 
 
 
531 aa  179  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1088  transposase IS66  42.45 
 
 
579 aa  177  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1059  transposase IS66  42.45 
 
 
579 aa  177  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.591253  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4877  transposase IS66  41.33 
 
 
529 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386958  normal  0.659358 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1482  transposase IS66  42.45 
 
 
579 aa  177  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.216681 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1366  transposase IS66  42.45 
 
 
579 aa  177  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0543753 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  41.47 
 
 
523 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  41.47 
 
 
523 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  41.47 
 
 
523 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  41.47 
 
 
523 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  41.47 
 
 
523 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  42.47 
 
 
520 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  41.09 
 
 
523 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  41.09 
 
 
523 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0693  transposase  41.3 
 
 
537 aa  172  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5535  transposase IS66  37.02 
 
 
537 aa  165  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2841  IS66 family element, transposase  37.7 
 
 
512 aa  158  9e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0678669  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0344  IS66 family element, transposase  37.7 
 
 
512 aa  158  9e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000788528  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1183  IS66 family element, transposase  37.7 
 
 
512 aa  158  9e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1812  IS66 family element, transposase  37.7 
 
 
512 aa  158  9e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.438062  hitchhiker  0.000000148464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2224  IS66 family element, transposase  37.7 
 
 
512 aa  158  9e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101822  hitchhiker  0.0000000000417229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4292  IS66 family element, transposase  37.7 
 
 
512 aa  158  9e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1308  IS66 family element, transposase  37.7 
 
 
512 aa  158  9e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.796856 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0118  IS66 family element, transposase  37.7 
 
 
512 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.960295  normal  0.698521 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5043  IS66 family element, transposase  37.7 
 
 
512 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1651  IS66 family element, transposase  37.7 
 
 
512 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1340  ISSfl3 OrfC  39.06 
 
 
285 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1086  transposase family  37.84 
 
 
521 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  38.72 
 
 
512 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1653  IS66 family element, transposase  38.72 
 
 
512 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2636  IS66 family element, transposase  38.72 
 
 
512 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0147268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2601  IS66 family element, transposase  38.72 
 
 
512 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1606  IS66 family element, transposase  38.72 
 
 
438 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000125107  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3413  IS66 family element, transposase  38.72 
 
 
512 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  38.72 
 
 
512 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1584  IS66 family element, transposase  38.72 
 
 
512 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0712  IS66 family element, transposase  38.72 
 
 
512 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2109  IS66 family element, transposase  38.72 
 
 
512 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1866  IS66 family element, transposase  38.72 
 
 
512 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.324382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  38.72 
 
 
512 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2413  IS66 family element, transposase  38.72 
 
 
512 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2711  IS66 family element, transposase  38.72 
 
 
512 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.292603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2618  IS66 family element, transposase  38.72 
 
 
512 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2364  IS66 family element, transposase  38.72 
 
 
512 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  38.72 
 
 
512 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1117  IS66 family element, transposase  38.72 
 
 
512 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  38.72 
 
 
512 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1523  IS66 family element, transposase  38.72 
 
 
512 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0707  IS66 family element, transposase  38.72 
 
 
512 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3448  IS66 family element, transposase  38.72 
 
 
512 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0017  IS66 family element, transposase  38.72 
 
 
512 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3675  IS66 family element, transposase  38.72 
 
 
512 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4625  IS66 family element, transposase  38.72 
 
 
512 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3708  IS66 family element, transposase  38.72 
 
 
512 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00019301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0510  IS66 family element, transposase  38.72 
 
 
512 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>